Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G063200.2
Synonym Sb06g015080
Functional annotation protein binding protein, putative, expressed
UniProt C5YFF2
Pfam -
Panther DB PTHR10044 PTHR10044:SF135
NCBI CDD KOG1100; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K19042; E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12920 : SBP (S-ribonuclease binding protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32980.1 : protein binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055976 , Zm00025a055972 , Zm00025a011607 , Zm00025a011599
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G306500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G170300 RING-H2 finger protein, putative, expressed K19040: E3 ubiquitin-protein ligase ATL10/75/76/77/78
2 Sobic.008G167401 - -
3 Sobic.003G058001 - -
4 Sobic.009G082800 - -
5 Sobic.010G069300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
6 Sobic.008G030200 LTPL9 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.002G176300 RING finger protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G465000 - -
9 Sobic.007G037800 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.010G157000 - -
11 Sobic.004G182700 OsFBK8 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
12 Sobic.009G174866 - -
13 Sobic.003G346800 hypothetical protein -
14 Sobic.005G167500 resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G180800 - -
16 Sobic.001G299400 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.008G080600 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
18 Sobic.002G176500 receptor-like protein kinase 2, putative, expressed -
19 Sobic.004G179500 APO, putative, expressed -
20 Sobic.008G036300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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