Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G223001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG94
Pfam -
Panther DB PTHR24298 PTHR24298:SF158
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48290 : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 24
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29960.1 : cytochrome P450, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G135500 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
2 Sobic.005G081100 - -
3 Sobic.006G029900 nucampholin, putative, expressed K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
4 Sobic.003G387400 - -
5 Sobic.002G267050 - -
6 Sobic.010G212600 WAX2, putative, expressed -
7 Sobic.001G152500 OsFBX387 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G031450 - -
9 Sobic.005G085800 expressed protein -
10 Sobic.005G061300 - -
11 Sobic.003G385201 - -
12 Sobic.003G243400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
13 Sobic.002G085700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G002800 expressed protein -
15 Sobic.001G035450 - -
16 Sobic.003G333150 - -
17 Sobic.002G067050 - -
18 Sobic.010G025200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G067200 expressed protein -
20 Sobic.001G482500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G223001 Sobic006G223001 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic006G223001--Sobic005G135500 Sobic005G081100 Sobic005G081100 Sobic006G223001--Sobic005G081100 Sobic006G029900 Sobic006G029900 Sobic006G223001--Sobic006G029900 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic006G223001--Sobic003G387400 Sobic002G267050 Sobic002G267050 Sobic006G223001--Sobic002G267050 Sobic010G212600 Sobic010G212600 Sobic006G223001--Sobic010G212600 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic006G223001--Sobic001G152500 Sobic009G031450 Sobic009G031450 Sobic006G223001--Sobic009G031450 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic006G223001--Sobic005G085800 Sobic005G135500--Sobic002G267050 Sobic005G135500--Sobic010G212600 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic005G135500--Sobic002G044900 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G135500--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G135500--Sobic002G067050 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic005G135500--Sobic005G201800 Sobic005G135500--Sobic001G152500 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G135500--Sobic003G002800 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G135500--Sobic001G033701 Sobic005G081100--Sobic006G029900 Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic005G081100--Sobic001G035450 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic005G081100--Sobic005G061300 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic005G081100--Sobic003G333150 Sobic001G533600 Sobic001G533600 Sobic005G081100--Sobic001G533600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic005G081100--Sobic010G025200 Sobic005G081100--Sobic005G135500 Sobic005G225700 Sobic005G225700 Sobic005G081100--Sobic005G225700 Sobic005G081100--Sobic003G002800 Sobic006G029900--Sobic005G081100 Sobic006G198200 Sobic006G198200 Sobic006G029900--Sobic006G198200 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic006G029900--Sobic007G139800 Sobic006G029900--Sobic005G061300 Sobic006G029900--Sobic001G035450 Sobic001G223000 Sobic001G223000 Sobic006G029900--Sobic001G223000 Sobic006G029900--Sobic001G533600 Sobic006G029900--Sobic010G025200 Sobic004G312900 Sobic004G312900 Sobic006G029900--Sobic004G312900 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic002G267050--Sobic005G201800 Sobic005G029866 Sobic005G029866 Sobic002G267050--Sobic005G029866 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G267050--Sobic008G069901 Sobic002G267050--Sobic001G152500 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G267050--Sobic003G046000 Sobic002G267050--Sobic002G260500 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G267050--Sobic006G076700 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G267050--Sobic006G258200 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G267050--Sobic004G184900 Sobic003G243400 Sobic003G243400 Sobic010G212600--Sobic003G243400 Sobic010G212600--Sobic002G267050 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic010G212600--Sobic009G067200 Sobic010G212600--Sobic001G152500 Sobic010G212600--Sobic002G044900 Sobic010G212600--Sobic005G135500 Sobic010G272400 Sobic010G272400 Sobic010G212600--Sobic010G272400 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic010G212600--Sobic008G053000 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic010G212600--Sobic002G401301 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic001G152500--Sobic008G045232 Sobic001G152500--Sobic002G267050 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic001G152500--Sobic002G289701 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic001G152500--Sobic005G030200 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic001G152500--Sobic002G191300 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic001G152500--Sobic001G189800 Sobic001G152500--Sobic008G053000 Sobic001G152500--Sobic005G201800 Sobic001G152500--Sobic010G212600 Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic009G031450--Sobic009G063450 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic009G031450--Sobic002G085700 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic009G031450--Sobic002G384800 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic009G031450--Sobic001G482500 Sobic002G319700 Sobic002G319700 Sobic009G031450--Sobic002G319700 Sobic003G154800 Sobic003G154800 Sobic009G031450--Sobic003G154800 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic009G031450--Sobic004G290400 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic009G031450--Sobic004G159600 Sobic002G013500 Sobic002G013500 Sobic009G031450--Sobic002G013500 Sobic005G085800--Sobic002G289701 Sobic005G085800--Sobic002G067050 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic008G045232 Sobic005G085800--Sobic005G030200 Sobic005G085800--Sobic002G191300 Sobic005G085800--Sobic001G033701 Sobic005G085800--Sobic003G210701 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G085800--Sobic004G325150
Octagon: transcription factors


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