Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G226400.1
Synonym Sb07g029130
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5YJR0
Pfam PF13812 PF12854 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF522
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02750 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g37520.2 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033707
Brachypodium PNT68313 , KQJ98721
Barley HORVU3Hr1G067580.1 , HORVU3Hr1G067580.6 , HORVU3Hr1G067580.5 , HORVU3Hr1G067580.4
Wheat TraesCS3A02G248100 , TraesCS3B02G276800 , TraesCS3D02G248100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G226400 Sobic007G226400 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic007G226400--Sobic010G172633 Sobic004G039800 Sobic004G039800 Sobic007G226400--Sobic004G039800 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic007G226400--Sobic001G143850 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic007G226400--Sobic001G035700 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic007G226400--Sobic001G505066 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic007G226400--Sobic001G315300 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic007G226400--Sobic002G395400 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic007G226400--Sobic003G394150 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic007G226400--Sobic002G204700 Sobic010G172633--Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G035700 Sobic010G172633--Sobic001G505066 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic001G184950 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic010G172633--Sobic009G147450 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic010G172633--Sobic003G147800 Sobic003G132200 Sobic003G132200 Sobic010G172633--Sobic003G132200 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G172633--Sobic002G109900 Sobic004G039800--Sobic002G109900 Sobic004G039800--Sobic001G315300 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic004G039800--Sobic010G157600 Sobic003G023901 Sobic003G023901 Sobic004G039800--Sobic003G023901 Sobic004G039800--Sobic001G184950 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic004G039800--Sobic002G286500 Sobic007G223801 Sobic007G223801 Sobic004G039800--Sobic007G223801 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic004G039800--Sobic001G074900 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic004G039800--Sobic009G258000 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500 Sobic001G035700--Sobic010G172633 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic001G035700--Sobic009G124100 Sobic001G035700--Sobic001G505066 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic001G035700--Sobic001G488800 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G035700--Sobic004G104250 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic001G035700--Sobic002G310400 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic001G035700--Sobic010G081950 Sobic001G035700--Sobic001G184950 Sobic001G035700--Sobic001G143850 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic005G065050 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic001G505066--Sobic007G202360 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic001G505066--Sobic002G190600 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic009G147450 Sobic001G505066--Sobic010G172633 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic001G505066--Sobic003G192500 Sobic001G505066--Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G488800 Sobic001G315300--Sobic010G172633 Sobic001G315300--Sobic002G109900 Sobic001G315300--Sobic001G143850 Sobic001G315300--Sobic004G216650 Sobic001G315300--Sobic003G147800 Sobic001G315300--Sobic001G184950 Sobic001G315300--Sobic002G136500 Sobic001G315300--Sobic001G074900 Sobic001G315300--Sobic002G286500 Sobic002G395400--Sobic003G394150 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic002G395400--Sobic004G175800 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic002G395400--Sobic003G257650 Sobic002G395400--Sobic010G020000 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic002G395400--Sobic008G179400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic002G395400--Sobic003G094900 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic002G395400--Sobic007G043750 Sobic002G395400--Sobic002G204700 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic002G395400--Sobic004G224733 Sobic003G394150--Sobic002G395400 Sobic003G394150--Sobic010G020000 Sobic003G394150--Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic009G053700 Sobic003G394150--Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic002G204700 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic007G043750 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G394150--Sobic002G367000 Sobic002G204700--Sobic003G394150 Sobic002G204700--Sobic001G143850 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic002G395400 Sobic002G204700--Sobic009G053700 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic001G035700 Sobic002G204700--Sobic010G172633 Sobic002G204700--Sobic004G224733
Octagon: transcription factors


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