Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G357300.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W6Y1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39790.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048555
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G531800 dihydrodipicolinate reductase, putative, expressed K16908: chloroplast NAD(P)H dehydrogenase
2 Sobic.009G191900 expressed protein -
3 Sobic.004G235100 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G287300 proteophosphoglycan ppg4, putative, expressed -
5 Sobic.001G372600 DVR, putative, expressed K19073: divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase
6 Sobic.005G139600 Cupin domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G142400 cycloartenol synthase, putative, expressed -
8 Sobic.007G122400 HOTHEAD precursor, putative, expressed K15403: ACE, fatty acid omega-hydroxy dehydrogenase
9 Sobic.004G335900 expressed protein -
10 Sobic.002G265500 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
11 Sobic.007G226400 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.003G214800 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.006G227050 - -
14 Sobic.004G216650 - -
15 Sobic.005G110433 - -
16 Sobic.002G052600 - -
17 Sobic.002G136500 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G028766 - -
19 Sobic.002G075100 receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G022200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G357300 Sobic002G357300 Sobic001G531800 Sobic001G531800 Sobic002G357300--Sobic001G531800 Sobic009G191900 Sobic009G191900 Sobic002G357300--Sobic009G191900 Sobic004G235100 Sobic004G235100 Sobic002G357300--Sobic004G235100 Sobic002G287300 Sobic002G287300 Sobic002G357300--Sobic002G287300 Sobic001G372600 Sobic001G372600 Sobic002G357300--Sobic001G372600 Sobic005G139600 Sobic005G139600 Sobic002G357300--Sobic005G139600 Sobic008G142400 Sobic008G142400 Sobic002G357300--Sobic008G142400 Sobic007G122400 Sobic007G122400 Sobic002G357300--Sobic007G122400 Sobic004G335900 Sobic004G335900 Sobic002G357300--Sobic004G335900 Sobic009G253450 Sobic009G253450 Sobic001G531800--Sobic009G253450 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic001G531800--Sobic009G178000 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic001G531800--Sobic009G184450 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic001G531800--Sobic008G167900 Sobic002G231700 Sobic002G231700 Sobic001G531800--Sobic002G231700 Sobic003G076300 Sobic003G076300 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Octagon: transcription factors


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