Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110562.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A120GUQ6
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03360 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g36220.1 : OsFBX198 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT63968 , KQJ89023
Barley -
Wheat TraesCS6D02G067100 , TraesCS6B02G093600 , TraesCS6B02G093600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G248300 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed K10418: dynein light chain LC8-type
2 Sobic.009G258000 S-locus lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G017600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@no apical meristem protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G221601 - -
5 Sobic.003G409500 - -
6 Sobic.007G043750 - -
7 Sobic.002G109900 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
8 Sobic.001G088000 expressed protein -
9 Sobic.003G432400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G053001 - -
11 Sobic.001G184950 - -
12 Sobic.001G035700 - -
13 Sobic.008G179400 expressed protein -
14 Sobic.009G124100 - -
15 Sobic.004G175800 chalcone synthase, putative, expressed -
16 Sobic.001G444200 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.010G172633 - -
18 Sobic.001G022200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
20 Sobic.003G394150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110562 Sobic005G110562 Sobic004G248300 Sobic004G248300 Sobic005G110562--Sobic004G248300 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic005G110562--Sobic009G258000 Sobic008G017600 Sobic008G017600 Sobic005G110562--Sobic008G017600 Sobic001G221601 Sobic001G221601 Sobic005G110562--Sobic001G221601 Sobic003G409500 Sobic003G409500 Sobic005G110562--Sobic003G409500 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic005G110562--Sobic007G043750 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic005G110562--Sobic002G109900 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic005G110562--Sobic001G088000 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic005G110562--Sobic003G432400 Sobic001G022200 Sobic001G022200 Sobic004G248300--Sobic001G022200 Sobic004G248300--Sobic003G409500 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic004G248300--Sobic005G100500 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic004G248300--Sobic006G108500 Sobic002G294300 Sobic002G294300 Sobic004G248300--Sobic002G294300 Sobic001G088400 Sobic001G088400 Sobic004G248300--Sobic001G088400 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Octagon: transcription factors


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