Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G144500.1
Synonym Sb06g022320, CER1
Functional annotation Protein eceriferum 1 CER1 (Os) (PubMedID : 27208977)
WAX2, putative, expressed
UniProt C5YC01
Pfam PF04116 PF12076
Panther DB PTHR11863 PTHR11863:SF38
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15404; K15404, aldehyde decarbonylase
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity GO:0006633fatty acid biosynthetic process GO:0005506iron ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02205 : Fatty acid hydroxylase superfamily
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g40784.1 : WAX2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT61466 , PNT61468 , PNT61465 , PNT61464 , PNT61467 , PNT61463
Barley HORVU2Hr1G088880.1 , HORVU2Hr1G088880.2 , HORVU2Hr1G088880.3 , HORVU2Hr1G088880.4 , HORVU2Hr1G088880.5 , HORVU2Hr1G088880.6 , HORVU2Hr1G088880.7 , HORVU2Hr1G088880.8 , HORVU2Hr1G088880.9 , HORVU7Hr1G023150.1 , HORVU7Hr1G023150.2 , HORVU7Hr1G023150.3 , HORVU7Hr1G023150.4 , HORVU7Hr1G023150.5 , HORVU7Hr1G023150.6 , HORVU2Hr1G088860.10 , HORVU2Hr1G088860.11 , HORVU4Hr1G001510.1 , HORVU2Hr1G088860.8 , HORVU2Hr1G088860.9 , HORVU2Hr1G088860.2 , HORVU2Hr1G088860.3 , HORVU2Hr1G088860.1 , HORVU2Hr1G088860.6 , HORVU2Hr1G088860.7 , HORVU2Hr1G088860.4 , HORVU2Hr1G088860.5
Wheat TraesCS2D02G381800 , TraesCS2D02G381900 , TraesCS2A02G385100 , TraesCS2A02G385100 , TraesCS2A02G385100 , TraesCS2A02G385200 , TraesCS2B02G402100 , TraesCS7D02G103100
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cDNA sequences
Sobic.006G144500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G131800 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03006: RPB1, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
2 Sobic.001G305100 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G205800 ATXR, putative, expressed -
4 Sobic.010G112700 NHL repeat-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G040101 - -
6 Sobic.007G025100 expressed protein -
7 Sobic.002G300900 - -
8 Sobic.002G066000 expressed protein -
9 Sobic.010G035000 - -
10 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
11 Sobic.001G297700 expressed protein -
12 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G035500 expressed protein -
14 Sobic.005G185400 - -
15 Sobic.005G184500 - -
16 Sobic.006G105300 expressed protein -
17 Sobic.006G004100 no apical meristem protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.001G069100 - -
20 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G144500 Sobic006G144500 Sobic005G131800 Sobic005G131800 Sobic006G144500--Sobic005G131800 Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic006G144500--Sobic001G305100 Sobic005G205800 Sobic005G205800 Sobic006G144500--Sobic005G205800 Sobic010G112700 Sobic010G112700 Sobic006G144500--Sobic010G112700 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic006G144500--Sobic006G040101 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic006G144500--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic006G144500--Sobic002G300900 Sobic002G066000 Sobic002G066000 Sobic006G144500--Sobic002G066000 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic006G144500--Sobic010G035000 Sobic006G161300 Sobic006G161300 Sobic005G131800--Sobic006G161300 Sobic005G131800--Sobic010G112700 Sobic005G131800--Sobic001G305100 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic005G131800--Sobic006G186300 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic005G131800--Sobic002G286800 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic005G131800--Sobic004G075700 Sobic001G183100 Sobic001G183100 Sobic005G131800--Sobic001G183100 Sobic005G131800--Sobic006G040101 Sobic005G131800--Sobic007G025100 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G305100--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic001G305100--Sobic003G266100 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G305100--Sobic005G082300 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic001G305100--Sobic002G059500 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic001G305100--Sobic001G511400 Sobic001G305100--Sobic002G300900 Sobic001G305100--Sobic006G040101 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G305100--Sobic002G172100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G305100--Sobic005G147500 Sobic005G205800--Sobic002G066000 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic005G205800--Sobic007G049000 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G205800--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G205800--Sobic005G184400 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic005G205800--Sobic006G142850 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G205800--Sobic005G186250 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G205800--Sobic006G105300 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic005G205800--Sobic009G007100 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic005G205800--Sobic005G184500 Sobic010G112700--Sobic005G131800 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic010G112700--Sobic002G230400 Sobic008G156200 Sobic008G156200 Sobic010G112700--Sobic008G156200 Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic010G112700--Sobic001G541400 Sobic010G112700--Sobic006G186300 Sobic010G112700--Sobic006G144500 Sobic008G116100 Sobic008G116100 Sobic010G112700--Sobic008G116100 Sobic010G112700--Sobic004G075700 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic010G112700--Sobic007G041200 Sobic006G040101--Sobic002G059500 Sobic006G040101--Sobic002G300900 Sobic006G040101--Sobic007G025100 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic006G040101--Sobic005G035500 Sobic006G040101--Sobic003G266100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic006G040101--Sobic001G297700 Sobic006G040101--Sobic001G511400 Sobic006G040101--Sobic002G172200 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic006G040101--Sobic006G004100 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic002G066000--Sobic005G205800 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic002G066000--Sobic005G189000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic002G066000--Sobic004G207500 Sobic002G066000--Sobic005G186250 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic002G066000--Sobic005G083220 Sobic002G066000--Sobic009G007100 Sobic002G066000--Sobic007G049000 Sobic002G066000--Sobic006G142850 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic002G066000--Sobic008G181250 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic005G185400
Octagon: transcription factors


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