Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G077750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G180700 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
2 Sobic.009G111301 - -
3 Sobic.006G199400 expressed protein -
4 Sobic.002G344201 - -
5 Sobic.010G035100 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G258500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
7 Sobic.002G346800 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G019550 - -
9 Sobic.007G125800 expressed protein -
10 Sobic.010G237400 ZmEBE-1 protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G346700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.003G231000 SbDFR2 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
13 Sobic.005G189500 expressed protein -
14 Sobic.009G059800 lysine-rich arabinogalactan protein 19 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G313800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G059932 - -
17 Sobic.004G056500 - -
18 Sobic.002G102800 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
19 Sobic.003G369800 - -
20 Sobic.009G059866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G077750 Sobic005G077750 Sobic009G180700 Sobic009G180700 Sobic005G077750--Sobic009G180700 Sobic009G111301 Sobic009G111301 Sobic005G077750--Sobic009G111301 Sobic006G199400 Sobic006G199400 Sobic005G077750--Sobic006G199400 Sobic002G344201 Sobic002G344201 Sobic005G077750--Sobic002G344201 Sobic010G035100 Sobic010G035100 Sobic005G077750--Sobic010G035100 Sobic002G258500 Sobic002G258500 Sobic005G077750--Sobic002G258500 Sobic002G346800 Sobic002G346800 Sobic005G077750--Sobic002G346800 Sobic009G019550 Sobic009G019550 Sobic005G077750--Sobic009G019550 Sobic007G125800 Sobic007G125800 Sobic005G077750--Sobic007G125800 Sobic009G180700--Sobic005G077750 Sobic009G180700--Sobic002G258500 Sobic009G180700--Sobic009G111301 Sobic009G180700--Sobic010G035100 Sobic009G180700--Sobic009G019550 Sobic009G180700--Sobic007G125800 Sobic002G346700 Sobic002G346700 Sobic009G180700--Sobic002G346700 Sobic004G316000 Sobic004G316000 Sobic009G180700--Sobic004G316000 Sobic009G180700--Sobic002G346800 Sobic009G111301--Sobic002G258500 Sobic003G231000 Sobic003G231000 Sobic009G111301--Sobic003G231000 Sobic009G111301--Sobic010G035100 Sobic009G111301--Sobic002G346700 Sobic002G066350 Sobic002G066350 Sobic009G111301--Sobic002G066350 Sobic007G036200 Sobic007G036200 Sobic009G111301--Sobic007G036200 Sobic002G023500 Sobic002G023500 Sobic009G111301--Sobic002G023500 Sobic009G111301--Sobic005G077750 Sobic010G130900 Sobic010G130900 Sobic009G111301--Sobic010G130900 Sobic006G199400--Sobic005G077750 Sobic006G199400--Sobic009G111301 Sobic006G199400--Sobic009G180700 Sobic006G199400--Sobic002G346800 Sobic006G199400--Sobic002G344201 Sobic006G199400--Sobic002G258500 Sobic006G199400--Sobic010G035100 Sobic001G095366 Sobic001G095366 Sobic006G199400--Sobic001G095366 Sobic006G156200 Sobic006G156200 Sobic006G199400--Sobic006G156200 Sobic009G059800 Sobic009G059800 Sobic002G344201--Sobic009G059800 Sobic004G277700 Sobic004G277700 Sobic002G344201--Sobic004G277700 Sobic004G254300 Sobic004G254300 Sobic002G344201--Sobic004G254300 Sobic009G059932 Sobic009G059932 Sobic002G344201--Sobic009G059932 Sobic007G218400 Sobic007G218400 Sobic002G344201--Sobic007G218400 Sobic010G237400 Sobic010G237400 Sobic002G344201--Sobic010G237400 Sobic001G456000 Sobic001G456000 Sobic002G344201--Sobic001G456000 Sobic009G059866 Sobic009G059866 Sobic002G344201--Sobic009G059866 Sobic004G056500 Sobic004G056500 Sobic002G344201--Sobic004G056500 Sobic010G035100--Sobic002G258500 Sobic010G035100--Sobic002G346700 Sobic006G006400 Sobic006G006400 Sobic010G035100--Sobic006G006400 Sobic010G035100--Sobic004G316000 Sobic010G035100--Sobic009G019550 Sobic010G035100--Sobic002G023500 Sobic006G239600 Sobic006G239600 Sobic010G035100--Sobic006G239600 Sobic001G123650 Sobic001G123650 Sobic010G035100--Sobic001G123650 Sobic002G258500--Sobic004G316000 Sobic002G258500--Sobic002G023500 Sobic002G258500--Sobic010G130900 Sobic002G258500--Sobic002G346700 Sobic007G014300 Sobic007G014300 Sobic002G258500--Sobic007G014300 Sobic002G258500--Sobic001G123650 Sobic001G274100 Sobic001G274100 Sobic002G346800--Sobic001G274100 Sobic002G346800--Sobic009G180700 Sobic002G346800--Sobic005G077750 Sobic002G346800--Sobic002G258500 Sobic002G346800--Sobic009G111301 Sobic002G346800--Sobic010G035100 Sobic003G369800 Sobic003G369800 Sobic002G346800--Sobic003G369800 Sobic002G346800--Sobic002G344201 Sobic002G346800--Sobic010G237400 Sobic009G019550--Sobic010G237400 Sobic009G019550--Sobic003G369800 Sobic009G019550--Sobic002G346700 Sobic009G019550--Sobic004G316000 Sobic009G019550--Sobic004G056500 Sobic002G102800 Sobic002G102800 Sobic009G019550--Sobic002G102800 Sobic010G144600 Sobic010G144600 Sobic009G019550--Sobic010G144600 Sobic009G019550--Sobic009G059800 Sobic009G019550--Sobic002G258500 Sobic004G015000 Sobic004G015000 Sobic007G125800--Sobic004G015000 Sobic005G189500 Sobic005G189500 Sobic007G125800--Sobic005G189500 Sobic007G048300 Sobic007G048300 Sobic007G125800--Sobic007G048300 Sobic007G125800--Sobic009G019550 Sobic007G125800--Sobic002G346700 Sobic007G125800--Sobic010G035100 Sobic007G125800--Sobic002G258500 Sobic003G020700 Sobic003G020700 Sobic007G125800--Sobic003G020700 Sobic007G125800--Sobic004G316000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.