Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G094000.1
Synonym Sb06g017880
Functional annotation PME/invertase inhibitor, putative, expressed
UniProt C5Y981
Pfam PF04043
Panther DB PTHR31080 PTHR31080:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17220 : pectin methylesterase inhibitor 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g36770.1 : PME/invertase inhibitor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011227
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.006G094000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G177400 frigida, putative, expressed -
2 Sobic.003G331200 - -
3 Sobic.004G020150 - -
4 Sobic.009G037600 RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G088812 - -
6 Sobic.006G272100 OsFBX30 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G119100 - -
8 Sobic.001G505900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G060550 - -
10 Sobic.002G076450 - -
11 Sobic.004G322500 - -
12 Sobic.002G015950 - -
13 Sobic.009G193600 Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G313100 CAMK_CAMK_like.8 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
15 Sobic.008G140500 expressed protein -
16 Sobic.005G201100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
17 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
18 Sobic.001G367900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@annexin, putative, expressed -
19 Sobic.005G156201 - -
20 Sobic.007G210200 Highest expression level in seeds(PubMedID : 27501690)@OsSPL14 - SBP-box gene family member, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G094000 Sobic006G094000 Sobic001G177400 Sobic001G177400 Sobic006G094000--Sobic001G177400 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic006G094000--Sobic003G331200 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic006G094000--Sobic004G020150 Sobic009G037600 Sobic009G037600 Sobic006G094000--Sobic009G037600 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic006G094000--Sobic008G088812 Sobic006G272100 Sobic006G272100 Sobic006G094000--Sobic006G272100 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic006G094000--Sobic008G119100 Sobic001G505900 Sobic001G505900 Sobic006G094000--Sobic001G505900 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic006G094000--Sobic007G060550 Sobic003G369700 Sobic003G369700 Sobic001G177400--Sobic003G369700 Sobic001G177400--Sobic006G094000 Sobic003G198080 Sobic003G198080 Sobic001G177400--Sobic003G198080 Sobic001G450200 Sobic001G450200 Sobic001G177400--Sobic001G450200 Sobic006G155300 Sobic006G155300 Sobic001G177400--Sobic006G155300 Sobic001G469300 Sobic001G469300 Sobic001G177400--Sobic001G469300 Sobic004G322500 Sobic004G322500 Sobic001G177400--Sobic004G322500 Sobic001G164700 Sobic001G164700 Sobic001G177400--Sobic001G164700 Sobic001G177400--Sobic004G020150 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic003G331200--Sobic004G000500 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic003G331200--Sobic001G367900 Sobic003G331200--Sobic008G119100 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic003G331200--Sobic007G210200 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic003G331200--Sobic003G092150 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic003G331200--Sobic009G193600 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic003G331200--Sobic002G347750 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic003G331200--Sobic008G065700 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic003G331200--Sobic007G226000 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G020150--Sobic009G239400 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic004G020150--Sobic008G140500 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic004G020150--Sobic006G142925 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic004G020150--Sobic003G165401 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic004G020150--Sobic007G127900 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G020150--Sobic002G069300 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic004G020150--Sobic008G069100 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic004G020150--Sobic004G102600 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic004G020150--Sobic003G137000 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic009G037600--Sobic002G076450 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic009G037600--Sobic005G040950 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic009G037600--Sobic010G051900 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic009G037600--Sobic003G289300 Sobic009G037600--Sobic008G119100 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic009G037600--Sobic001G241500 Sobic010G051600 Sobic010G051600 Sobic009G037600--Sobic010G051600 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic009G037600--Sobic009G047033 Sobic001G423633 Sobic001G423633 Sobic009G037600--Sobic001G423633 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic008G088812--Sobic010G194801 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic008G088812--Sobic003G019500 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic008G088812--Sobic005G156201 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic008G088812--Sobic003G111700 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic008G088812--Sobic003G260050 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic008G088812--Sobic001G310000 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic005G208425 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic009G043900 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic008G088812--Sobic002G015950 Sobic006G272100--Sobic002G015950 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic006G272100--Sobic001G442750 Sobic006G272100--Sobic009G193600 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic006G272100--Sobic005G205100 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic006G272100--Sobic006G049000 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic006G272100--Sobic004G071850 Sobic006G272100--Sobic003G260050 Sobic006G272100--Sobic003G111700 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic006G272100--Sobic010G011500 Sobic008G119100--Sobic002G076450 Sobic008G119100--Sobic010G051900 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic003G092150 Sobic008G119100--Sobic005G040950 Sobic008G119100--Sobic009G047033 Sobic008G119100--Sobic007G226000 Sobic001G313100 Sobic001G313100 Sobic001G505900--Sobic001G313100 Sobic001G505900--Sobic006G155300 Sobic001G505900--Sobic001G469300 Sobic001G505900--Sobic004G322500 Sobic006G210500 Sobic006G210500 Sobic001G505900--Sobic006G210500 Sobic008G012800 Sobic008G012800 Sobic001G505900--Sobic008G012800 Sobic002G416300 Sobic002G416300 Sobic001G505900--Sobic002G416300 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic001G505900--Sobic007G064400 Sobic004G065850 Sobic004G065850 Sobic001G505900--Sobic004G065850 Sobic007G060550--Sobic008G140500 Sobic007G060550--Sobic003G165401 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic007G060550--Sobic007G072700 Sobic007G060550--Sobic003G137000 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic007G060550--Sobic002G124832 Sobic007G060550--Sobic004G020150 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic007G060550--Sobic004G264800 Sobic007G060550--Sobic006G142925 Sobic007G060550--Sobic009G239400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.