Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G085000.1
Synonym AWI31, Sb05g006930, VEP1
Functional annotation Expressed in older stem (PubMedID : 28649278)
NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed
UniProt C5Y7R9
Pfam -
Panther DB PTHR32487 PTHR32487:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24220 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g32170.1 : NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002977 , Zm00025a002976 , Zm00025a002975
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G007340.1 , HORVU0Hr1G007340.2 , HORVU0Hr1G007340.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G085000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.001G285100 expressed protein -
3 Sobic.001G245100 - -
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11 Sobic.010G105900 - -
12 Sobic.002G076300 - -
13 Sobic.002G046150 - -
14 Sobic.006G255200 - -
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16 Sobic.002G197500 2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase domain containing protein, expressed K00627: DLAT, aceF, pyruvate dehydrogenase E2 component (dihydrolipoamide acetyltransferase)
17 Sobic.003G262500 OsPOP3 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
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19 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G115266 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G085000 Sobic005G085000 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic005G085000--Sobic003G433000 Sobic001G285100 Sobic001G285100 Sobic005G085000--Sobic001G285100 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic005G085000--Sobic001G245100 Sobic005G165032 Sobic005G165032 Sobic005G085000--Sobic005G165032 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic005G085000--Sobic002G377501 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic005G085000--Sobic003G069601 Sobic008G137200 Sobic008G137200 Sobic005G085000--Sobic008G137200 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic005G085000--Sobic001G261452 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic005G085000--Sobic002G181500 Sobic004G267650 Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic003G069601 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G433000--Sobic008G046700 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic003G433000--Sobic006G280250 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic003G433000--Sobic001G174100 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic003G433000--Sobic002G046150 Sobic002G374000 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Octagon: transcription factors


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