Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G167401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R754
Pfam -
Panther DB PTHR34193 PTHR34193:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09350.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G095900 - -
2 Sobic.006G063200 protein binding protein, putative, expressed K19042: E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
3 Sobic.003G116850 - -
4 Sobic.006G093700 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G082800 - -
6 Sobic.004G303500 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed -
7 Sobic.002G176300 RING finger protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G172800 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
9 Sobic.010G157000 - -
10 Sobic.002G348850 - -
11 Sobic.010G263500 expressed protein -
12 Sobic.001G465000 - -
13 Sobic.007G199901 - -
14 Sobic.005G156900 - -
15 Sobic.010G276301 - -
16 Sobic.007G049700 - -
17 Sobic.006G200650 - -
18 Sobic.003G325100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G102600 - -
20 Sobic.010G102700 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G167401 Sobic008G167401 Sobic001G095900 Sobic001G095900 Sobic008G167401--Sobic001G095900 Sobic006G063200 Sobic006G063200 Sobic008G167401--Sobic006G063200 Sobic003G116850 Sobic003G116850 Sobic008G167401--Sobic003G116850 Sobic006G093700 Sobic006G093700 Sobic008G167401--Sobic006G093700 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic008G167401--Sobic009G082800 Sobic004G303500 Sobic004G303500 Sobic008G167401--Sobic004G303500 Sobic002G176300 Sobic002G176300 Sobic008G167401--Sobic002G176300 Sobic003G172800 Sobic003G172800 Sobic008G167401--Sobic003G172800 Sobic010G157000 Sobic010G157000 Sobic008G167401--Sobic010G157000 Sobic010G276301 Sobic010G276301 Sobic001G095900--Sobic010G276301 Sobic002G079200 Sobic002G079200 Sobic001G095900--Sobic002G079200 Sobic010G162500 Sobic010G162500 Sobic001G095900--Sobic010G162500 Sobic005G156900 Sobic005G156900 Sobic001G095900--Sobic005G156900 Sobic006G190150 Sobic006G190150 Sobic001G095900--Sobic006G190150 Sobic007G189300 Sobic007G189300 Sobic001G095900--Sobic007G189300 Sobic001G095900--Sobic008G167401 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic001G095900--Sobic002G288800 Sobic010G006300 Sobic010G006300 Sobic001G095900--Sobic010G006300 Sobic004G170300 Sobic004G170300 Sobic006G063200--Sobic004G170300 Sobic006G063200--Sobic008G167401 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic006G063200--Sobic003G058001 Sobic006G063200--Sobic009G082800 Sobic010G069300 Sobic010G069300 Sobic006G063200--Sobic010G069300 Sobic008G030200 Sobic008G030200 Sobic006G063200--Sobic008G030200 Sobic006G063200--Sobic002G176300 Sobic001G465000 Sobic001G465000 Sobic006G063200--Sobic001G465000 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic006G063200--Sobic007G037800 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic003G116850--Sobic009G106601 Sobic004G023600 Sobic004G023600 Sobic003G116850--Sobic004G023600 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic003G116850--Sobic002G033550 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic003G116850--Sobic002G000900 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic003G116850--Sobic006G174050 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic003G116850--Sobic001G217850 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic003G116850--Sobic001G137900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic003G116850--Sobic009G170050 Sobic009G095200 Sobic009G095200 Sobic003G116850--Sobic009G095200 Sobic010G238000 Sobic010G238000 Sobic006G093700--Sobic010G238000 Sobic003G325100 Sobic003G325100 Sobic006G093700--Sobic003G325100 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic006G093700--Sobic004G065950 Sobic004G269300 Sobic004G269300 Sobic006G093700--Sobic004G269300 Sobic006G093700--Sobic010G276301 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic006G093700--Sobic008G068700 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic006G093700--Sobic004G201000 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic006G093700--Sobic010G155401 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic006G093700--Sobic004G290850 Sobic002G064200 Sobic002G064200 Sobic009G082800--Sobic002G064200 Sobic009G082800--Sobic004G303500 Sobic010G172300 Sobic010G172300 Sobic009G082800--Sobic010G172300 Sobic009G115300 Sobic009G115300 Sobic009G082800--Sobic009G115300 Sobic010G225500 Sobic010G225500 Sobic009G082800--Sobic010G225500 Sobic010G046900 Sobic010G046900 Sobic009G082800--Sobic010G046900 Sobic002G202700 Sobic002G202700 Sobic009G082800--Sobic002G202700 Sobic008G095100 Sobic008G095100 Sobic009G082800--Sobic008G095100 Sobic002G173900 Sobic002G173900 Sobic009G082800--Sobic002G173900 Sobic004G303500--Sobic003G172800 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic004G303500--Sobic001G261444 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic004G303500--Sobic004G126050 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic004G303500--Sobic003G161900 SobicK032200 SobicK032200 Sobic004G303500--SobicK032200 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic004G303500--Sobic007G183200 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic004G303500--Sobic010G201332 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic004G303500--Sobic004G115100 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic004G303500--Sobic001G383350 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic002G176300--Sobic007G085400 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic002G176300--Sobic001G420150 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic002G176300--Sobic001G093400 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic002G176300--Sobic007G116300 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic002G176300--Sobic004G276600 Sobic008G086700 Sobic008G086700 Sobic002G176300--Sobic008G086700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic002G176300--Sobic004G134400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G176300--Sobic004G274300 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic002G176300--Sobic001G255866 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic003G172800--Sobic010G039150 Sobic001G506200 Sobic001G506200 Sobic003G172800--Sobic001G506200 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic003G172800--Sobic003G053100 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic003G172800--Sobic006G029850 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172800--Sobic005G139900 Sobic003G172800--Sobic001G261444 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G172800--Sobic004G303433 Sobic003G172800--Sobic010G201332 Sobic003G172800--Sobic001G383350 Sobic010G157000--Sobic003G058001 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic010G157000--Sobic005G065500 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic010G157000--Sobic005G167500 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic010G157000--Sobic004G210601 Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic010G157000--Sobic002G195300 Sobic010G038500 Sobic010G038500 Sobic010G157000--Sobic010G038500 Sobic005G217900 Sobic005G217900 Sobic010G157000--Sobic005G217900 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic010G157000--Sobic010G100200 Sobic001G098600 Sobic001G098600 Sobic010G157000--Sobic001G098600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.