Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G099650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDK3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G050050 - -
2 Sobic.005G038800 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.010G136950 - -
4 Sobic.010G177900 - -
5 Sobic.003G232001 - -
6 Sobic.001G328650 - -
7 Sobic.007G099900 - -
8 Sobic.006G270000 expressed protein -
9 Sobic.009G217400 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
10 Sobic.008G010000 expressed protein -
11 Sobic.010G114200 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
12 Sobic.001G188400 tobamovirus multiplication protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
14 Sobic.003G278600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@sulfate transporter, putative, expressed K17471: sulfate transporter 3
15 Sobic.002G103800 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
16 Sobic.002G254100 expressed protein -
17 Sobic.003G411300 expressed protein -
18 Sobic.007G004300 phosphate/phosphoenolpyruvate translocator-related protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G433400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
20 Sobic.003G402800 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G099650 Sobic006G099650 Sobic006G050050 Sobic006G050050 Sobic006G099650--Sobic006G050050 Sobic005G038800 Sobic005G038800 Sobic006G099650--Sobic005G038800 Sobic010G136950 Sobic010G136950 Sobic006G099650--Sobic010G136950 Sobic010G177900 Sobic010G177900 Sobic006G099650--Sobic010G177900 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic006G099650--Sobic003G232001 Sobic001G328650 Sobic001G328650 Sobic006G099650--Sobic001G328650 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic006G099650--Sobic007G099900 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic006G099650--Sobic006G270000 Sobic009G217400 Sobic009G217400 Sobic006G099650--Sobic009G217400 Sobic006G050050--Sobic005G038800 Sobic006G050050--Sobic010G136950 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic006G050050--Sobic010G114200 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic006G050050--Sobic002G103800 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic006G050050--Sobic004G064200 Sobic006G050050--Sobic006G270000 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic006G050050--Sobic002G180800 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic006G050050--Sobic004G228300 Sobic001G241401 Sobic001G241401 Sobic006G050050--Sobic001G241401 Sobic005G038800--Sobic006G050050 Sobic005G038800--Sobic010G114200 Sobic002G254100 Sobic002G254100 Sobic005G038800--Sobic002G254100 Sobic005G038800--Sobic002G180800 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic005G038800--Sobic009G007300 Sobic005G038800--Sobic010G136950 Sobic005G038800--Sobic004G064200 Sobic005G038800--Sobic002G103800 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic005G038800--Sobic003G014200 Sobic010G136950--Sobic006G050050 Sobic010G136950--Sobic010G114200 Sobic010G136950--Sobic002G103800 Sobic002G350200 Sobic002G350200 Sobic010G136950--Sobic002G350200 Sobic010G136950--Sobic001G241401 Sobic010G136950--Sobic002G254100 Sobic006G150300 Sobic006G150300 Sobic010G136950--Sobic006G150300 Sobic001G225800 Sobic001G225800 Sobic010G136950--Sobic001G225800 Sobic001G110250 Sobic001G110250 Sobic010G136950--Sobic001G110250 Sobic010G177900--Sobic006G099650 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic010G177900--Sobic008G010000 Sobic010G177900--Sobic006G050050 Sobic010G177900--Sobic005G038800 Sobic006G115900 Sobic006G115900 Sobic010G177900--Sobic006G115900 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic010G177900--Sobic003G072700 Sobic010G177900--Sobic009G217400 Sobic002G120800 Sobic002G120800 Sobic010G177900--Sobic002G120800 Sobic010G177900--Sobic010G136950 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic003G232001--Sobic003G180600 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G232001--Sobic009G007200 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic003G232001--Sobic001G419600 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic003G232001--Sobic007G095300 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G232001--Sobic007G098800 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic003G232001--Sobic005G081900 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic003G232001--Sobic005G150400 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic003G232001--Sobic004G003600 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G232001--Sobic002G027232 Sobic001G328650--Sobic006G099650 Sobic001G328650--Sobic006G050050 Sobic010G044800 Sobic010G044800 Sobic001G328650--Sobic010G044800 Sobic003G411300 Sobic003G411300 Sobic001G328650--Sobic003G411300 Sobic001G328650--Sobic010G177900 Sobic001G328650--Sobic008G010000 Sobic001G328650--Sobic010G136950 Sobic001G328650--Sobic005G038800 Sobic001G505600 Sobic001G505600 Sobic001G328650--Sobic001G505600 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic007G099900--Sobic003G402800 Sobic008G054200 Sobic008G054200 Sobic007G099900--Sobic008G054200 Sobic007G099900--Sobic002G180800 Sobic007G099900--Sobic004G064200 Sobic009G206100 Sobic009G206100 Sobic007G099900--Sobic009G206100 Sobic007G099900--Sobic010G114200 Sobic007G099900--Sobic002G103800 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic007G099900--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic007G099900--Sobic005G048500 Sobic003G024400 Sobic003G024400 Sobic006G270000--Sobic003G024400 Sobic009G148600 Sobic009G148600 Sobic006G270000--Sobic009G148600 Sobic006G270000--Sobic005G048500 Sobic006G270000--Sobic002G074800 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic006G270000--Sobic006G204400 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic006G270000--Sobic006G193400 Sobic010G149800 Sobic010G149800 Sobic006G270000--Sobic010G149800 Sobic006G270000--Sobic004G228300 Sobic003G198900 Sobic003G198900 Sobic006G270000--Sobic003G198900 Sobic007G182000 Sobic007G182000 Sobic009G217400--Sobic007G182000 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic009G217400--Sobic006G250800 Sobic002G307800 Sobic002G307800 Sobic009G217400--Sobic002G307800 Sobic003G433400 Sobic003G433400 Sobic009G217400--Sobic003G433400 Sobic009G116900 Sobic009G116900 Sobic009G217400--Sobic009G116900 Sobic003G092800 Sobic003G092800 Sobic009G217400--Sobic003G092800 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic009G217400--Sobic001G253300 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic009G217400--Sobic001G257800 Sobic009G217400--Sobic002G180800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.