Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G042700.1
Synonym ATOFP13, OFP13, Sb05g003530
Functional annotation DUF623 domain containing protein, expressed
UniProt C5Y524
Pfam PF04844
Panther DB PTHR33057 PTHR33057:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04820 : ovate family protein 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05770.1 : DUF623 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033534 , Zm00025a012965
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G021500.1
Wheat TraesCS4A02G198600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G004100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10405: kinesin family member C1
3 Sobic.003G099500 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G460800 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.003G167825 - -
6 Sobic.001G493800 expressed protein -
7 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
8 Sobic.007G111600 WRKY89, expressed -
9 Sobic.010G074980 - -
10 Sobic.007G161450 - -
11 Sobic.004G211501 - -
12 Sobic.006G162300 expressed protein -
13 Sobic.007G204500 expressed protein -
14 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
15 Sobic.010G179150 - -
16 Sobic.002G285800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
17 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
18 Sobic.008G119000 cysteine protease, putative, expressed -
19 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.001G520700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G042700 Sobic005G042700 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic005G042700--Sobic007G013100 Sobic002G004100 Sobic002G004100 Sobic005G042700--Sobic002G004100 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic005G042700--Sobic003G099500 Sobic001G460800 Sobic001G460800 Sobic005G042700--Sobic001G460800 Sobic003G167825 Sobic003G167825 Sobic005G042700--Sobic003G167825 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic005G042700--Sobic001G493800 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic005G042700--Sobic009G085600 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic005G042700--Sobic007G111600 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic005G042700--Sobic010G074980 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G013100--Sobic007G116600 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic007G013100--Sobic010G179150 Sobic007G013100--Sobic007G111600 Sobic007G013100--Sobic003G099500 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic007G013100--Sobic004G251350 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic007G013100--Sobic001G016900 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic007G013100--Sobic008G131800 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic007G013100--Sobic003G368150 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic007G013100--Sobic004G016600 Sobic002G004100--Sobic001G016900 Sobic002G004100--Sobic009G085600 Sobic002G004100--Sobic007G111600 Sobic002G004100--Sobic003G167825 Sobic002G004100--Sobic001G460800 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic002G004100--Sobic003G367401 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic002G004100--Sobic004G239000 Sobic002G004100--Sobic003G099500 Sobic002G004100--Sobic004G016600 Sobic003G099500--Sobic004G239000 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic003G099500--Sobic002G387100 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic003G099500--Sobic002G430200 Sobic003G099500--Sobic001G016900 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic003G099500--Sobic007G122300 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic003G099500--Sobic002G284800 Sobic003G099500--Sobic008G131800 Sobic003G099500--Sobic003G368150 Sobic003G099500--Sobic007G111600 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic001G525000 Sobic001G460800--Sobic003G167825 Sobic001G460800--Sobic002G004100 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic001G460800--Sobic002G320900 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic001G460800--Sobic003G120400 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic001G460800--Sobic007G093400 Sobic001G460800--Sobic009G085600 Sobic002G284901 Sobic002G284901 Sobic001G460800--Sobic002G284901 Sobic001G460800--Sobic001G016900 Sobic003G167825--Sobic009G085600 Sobic003G167825--Sobic001G460800 Sobic003G167825--Sobic002G004100 Sobic003G167825--Sobic004G016600 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic003G167825--Sobic008G119000 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic003G038300 Sobic003G167825--Sobic001G016900 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic003G167825--Sobic002G285800 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic003G167825--Sobic003G126400 Sobic001G493800--Sobic010G179150 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic001G493800--Sobic002G156300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic001G493800--Sobic007G001300 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G493800--Sobic001G537900 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic001G493800--Sobic004G197300 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic001G493800--Sobic008G020300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic001G493800--Sobic003G109400 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic001G493800--Sobic010G114400 Sobic004G330400 Sobic004G330400 Sobic001G493800--Sobic004G330400 Sobic009G085600--Sobic003G167825 Sobic009G085600--Sobic008G119000 Sobic009G085600--Sobic002G004100 Sobic009G085600--Sobic004G016600 Sobic009G085600--Sobic007G116600 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic009G085600--Sobic006G180500 Sobic009G085600--Sobic007G111600 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic009G085600--Sobic007G204500 Sobic009G085600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic008G131800 Sobic007G111600--Sobic010G179150 Sobic007G111600--Sobic004G251350 Sobic007G111600--Sobic007G204500 Sobic007G111600--Sobic007G116600 Sobic007G111600--Sobic004G239000 Sobic007G111600--Sobic003G099500 Sobic007G111600--Sobic001G016900 Sobic007G111600--Sobic007G013100 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic010G074980--Sobic010G201000 Sobic010G074980--Sobic007G093400 Sobic004G082151 Sobic004G082151 Sobic010G074980--Sobic004G082151 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic010G074980--Sobic003G427500 Sobic006G065700 Sobic006G065700 Sobic010G074980--Sobic006G065700 Sobic010G074980--Sobic003G120400 Sobic010G074980--Sobic001G525000 Sobic010G074980--Sobic002G320900 Sobic010G074980--Sobic003G367401
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.