Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G039750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5K0
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ85112
Barley -
Wheat TraesCS7D02G063700
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G159850 - -
2 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G207100 expressed protein -
4 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
7 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
8 Sobic.003G091500 expressed protein -
9 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.001G233600 expressed protein -
11 Sobic.004G171600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G176800 expressed protein -
13 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.005G174000 - -
15 Sobic.005G077900 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G021100 - -
17 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
18 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.008G088900 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G039750 Sobic008G039750 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic008G039750--Sobic003G159850 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic008G039750--Sobic003G414000 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic008G039750--Sobic003G207100 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic008G039750--Sobic005G173800 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic008G039750--Sobic002G007700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic008G039750--Sobic009G040000 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G039750--Sobic008G184100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G039750--Sobic003G091500 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic008G039750--Sobic001G200900 Sobic003G159850--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic003G159850--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic003G159850--Sobic001G158600 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic003G159850--Sobic010G085700 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic003G159850--Sobic004G261000 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic003G159850--Sobic002G409250 Sobic003G159850--Sobic005G173800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic003G159850--Sobic005G193700 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic003G159850--Sobic006G051750 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic003G414000--Sobic005G174000 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G414000--Sobic004G171600 Sobic003G414000--Sobic001G200900 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G414000--Sobic008G031400 Sobic003G414000--Sobic008G184100 Sobic003G414000--Sobic003G091500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G414000--Sobic008G088900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G414000--Sobic005G077900 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic003G414000--Sobic001G489075 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic005G173800--Sobic010G085700 Sobic005G173800--Sobic009G040000 Sobic005G173800--Sobic001G253400 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic005G173800--Sobic003G207600 Sobic005G173800--Sobic006G051750 Sobic005G173800--Sobic001G158600 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic006G104800 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic004G261000 Sobic002G007700--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic004G171600 Sobic002G007700--Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic005G077900 Sobic002G007700--Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic003G091500 Sobic002G007700--Sobic008G184100 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic008G088900 Sobic009G040000--Sobic001G253400 Sobic009G040000--Sobic010G085700 Sobic009G040000--Sobic001G158600 Sobic009G040000--Sobic005G173800 Sobic009G040000--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic009G040000--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic009G040000--Sobic006G015750 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic009G040000--Sobic002G078800 Sobic009G040000--Sobic005G193700 Sobic008G184100--Sobic003G091500 Sobic008G184100--Sobic008G088900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic008G184100--Sobic002G108300 Sobic008G184100--Sobic002G007700 Sobic008G184100--Sobic004G171600 Sobic008G184100--Sobic008G031400 Sobic008G184100--Sobic001G233600 Sobic008G184100--Sobic003G207100 Sobic008G184100--Sobic005G174000 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic005G077900 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G200900--Sobic001G233600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.