Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G073700.1
Synonym Sb06g016110
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YG92
Pfam -
Panther DB PTHR33177 PTHR33177:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11600 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056007 , Zm00025a011489
Brachypodium KQJ82539
Barley HORVU2Hr1G073380.11 , HORVU2Hr1G073380.10 , HORVU2Hr1G073380.13 , HORVU2Hr1G073380.12 , HORVU2Hr1G073380.9 , HORVU2Hr1G073380.8 , HORVU2Hr1G073380.5 , HORVU2Hr1G073380.4 , HORVU2Hr1G073380.7 , HORVU2Hr1G073380.6 , HORVU2Hr1G073380.1 , HORVU2Hr1G073380.3 , HORVU2Hr1G073380.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G020800 - -
2 Sobic.010G150600 - -
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4 Sobic.001G523300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.001G361750 - -
8 Sobic.008G096150 - -
9 Sobic.007G200200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
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12 Sobic.003G406240 - -
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14 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G072400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G281400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20528920)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
17 Sobic.002G320700 expressed protein -
18 Sobic.004G202750 - -
19 Sobic.010G021401 - -
20 Sobic.010G118401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G073700 Sobic006G073700 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic006G073700--Sobic009G020800 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic006G073700--Sobic010G150600 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic006G073700--Sobic001G400101 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic006G073700--Sobic001G523300 Sobic004G044500 Sobic004G044500 Sobic006G073700--Sobic004G044500 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic006G073700--Sobic010G060701 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic006G073700--Sobic001G361750 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic006G073700--Sobic008G096150 Sobic007G200200 Sobic007G200200 Sobic006G073700--Sobic007G200200 Sobic009G020800--Sobic001G400101 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic009G020800--Sobic006G109850 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic009G020800--Sobic005G204900 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic009G020800--Sobic008G096300 Sobic009G020800--Sobic010G150600 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic009G188750 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G020800--Sobic001G490600 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic009G020800--Sobic009G184500 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic009G020800--Sobic001G487250 Sobic010G150600--Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic009G184500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic010G021401 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic010G150600--Sobic005G155001 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic009G004300 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic001G490600 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic003G082401 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic010G150600--Sobic001G309000 Sobic001G400101--Sobic009G184500 Sobic001G400101--Sobic001G490600 Sobic001G400101--Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic008G096300 Sobic001G400101--Sobic010G150600 Sobic001G400101--Sobic010G060701 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G144050 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G400101--Sobic009G170301 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G400101--Sobic004G288900 Sobic003G406240 Sobic003G406240 Sobic001G523300--Sobic003G406240 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic001G523300--Sobic002G396900 Sobic001G523300--Sobic008G096150 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic001G523300--Sobic009G031300 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic001G523300--Sobic006G037000 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic001G523300--Sobic010G200800 Sobic009G072400 Sobic009G072400 Sobic001G523300--Sobic009G072400 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic001G523300--Sobic002G326200 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic001G523300--Sobic007G174100 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G044500--Sobic003G390600 Sobic003G281400 Sobic003G281400 Sobic004G044500--Sobic003G281400 Sobic004G081000 Sobic004G081000 Sobic004G044500--Sobic004G081000 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic004G044500--Sobic007G200300 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic004G044500--Sobic002G280001 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic004G044500--Sobic005G014400 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic004G044500--Sobic006G024400 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic004G044500--Sobic006G154900 Sobic005G031100 Sobic005G031100 Sobic004G044500--Sobic005G031100 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic010G060701--Sobic008G185000 Sobic010G060701--Sobic001G490600 Sobic010G060701--Sobic009G170301 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic010G060701--Sobic006G093400 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic010G060701--Sobic002G252700 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic001G400101 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic010G060701--Sobic004G205400 Sobic004G015500 Sobic004G015500 Sobic010G060701--Sobic004G015500 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic001G361750--Sobic001G456650 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G361750--Sobic001G483200 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic001G361750--Sobic001G033200 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic001G361750--Sobic001G468200 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic001G361750--Sobic001G527900 Sobic001G361750--Sobic002G360701 Sobic001G361750--Sobic009G004300 Sobic001G361750--Sobic005G155001 Sobic001G361750--Sobic006G093400 Sobic008G096150--Sobic007G174100 Sobic008G096150--Sobic010G150600 Sobic008G096150--Sobic001G523300 Sobic008G096150--Sobic002G326200 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic008G096150--Sobic001G212701 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic008G096150--Sobic002G234900 Sobic008G096150--Sobic009G031300 Sobic008G096150--Sobic010G200800 Sobic008G096150--Sobic001G309000 Sobic007G200200--Sobic001G456650 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic007G200200--Sobic001G068901 Sobic006G229600 Sobic006G229600 Sobic007G200200--Sobic006G229600 Sobic001G061000 Sobic001G061000 Sobic007G200200--Sobic001G061000 Sobic003G235601 Sobic003G235601 Sobic007G200200--Sobic003G235601 Sobic007G200200--Sobic009G072400 Sobic002G314950 Sobic002G314950 Sobic007G200200--Sobic002G314950 Sobic006G232300 Sobic006G232300 Sobic007G200200--Sobic006G232300 Sobic002G271900 Sobic002G271900 Sobic007G200200--Sobic002G271900
Octagon: transcription factors


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