Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G168900.1
Synonym Sb06g024450
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5REC1
Pfam PF05553
Panther DB PTHR34059 PTHR34059:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16790 : hydroxyproline-rich glycoprotein family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010327
Brachypodium PNT61602 , PNT69169
Barley HORVU2Hr1G097980.1
Wheat -
Populus PNT49553


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cDNA sequences
Sobic.006G168900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G165200 amino acid permease family protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G070951 - -
3 Sobic.004G160750 - -
4 Sobic.003G230800 - -
5 Sobic.001G150100 - -
6 Sobic.004G279400 ZR1 protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G315450 - -
8 Sobic.009G181000 - -
9 Sobic.002G172800 expressed protein -
10 Sobic.002G317001 - -
11 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
12 Sobic.010G054150 - -
13 Sobic.002G202350 - -
14 Sobic.003G028700 - -
15 Sobic.008G147600 - -
16 Sobic.002G099932 - -
17 Sobic.010G154801 - -
18 Sobic.007G167600 expressed protein -
19 Sobic.002G107700 - -
20 Sobic.004G070150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G168900 Sobic006G168900 Sobic006G165200 Sobic006G165200 Sobic006G168900--Sobic006G165200 Sobic005G070951 Sobic005G070951 Sobic006G168900--Sobic005G070951 Sobic004G160750 Sobic004G160750 Sobic006G168900--Sobic004G160750 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic006G168900--Sobic003G230800 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic006G168900--Sobic001G150100 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic006G168900--Sobic004G279400 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic006G168900--Sobic002G315450 Sobic009G181000 Sobic009G181000 Sobic006G168900--Sobic009G181000 Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic006G168900--Sobic002G172800 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic006G165200--Sobic005G187700 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic006G165200--Sobic003G301050 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic006G165200--Sobic007G149500 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G165200--Sobic009G173700 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic006G165200--Sobic003G341900 Sobic006G165200--Sobic004G279400 Sobic003G072000 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Octagon: transcription factors


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