Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G170300.1
Synonym Sb04g022150
Functional annotation RING-H2 finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RMW5
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF106
NCBI CDD KOG1493; Anaphase-promoting complex (APC), subunit 11
KEGG Orthology K19040; E3 ubiquitin-protein ligase ATL10/75/76/77/78
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49230 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g33720.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027046 , Zm00025a039764 , Zm00025a020591
Brachypodium PNT68791 , PNT68792
Barley HORVU2Hr1G074210.2 , HORVU2Hr1G074210.3 , HORVU2Hr1G074210.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G060300 transcription factor(PubMedID : 30367619)@WRKY45, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G170300 Sobic004G170300 Sobic007G037800 Sobic007G037800 Sobic004G170300--Sobic007G037800 Sobic004G019400 Sobic004G019400 Sobic004G170300--Sobic004G019400 Sobic004G197800 Sobic004G197800 Sobic004G170300--Sobic004G197800 Sobic002G195300 Sobic002G195300 Sobic004G170300--Sobic002G195300 Sobic006G003700 Sobic006G003700 Sobic004G170300--Sobic006G003700 Sobic001G315800 Sobic001G315800 Sobic004G170300--Sobic001G315800 Sobic003G242800 Sobic003G242800 Sobic004G170300--Sobic003G242800 Sobic009G227800 Sobic009G227800 Sobic004G170300--Sobic009G227800 Sobic004G179500 Sobic004G179500 Sobic004G170300--Sobic004G179500 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic007G037800--Sobic009G252100 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic007G037800--Sobic009G202400 Sobic007G037800--Sobic004G019400 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic007G037800--Sobic004G210601 Sobic008G060200 Sobic008G060200 Sobic007G037800--Sobic008G060200 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic007G037800--Sobic008G060300 Sobic005G093300 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