Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G057100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQD9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G199200 No apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G094700 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G273400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@OsIAA26 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
4 Sobic.003G141200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K13415: protein brassinosteroid insensitive 1
5 Sobic.005G037850 - -
6 Sobic.001G526500 transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed K17086: transmembrane 9 superfamily member 2/4
7 Sobic.009G081700 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
8 Sobic.001G277600 TKL_IRAK_DUF26-la.5 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
9 Sobic.005G079400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
10 Sobic.010G256400 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G129000 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G326400 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.001G160500 phenylalanine ammonia-lyase, putative, expressed K10775: phenylalanine ammonia-lyase
14 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.004G010050 - -
16 Sobic.001G506500 exostosin family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G048400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
18 Sobic.002G091700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
19 Sobic.005G012600 LTPL10 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G057100 Sobic005G057100 Sobic002G199200 Sobic002G199200 Sobic005G057100--Sobic002G199200 Sobic003G094700 Sobic003G094700 Sobic005G057100--Sobic003G094700 Sobic002G273400 Sobic002G273400 Sobic005G057100--Sobic002G273400 Sobic003G141200 Sobic003G141200 Sobic005G057100--Sobic003G141200 Sobic005G037850 Sobic005G037850 Sobic005G057100--Sobic005G037850 Sobic001G526500 Sobic001G526500 Sobic005G057100--Sobic001G526500 Sobic009G081700 Sobic009G081700 Sobic005G057100--Sobic009G081700 Sobic001G277600 Sobic001G277600 Sobic005G057100--Sobic001G277600 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic005G057100--Sobic005G079400 Sobic002G199200--Sobic003G094700 Sobic010G129000 Sobic010G129000 Sobic002G199200--Sobic010G129000 Sobic001G102000 Sobic001G102000 Sobic002G199200--Sobic001G102000 Sobic002G199200--Sobic009G081700 Sobic002G199200--Sobic002G273400 Sobic001G348200 Sobic001G348200 Sobic002G199200--Sobic001G348200 Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic002G199200--Sobic003G240500 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Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic009G106100
Octagon: transcription factors


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