Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G138933.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RET5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G161100 - -
2 Sobic.001G345333 - -
3 Sobic.002G007250 - -
4 Sobic.008G031350 - -
5 Sobic.010G050600 - -
6 Sobic.003G302701 - -
7 Sobic.002G108800 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
8 Sobic.010G146200 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed -
9 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.002G039600 - -
11 Sobic.003G089650 - -
12 Sobic.009G113600 - -
13 Sobic.005G130100 terpene synthase, putative, expressed K15803: (-)-germacrene D synthase
14 Sobic.005G054000 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
15 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
16 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
17 Sobic.009G180200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
18 Sobic.006G249000 cysteine-rich receptor-like protein kinase 8 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
19 Sobic.001G243901 - -
20 Sobic.005G221425 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G138933 Sobic006G138933 Sobic010G161100 Sobic010G161100 Sobic006G138933--Sobic010G161100 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic006G138933--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic006G138933--Sobic002G007250 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G138933--Sobic008G031350 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic006G138933--Sobic010G050600 Sobic003G302701 Sobic003G302701 Sobic006G138933--Sobic003G302701 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic006G138933--Sobic002G108800 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic006G138933--Sobic010G146200 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic006G138933--Sobic008G009500 Sobic010G161100--Sobic003G302701 Sobic010G161100--Sobic006G138933 Sobic008G101350 Sobic008G101350 Sobic010G161100--Sobic008G101350 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic010G161100--Sobic001G243901 Sobic010G161100--Sobic001G345333 Sobic010G161100--Sobic002G007250 Sobic002G048300 Sobic002G048300 Sobic010G161100--Sobic002G048300 Sobic001G345333--Sobic002G007250 Sobic001G345333--Sobic002G108800 Sobic001G345333--Sobic001G243901 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G345333--Sobic004G212800 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G345333--Sobic010G248200 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic001G345333--Sobic004G164600 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic001G345333--Sobic007G073400 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic001G345333--Sobic002G253500 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G345333--Sobic008G042250 Sobic002G007250--Sobic001G345333 Sobic002G007250--Sobic010G248200 Sobic002G007250--Sobic002G108800 Sobic002G007250--Sobic004G212800 Sobic002G007250--Sobic001G243901 Sobic002G007250--Sobic004G164600 Sobic002G007250--Sobic007G073400 Sobic002G007250--Sobic002G253500 Sobic002G007250--Sobic008G042250 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G031350--Sobic009G113600 Sobic008G031350--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G031350--SobicK024000 Sobic008G031350--Sobic007G073400 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G031350--Sobic002G062300 Sobic008G031350--Sobic004G164600 Sobic008G031350--Sobic002G007250 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G031350--Sobic005G212600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G031350--Sobic006G132200 Sobic010G050600--Sobic010G146200 Sobic010G050600--Sobic009G113600 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic010G050600--Sobic003G176100 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic010G050600--Sobic005G130100 Sobic010G050600--SobicK024000 Sobic010G050600--Sobic008G031350 Sobic006G249000 Sobic006G249000 Sobic010G050600--Sobic006G249000 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic010G050600--Sobic007G059300 Sobic010G050600--Sobic002G108800 Sobic003G302701--Sobic010G161100 Sobic003G302701--Sobic008G101350 Sobic003G302701--Sobic001G243901 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic003G302701--Sobic008G157950 Sobic003G302701--Sobic002G007250 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G302701--Sobic001G287301 Sobic003G302701--Sobic001G345333 Sobic005G117901 Sobic005G117901 Sobic003G302701--Sobic005G117901 Sobic004G096200 Sobic004G096200 Sobic003G302701--Sobic004G096200 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic002G108800--Sobic007G156500 Sobic002G108800--Sobic002G007250 Sobic002G108800--Sobic001G345333 Sobic002G108800--Sobic002G253500 Sobic002G108800--Sobic010G248200 Sobic002G108800--Sobic004G212800 Sobic002G039500 Sobic002G039500 Sobic002G108800--Sobic002G039500 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic002G108800--Sobic007G023700 Sobic002G108800--Sobic007G073400 Sobic010G146200--Sobic003G176100 Sobic010G146200--Sobic009G113600 Sobic010G146200--Sobic010G050600 Sobic010G146200--Sobic005G130100 Sobic010G146200--Sobic007G059300 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic010G146200--Sobic002G051400 Sobic010G146200--SobicK024000 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic010G146200--Sobic009G078500 Sobic007G189800 Sobic007G189800 Sobic010G146200--Sobic007G189800 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G009500--Sobic005G221425
Octagon: transcription factors


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