Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G174866.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R347
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G353100 OsSCP12 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
2 Sobic.008G183150 - -
3 Sobic.002G176500 receptor-like protein kinase 2, putative, expressed -
4 Sobic.006G103500 - -
5 Sobic.009G250700 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
6 Sobic.007G226400 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.008G142400 cycloartenol synthase, putative, expressed -
8 Sobic.001G531800 dihydrodipicolinate reductase, putative, expressed K16908: chloroplast NAD(P)H dehydrogenase
9 Sobic.003G116850 - -
10 Sobic.005G107400 POT family protein, expressed -
11 Sobic.007G088600 expressed protein -
12 Sobic.002G357300 expressed protein -
13 Sobic.006G207700 containing DUF163, putative, expressed K00783: 23S rRNA (pseudouridine1915-N3)-methyltransferase
14 Sobic.001G465000 - -
15 Sobic.009G210800 expressed protein -
16 Sobic.006G233900 biotin--protein ligase, putative, expressed -
17 Sobic.010G184400 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
18 Sobic.002G176300 RING finger protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G017100 oligopeptide transporter, putative, expressed -
20 Sobic.004G138650 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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