Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G328650.3,Sobic.001G328650.2,Sobic.001G328650.1,Sobic.001G328650.4
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8S2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G099650 - -
2 Sobic.006G050050 - -
3 Sobic.010G044800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G411300 expressed protein -
5 Sobic.010G177900 - -
6 Sobic.008G010000 expressed protein -
7 Sobic.010G136950 - -
8 Sobic.005G038800 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G505600 DENN domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G195900 SCD1, putative, expressed -
11 Sobic.004G077300 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
12 Sobic.008G097900 protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G065200 expressed protein -
14 Sobic.004G350700 kelch repeat protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G378800 fumarate hydratase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01679: E4.2.1.2B, fumC, fumarate hydratase, class II
16 Sobic.003G372200 AGC_AGC_other_PDK1_Pk61C.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K06276: 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1
17 Sobic.003G278600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@sulfate transporter, putative, expressed K17471: sulfate transporter 3
18 Sobic.009G064200 boron transporter protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G172401 - K07904: Ras-related protein Rab-11A
20 Sobic.007G022000 importin subunit beta, putative, expressed K14293: KPNB1, importin subunit beta-1


Gene co-expression network
sample Sobic001G328650 Sobic001G328650 Sobic006G099650 Sobic006G099650 Sobic001G328650--Sobic006G099650 Sobic006G050050 Sobic006G050050 Sobic001G328650--Sobic006G050050 Sobic010G044800 Sobic010G044800 Sobic001G328650--Sobic010G044800 Sobic003G411300 Sobic003G411300 Sobic001G328650--Sobic003G411300 Sobic010G177900 Sobic010G177900 Sobic001G328650--Sobic010G177900 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic001G328650--Sobic008G010000 Sobic010G136950 Sobic010G136950 Sobic001G328650--Sobic010G136950 Sobic005G038800 Sobic005G038800 Sobic001G328650--Sobic005G038800 Sobic001G505600 Sobic001G505600 Sobic001G328650--Sobic001G505600 Sobic006G099650--Sobic006G050050 Sobic006G099650--Sobic005G038800 Sobic006G099650--Sobic010G136950 Sobic006G099650--Sobic010G177900 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic006G099650--Sobic003G232001 Sobic006G099650--Sobic001G328650 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic006G099650--Sobic007G099900 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic006G099650--Sobic006G270000 Sobic009G217400 Sobic009G217400 Sobic006G099650--Sobic009G217400 Sobic006G050050--Sobic005G038800 Sobic006G050050--Sobic010G136950 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic006G050050--Sobic010G114200 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic006G050050--Sobic002G103800 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic006G050050--Sobic004G064200 Sobic006G050050--Sobic006G270000 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic006G050050--Sobic002G180800 Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic006G050050--Sobic004G228300 Sobic001G241401 Sobic001G241401 Sobic006G050050--Sobic001G241401 Sobic004G254800 Sobic004G254800 Sobic010G044800--Sobic004G254800 Sobic003G394200 Sobic003G394200 Sobic010G044800--Sobic003G394200 Sobic010G223400 Sobic010G223400 Sobic010G044800--Sobic010G223400 Sobic001G049400 Sobic001G049400 Sobic010G044800--Sobic001G049400 Sobic006G203300 Sobic006G203300 Sobic010G044800--Sobic006G203300 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic010G044800--Sobic001G389200 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic010G044800--Sobic002G355800 Sobic005G177700 Sobic005G177700 Sobic010G044800--Sobic005G177700 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic010G044800--Sobic007G172700 Sobic005G063200 Sobic005G063200 Sobic003G411300--Sobic005G063200 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic003G411300--Sobic003G211800 Sobic009G106700 Sobic009G106700 Sobic003G411300--Sobic009G106700 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic003G411300--Sobic009G007300 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic003G411300--Sobic004G168900 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic003G411300--Sobic002G097200 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic003G411300--Sobic005G225500 Sobic009G113500 Sobic009G113500 Sobic003G411300--Sobic009G113500 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic003G411300--Sobic002G099700 Sobic010G177900--Sobic006G099650 Sobic010G177900--Sobic008G010000 Sobic010G177900--Sobic006G050050 Sobic010G177900--Sobic005G038800 Sobic006G115900 Sobic006G115900 Sobic010G177900--Sobic006G115900 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic010G177900--Sobic003G072700 Sobic010G177900--Sobic009G217400 Sobic002G120800 Sobic002G120800 Sobic010G177900--Sobic002G120800 Sobic010G177900--Sobic010G136950 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic008G010000--Sobic008G003800 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic008G010000--Sobic010G060800 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic008G010000--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic008G010000--Sobic005G221900 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic008G010000--Sobic002G162450 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic008G010000--Sobic005G223925 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic008G010000--Sobic005G223600 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic008G010000--Sobic006G222000 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic008G010000--Sobic006G036700 Sobic010G136950--Sobic006G050050 Sobic010G136950--Sobic010G114200 Sobic010G136950--Sobic002G103800 Sobic002G350200 Sobic002G350200 Sobic010G136950--Sobic002G350200 Sobic010G136950--Sobic001G241401 Sobic002G254100 Sobic002G254100 Sobic010G136950--Sobic002G254100 Sobic006G150300 Sobic006G150300 Sobic010G136950--Sobic006G150300 Sobic001G225800 Sobic001G225800 Sobic010G136950--Sobic001G225800 Sobic001G110250 Sobic001G110250 Sobic010G136950--Sobic001G110250 Sobic005G038800--Sobic006G050050 Sobic005G038800--Sobic010G114200 Sobic005G038800--Sobic002G254100 Sobic005G038800--Sobic002G180800 Sobic005G038800--Sobic009G007300 Sobic005G038800--Sobic010G136950 Sobic005G038800--Sobic004G064200 Sobic005G038800--Sobic002G103800 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic005G038800--Sobic003G014200 Sobic003G372200 Sobic003G372200 Sobic001G505600--Sobic003G372200 Sobic001G378800 Sobic001G378800 Sobic001G505600--Sobic001G378800 Sobic010G065200 Sobic010G065200 Sobic001G505600--Sobic010G065200 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic001G505600--Sobic001G385000 Sobic001G486900 Sobic001G486900 Sobic001G505600--Sobic001G486900 Sobic002G070300 Sobic002G070300 Sobic001G505600--Sobic002G070300 Sobic008G132200 Sobic008G132200 Sobic001G505600--Sobic008G132200 Sobic001G424800 Sobic001G424800 Sobic001G505600--Sobic001G424800 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic001G505600--Sobic003G394500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.