Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G177400.1
Synonym Sb01g015440
Functional annotation frigida, putative, expressed
UniProt A0A109NDI3 , A0A1B6QJI4
Pfam PF07899
Panther DB PTHR31791 PTHR31791:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48385 : FRIGIDA-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g39129.1 : frigida, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007152
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G369700 HEAT, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
2 Sobic.006G094000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
3 Sobic.003G198080 - -
4 Sobic.001G450200 - -
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6 Sobic.001G469300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cupin domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G322500 - -
8 Sobic.001G164700 expressed protein -
9 Sobic.004G020150 - -
10 Sobic.008G088812 - -
11 Sobic.003G282700 protein kri1, putative, expressed K14786: protein KRI1
12 Sobic.003G332300 AP2 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G090850 - -
14 Sobic.001G310000 - -
15 Sobic.001G242400 - -
16 Sobic.001G308900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
17 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
18 Sobic.009G250600 OsFBX35 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G218900 expressed protein -
20 Sobic.002G416300 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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