Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G526500.1
Synonym Sb01g049000
Functional annotation transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed
UniProt C5X0V7
Pfam PF02990
Panther DB PTHR10766 PTHR10766:SF50
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17086; transmembrane 9 superfamily member 2/4
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G35160 : Endomembrane protein 70 protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g19160.1 : transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000313
Brachypodium KQK01166
Barley HORVU2Hr1G110720.3 , HORVU2Hr1G110720.2 , HORVU2Hr1G110720.1 , HORVU6Hr1G085870.2 , HORVU6Hr1G085870.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G110511 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G526500 Sobic001G526500 Sobic008G055700 Sobic008G055700 Sobic001G526500--Sobic008G055700 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic001G526500--Sobic009G106100 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic001G526500--Sobic005G110508 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic001G526500--Sobic003G083800 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic001G526500--Sobic005G079400 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic001G526500--Sobic006G092100 Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic001G526500--Sobic003G240500 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic001G526500--Sobic008G138700 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic001G526500--Sobic005G110514 Sobic008G055700--Sobic006G092100 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic008G055700--Sobic002G029500 Sobic008G055700--Sobic008G138700 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic008G055700--Sobic007G064900 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic008G055700--Sobic005G110511 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic008G055700--Sobic005G182900 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic008G055700--Sobic002G019000 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic008G055700--Sobic010G242800 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic008G055700--Sobic008G033100 Sobic009G106100--Sobic003G083800 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic010G152500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic009G106100--Sobic004G009200 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic009G106100--Sobic003G382200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic005G106300 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic009G106100--Sobic007G111800 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic002G391900 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G216600 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic009G106100--Sobic005G197400 Sobic005G110508--Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110508--Sobic005G066500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic004G312500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066300 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110508--Sobic005G066366 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110508--Sobic005G071900 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic002G411000 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G079400 Sobic003G083800--Sobic009G106100 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic003G083800--Sobic007G015100 Sobic003G083800--Sobic010G152500 Sobic003G083800--Sobic002G029500 Sobic003G083800--Sobic004G009200 Sobic003G083800--Sobic005G106300 Sobic003G083800--Sobic007G111800 Sobic003G083800--Sobic005G182900 Sobic003G083800--Sobic010G242800 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic006G092100--Sobic010G213600 Sobic010G152300 Sobic010G152300 Sobic006G092100--Sobic010G152300 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic006G092100--Sobic001G293100 Sobic006G092100--Sobic008G033100 Sobic006G092100--Sobic008G138700 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic006G092100--Sobic005G097900 Sobic006G092100--Sobic005G182900 Sobic006G092100--Sobic002G029500 Sobic006G092100--Sobic002G019000 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic003G240500--Sobic010G082100 Sobic007G007300 Sobic007G007300 Sobic003G240500--Sobic007G007300 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G240500--Sobic006G266800 Sobic003G240500--Sobic005G110514 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic003G240500--Sobic004G308500 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic003G240500--Sobic004G322000 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic003G240500--Sobic001G506500 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic003G240500--Sobic002G166150 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic003G240500--Sobic001G506700 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic008G138700--Sobic006G009700 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic005G066500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G110511 Sobic008G138700--Sobic005G071900 Sobic008G138700--Sobic004G312500 Sobic008G138700--Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic010G213600 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic005G110514--Sobic004G003100 Sobic005G110514--Sobic004G308500 Sobic009G233100 Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G233100 Sobic005G110514--Sobic009G106100 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic005G110514--Sobic003G007400 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic005G110514--Sobic007G186500 Sobic001G506800 Sobic001G506800 Sobic005G110514--Sobic001G506800 Sobic005G110514--Sobic005G216600 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic005G110514--Sobic004G121600
Octagon: transcription factors


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