Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G076600.1
Synonym Sb08g006880, RLP6, AtRLP6
Functional annotation verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed
UniProt C5YTR1
Pfam PF08263 PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27004 PTHR27004:SF9
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G45616 : receptor like protein 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g11370.1 : verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G076500 - -
2 Sobic.002G327400 TKL_IRAK_DUF26-lc22 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
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7 Sobic.004G311750 - -
8 Sobic.002G238600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@- -
9 Sobic.001G327500 uridine 5-monophosphate synthase, putative, expressed K13421: uridine monophosphate synthetase
10 Sobic.002G390000 dirigent, putative, expressed -
11 Sobic.001G197300 kinase, putative, expressed -
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14 Sobic.004G094900 expressed protein -
15 Sobic.007G100032 - -
16 Sobic.003G112400 expressed protein -
17 Sobic.002G327201 - -
18 Sobic.003G060100 expressed protein -
19 Sobic.008G029400 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@WRKY DNA-binding protein 55("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@WRKY46, expressed -
20 Sobic.006G216700 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G076600 Sobic008G076600 Sobic008G076500 Sobic008G076500 Sobic008G076600--Sobic008G076500 Sobic002G327400 Sobic002G327400 Sobic008G076600--Sobic002G327400 Sobic005G223450 Sobic005G223450 Sobic008G076600--Sobic005G223450 Sobic006G104700 Sobic006G104700 Sobic008G076600--Sobic006G104700 Sobic004G169966 Sobic004G169966 Sobic008G076600--Sobic004G169966 Sobic007G149800 Sobic007G149800 Sobic008G076600--Sobic007G149800 Sobic004G311750 Sobic004G311750 Sobic008G076600--Sobic004G311750 Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic008G076600--Sobic002G238600 Sobic001G327500 Sobic001G327500 Sobic008G076600--Sobic001G327500 Sobic008G191600 Sobic008G191600 Sobic008G076500--Sobic008G191600 Sobic002G327201 Sobic002G327201 Sobic008G076500--Sobic002G327201 Sobic008G076500--Sobic002G327400 Sobic008G076500--Sobic008G076600 Sobic008G076500--Sobic005G223450 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic008G076500--Sobic007G101900 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic008G076500--Sobic006G063400 Sobic010G149700 Sobic010G149700 Sobic008G076500--Sobic010G149700 Sobic004G088000 Sobic004G088000 Sobic008G076500--Sobic004G088000 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic002G327400--Sobic003G112400 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic002G327400--Sobic003G060100 Sobic002G327400--Sobic002G327201 Sobic001G487500 Sobic001G487500 Sobic002G327400--Sobic001G487500 Sobic001G086000 Sobic001G086000 Sobic002G327400--Sobic001G086000 Sobic002G327400--Sobic002G238600 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic002G327400--Sobic010G135100 Sobic002G234400 Sobic002G234400 Sobic002G327400--Sobic002G234400 Sobic008G077550 Sobic008G077550 Sobic002G327400--Sobic008G077550 Sobic005G223450--Sobic001G086000 Sobic005G066600 Sobic005G066600 Sobic005G223450--Sobic005G066600 Sobic008G029400 Sobic008G029400 Sobic005G223450--Sobic008G029400 Sobic005G223450--Sobic002G327400 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic005G223450--Sobic006G277800 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic005G223450--Sobic004G121700 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic005G223450--Sobic001G197300 Sobic005G223450--Sobic006G104700 Sobic005G223450--Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic002G238600 Sobic006G104700--Sobic003G112400 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic006G104700--Sobic002G390000 Sobic006G104700--Sobic003G060100 Sobic006G104700--Sobic006G277800 Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic006G104700--Sobic006G072201 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic006G104700--Sobic001G065900 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic010G135100 Sobic004G169966--Sobic004G311750 Sobic004G165800 Sobic004G165800 Sobic004G169966--Sobic004G165800 Sobic005G118100 Sobic005G118100 Sobic004G169966--Sobic005G118100 Sobic004G169966--Sobic001G065900 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic004G169966--Sobic004G094900 Sobic005G132066 Sobic005G132066 Sobic004G169966--Sobic005G132066 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic004G169966--Sobic001G381400 Sobic002G102132 Sobic002G102132 Sobic004G169966--Sobic002G102132 Sobic004G263100 Sobic004G263100 Sobic004G169966--Sobic004G263100 Sobic003G039600 Sobic003G039600 Sobic007G149800--Sobic003G039600 Sobic007G149800--Sobic010G135100 Sobic007G149800--Sobic005G110406 Sobic004G171700 Sobic004G171700 Sobic007G149800--Sobic004G171700 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic007G149800--Sobic004G229400 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic007G149800--Sobic007G090460 Sobic003G411200 Sobic003G411200 Sobic007G149800--Sobic003G411200 Sobic007G149800--Sobic008G077550 Sobic007G149900 Sobic007G149900 Sobic007G149800--Sobic007G149900 Sobic001G260000 Sobic001G260000 Sobic004G311750--Sobic001G260000 Sobic008G054150 Sobic008G054150 Sobic004G311750--Sobic008G054150 Sobic001G343601 Sobic001G343601 Sobic004G311750--Sobic001G343601 Sobic010G004200 Sobic010G004200 Sobic004G311750--Sobic010G004200 Sobic007G169500 Sobic007G169500 Sobic004G311750--Sobic007G169500 Sobic004G311750--Sobic004G169966 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic004G311750--Sobic009G009400 Sobic004G311750--Sobic008G029400 Sobic004G341000 Sobic004G341000 Sobic004G311750--Sobic004G341000 Sobic002G238600--Sobic002G390000 Sobic002G238600--Sobic001G381400 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic002G238600--Sobic005G180500 Sobic002G238600--Sobic006G104700 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic002G238600--Sobic002G388800 Sobic002G238600--Sobic001G065900 Sobic002G238600--Sobic004G263100 Sobic002G238600--Sobic003G060100 Sobic002G238600--Sobic004G094900 Sobic001G327500--Sobic004G165800 Sobic007G159100 Sobic007G159100 Sobic001G327500--Sobic007G159100 Sobic001G327500--Sobic001G381400 Sobic001G327500--Sobic002G102132 Sobic002G090100 Sobic002G090100 Sobic001G327500--Sobic002G090100
Octagon: transcription factors


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