Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G344201.2,Sobic.002G344201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6X1 , A0A1W0W705
Pfam PF13365
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G059800 lysine-rich arabinogalactan protein 19 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G277700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G254300 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G059932 - -
5 Sobic.007G218400 - -
6 Sobic.010G237400 ZmEBE-1 protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G456000 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G059866 - -
9 Sobic.004G056500 - -
10 Sobic.002G102800 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
11 Sobic.002G268300 3-ketoacyl-CoA synthase precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G369800 - -
13 Sobic.010G169200 homeobox domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G313800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G231000 SbDFR2 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
16 Sobic.010G220800 zinc-binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G238800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.010G144600 - -
19 Sobic.001G106500 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
20 Sobic.001G459300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G344201 Sobic002G344201 Sobic009G059800 Sobic009G059800 Sobic002G344201--Sobic009G059800 Sobic004G277700 Sobic004G277700 Sobic002G344201--Sobic004G277700 Sobic004G254300 Sobic004G254300 Sobic002G344201--Sobic004G254300 Sobic009G059932 Sobic009G059932 Sobic002G344201--Sobic009G059932 Sobic007G218400 Sobic007G218400 Sobic002G344201--Sobic007G218400 Sobic010G237400 Sobic010G237400 Sobic002G344201--Sobic010G237400 Sobic001G456000 Sobic001G456000 Sobic002G344201--Sobic001G456000 Sobic009G059866 Sobic009G059866 Sobic002G344201--Sobic009G059866 Sobic004G056500 Sobic004G056500 Sobic002G344201--Sobic004G056500 Sobic009G059800--Sobic009G059932 Sobic009G059800--Sobic010G237400 Sobic009G059800--Sobic009G059866 Sobic009G059800--Sobic007G218400 Sobic002G102800 Sobic002G102800 Sobic009G059800--Sobic002G102800 Sobic009G059800--Sobic004G056500 Sobic003G369800 Sobic003G369800 Sobic009G059800--Sobic003G369800 Sobic010G144600 Sobic010G144600 Sobic009G059800--Sobic010G144600 Sobic009G059800--Sobic004G254300 Sobic004G277700--Sobic009G059800 Sobic004G086500 Sobic004G086500 Sobic004G277700--Sobic004G086500 Sobic004G277700--Sobic002G344201 Sobic004G277700--Sobic009G059932 Sobic004G277700--Sobic007G218400 Sobic004G277700--Sobic010G237400 Sobic004G277700--Sobic001G456000 Sobic004G277700--Sobic004G254300 Sobic004G277700--Sobic004G056500 Sobic004G254300--Sobic009G059866 Sobic004G254300--Sobic009G059932 Sobic004G254300--Sobic007G218400 Sobic004G254300--Sobic004G056500 Sobic004G254300--Sobic002G102800 Sobic004G254300--Sobic009G059800 Sobic004G254300--Sobic010G237400 Sobic004G254300--Sobic003G369800 Sobic004G254300--Sobic010G144600 Sobic009G059932--Sobic009G059866 Sobic009G059932--Sobic002G102800 Sobic009G059932--Sobic004G056500 Sobic009G059932--Sobic009G059800 Sobic009G059932--Sobic007G218400 Sobic009G059932--Sobic010G237400 Sobic009G059932--Sobic010G144600 Sobic009G059932--Sobic003G369800 Sobic009G059932--Sobic004G254300 Sobic007G218400--Sobic009G059932 Sobic007G218400--Sobic009G059866 Sobic007G218400--Sobic009G059800 Sobic007G218400--Sobic002G102800 Sobic007G218400--Sobic004G056500 Sobic007G218400--Sobic010G237400 Sobic007G218400--Sobic010G144600 Sobic007G218400--Sobic003G369800 Sobic007G218400--Sobic004G254300 Sobic010G237400--Sobic003G369800 Sobic010G237400--Sobic009G059800 Sobic010G237400--Sobic009G059932 Sobic010G237400--Sobic002G102800 Sobic010G237400--Sobic009G059866 Sobic010G237400--Sobic007G218400 Sobic010G237400--Sobic004G056500 Sobic010G237400--Sobic010G144600 Sobic003G175300 Sobic003G175300 Sobic010G237400--Sobic003G175300 Sobic002G078900 Sobic002G078900 Sobic001G456000--Sobic002G078900 Sobic010G183800 Sobic010G183800 Sobic001G456000--Sobic010G183800 Sobic001G459300 Sobic001G459300 Sobic001G456000--Sobic001G459300 Sobic010G048600 Sobic010G048600 Sobic001G456000--Sobic010G048600 Sobic001G459400 Sobic001G459400 Sobic001G456000--Sobic001G459400 Sobic001G106500 Sobic001G106500 Sobic001G456000--Sobic001G106500 Sobic005G070700 Sobic005G070700 Sobic001G456000--Sobic005G070700 Sobic003G243100 Sobic003G243100 Sobic001G456000--Sobic003G243100 Sobic001G456000--Sobic004G277700 Sobic009G059866--Sobic009G059932 Sobic009G059866--Sobic002G102800 Sobic009G059866--Sobic004G056500 Sobic009G059866--Sobic007G218400 Sobic009G059866--Sobic009G059800 Sobic009G059866--Sobic010G144600 Sobic009G059866--Sobic010G237400 Sobic009G059866--Sobic003G369800 Sobic003G175700 Sobic003G175700 Sobic009G059866--Sobic003G175700 Sobic004G056500--Sobic002G102800 Sobic004G056500--Sobic009G059932 Sobic004G056500--Sobic009G059866 Sobic004G056500--Sobic010G144600 Sobic004G056500--Sobic009G059800 Sobic002G023500 Sobic002G023500 Sobic004G056500--Sobic002G023500 Sobic004G056500--Sobic007G218400 Sobic004G056500--Sobic003G175700 Sobic004G056500--Sobic010G237400
Octagon: transcription factors


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