Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G003200.1
Synonym Sb06g000490
Functional annotation peroxidase precursor, putative, expressed
UniProt C5YBA0
Pfam PF00141
Panther DB PTHR31235 PTHR31235:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00430; peroxidase
Gene Ontology GO:0006979; response to oxidative stress GO:0004601peroxidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26010 : Peroxidase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01550.1 : peroxidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029627 , Zm00025a044843
Brachypodium KQK21231 , KQJ85534
Barley HORVU2Hr1G127480.1 , HORVU2Hr1G127650.3 , HORVU2Hr1G127650.2
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G154700 regulatory protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G095800 DUF623 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G079900 endoglucanase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G106500 PMR5, putative, expressed -
5 Sobic.008G014700 domain of unknown function, DUF250 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G272600 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
7 Sobic.003G083600 DNA binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G342000 expressed protein -
9 Sobic.005G095500 protein kinase domain containing protein, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
10 Sobic.002G029500 cytochrome P450 84A1, putative, expressed K09755: CYP84A, ferulate-5-hydroxylase
11 Sobic.003G255600 expressed protein -
12 Sobic.006G108300 expressed protein -
13 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
14 Sobic.007G154100 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G106300 expressed protein -
16 Sobic.003G083800 DNA binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G097900 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
18 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
19 Sobic.002G166150 - -
20 Sobic.007G111800 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G003200 Sobic006G003200 Sobic002G154700 Sobic002G154700 Sobic006G003200--Sobic002G154700 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic006G003200--Sobic009G095800 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic006G003200--Sobic009G079900 Sobic009G106500 Sobic009G106500 Sobic006G003200--Sobic009G106500 Sobic008G014700 Sobic008G014700 Sobic006G003200--Sobic008G014700 Sobic001G272600 Sobic001G272600 Sobic006G003200--Sobic001G272600 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic006G003200--Sobic003G083600 Sobic001G342000 Sobic001G342000 Sobic006G003200--Sobic001G342000 Sobic005G095500 Sobic005G095500 Sobic006G003200--Sobic005G095500 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic002G154700--Sobic002G029500 Sobic002G082000 Sobic002G082000 Sobic002G154700--Sobic002G082000 Sobic002G154700--Sobic009G106500 Sobic008G058600 Sobic008G058600 Sobic002G154700--Sobic008G058600 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic002G154700--Sobic005G134200 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic002G154700--Sobic002G289500 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic002G154700--Sobic005G106300 Sobic002G154700--Sobic001G342000 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic002G154700--Sobic006G047200 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic009G095800--Sobic010G268700 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic009G095800--Sobic007G015000 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic009G095800--Sobic007G111800 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic009G095800--Sobic007G212000 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic009G095800--Sobic003G007400 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic009G095800--Sobic005G216600 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic009G095800--Sobic001G293100 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic009G095800--Sobic003G161400 Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic009G095800--Sobic003G255600 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic009G079900--Sobic009G060700 Sobic007G020700 Sobic007G020700 Sobic009G079900--Sobic007G020700 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic009G079900--Sobic005G052700 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic009G079900--Sobic002G029600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic009G079900--Sobic003G079100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic009G079900--Sobic010G213600 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic009G079900--Sobic004G008600 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic009G079900--Sobic001G274400 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic009G079900--Sobic006G009700 Sobic009G106500--Sobic002G289500 Sobic009G106500--Sobic003G255600 Sobic009G106500--Sobic006G047200 Sobic009G106500--Sobic008G058600 Sobic009G106500--Sobic002G082000 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic009G106500--Sobic006G230100 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic009G106500--Sobic006G171100 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic009G106500--Sobic001G153100 Sobic009G106500--Sobic002G029500 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic008G014700--Sobic010G242800 Sobic008G014700--Sobic002G029500 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic008G014700--Sobic005G110511 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic008G014700--Sobic007G064900 Sobic008G014700--Sobic001G293100 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic008G014700--Sobic005G182900 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic008G014700--Sobic005G097900 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic008G014700--Sobic008G033100 Sobic008G014700--Sobic007G015000 Sobic001G272600--Sobic010G242800 Sobic001G272600--Sobic008G033100 Sobic001G272600--Sobic005G182900 Sobic001G272600--Sobic003G161400 Sobic001G272600--Sobic010G213600 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic001G272600--Sobic005G065700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic001G272600--Sobic002G019000 Sobic001G272600--Sobic005G110511 Sobic001G272600--Sobic001G293100 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic003G083600--Sobic005G231300 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic003G083600--Sobic001G514300 Sobic003G083600--Sobic009G079900 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic003G083600--Sobic008G099100 Sobic003G083600--Sobic002G029600 Sobic001G169400 Sobic001G169400 Sobic003G083600--Sobic001G169400 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic003G083600--Sobic003G382200 Sobic003G083600--Sobic001G274400 Sobic003G083600--Sobic008G014700 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic001G342000--Sobic004G014600 Sobic001G342000--Sobic010G213600 Sobic001G342000--Sobic008G033100 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic001G342000--Sobic002G166150 Sobic001G342000--Sobic002G029500 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic001G342000--Sobic009G165100 Sobic001G342000--Sobic003G079100 Sobic001G272800 Sobic001G272800 Sobic001G342000--Sobic001G272800 Sobic001G342000--Sobic003G255600 Sobic003G045650 Sobic003G045650 Sobic005G095500--Sobic003G045650 Sobic005G095500--Sobic008G058600 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic005G095500--Sobic003G083800 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic005G095500--Sobic004G299500 Sobic005G095500--Sobic007G111800 Sobic005G095500--Sobic007G015000 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic005G095500--Sobic006G121000 Sobic005G095500--Sobic005G097900 Sobic006G229901 Sobic006G229901 Sobic005G095500--Sobic006G229901
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.