Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G187500.1
Synonym
Functional annotation bZIP transcription factor domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PEJ3
Pfam PF00170
Panther DB PTHR22952 PTHR22952:SF181
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43790.1 : bZIP transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G104400 ZOS12-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed K09506: DnaJ homolog subfamily A member 5
2 Sobic.006G134300 - -
3 Sobic.006G268900 "STKc_IRAK, catalytic domain of the serine/threonine kinases"(PubMedID : 29491869)@expressed protein -
4 Sobic.003G347560 - -
5 Sobic.009G175800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G386400 - -
7 Sobic.009G064832 - -
8 Sobic.005G048700 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G094200 - -
10 Sobic.004G242800 - -
11 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
13 Sobic.004G248200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.004G227700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase, putative, expressed -
15 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G263900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G250400 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
18 Sobic.004G058400 RNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.002G086700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G187500 Sobic008G187500 Sobic008G104400 Sobic008G104400 Sobic008G187500--Sobic008G104400 Sobic006G134300 Sobic006G134300 Sobic008G187500--Sobic006G134300 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic008G187500--Sobic006G268900 Sobic003G347560 Sobic003G347560 Sobic008G187500--Sobic003G347560 Sobic009G175800 Sobic009G175800 Sobic008G187500--Sobic009G175800 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic008G187500--Sobic003G386400 Sobic009G064832 Sobic009G064832 Sobic008G187500--Sobic009G064832 Sobic005G048700 Sobic005G048700 Sobic008G187500--Sobic005G048700 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic008G187500--Sobic009G094200 Sobic001G517900 Sobic001G517900 Sobic008G104400--Sobic001G517900 Sobic008G104400--Sobic008G187500 Sobic008G104400--Sobic006G134300 Sobic008G104400--Sobic003G386400 Sobic008G104400--Sobic009G175800 Sobic008G104400--Sobic006G268900 Sobic002G287600 Sobic002G287600 Sobic008G104400--Sobic002G287600 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic008G104400--Sobic003G410000 Sobic008G104400--Sobic003G347560 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic006G134300--Sobic002G187900 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic006G134300--Sobic006G249600 Sobic004G227700 Sobic004G227700 Sobic006G134300--Sobic004G227700 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic006G134300--Sobic003G155000 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G134300--Sobic003G253700 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic006G134300--Sobic003G263900 Sobic003G365200 Sobic003G365200 Sobic006G134300--Sobic003G365200 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic006G134300--Sobic004G127600 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic006G134300--Sobic001G212900 Sobic006G268900--Sobic009G094200 Sobic006G268900--Sobic004G227700 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic006G268900--Sobic004G250400 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic006G268900--Sobic008G142200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic006G268900--Sobic003G063400 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic006G268900--Sobic008G072800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic006G268900--Sobic010G100700 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic006G268900--Sobic004G033650 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic006G268900--Sobic007G141900 Sobic003G347560--Sobic006G134300 Sobic003G347560--Sobic005G048700 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic003G347560--Sobic001G329001 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic003G347560--Sobic002G086700 Sobic003G347560--Sobic008G104400 Sobic003G347560--Sobic008G187500 Sobic003G347560--Sobic003G410000 Sobic004G058400 Sobic004G058400 Sobic003G347560--Sobic004G058400 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic003G347560--Sobic008G177100 Sobic009G230600 Sobic009G230600 Sobic009G175800--Sobic009G230600 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic009G175800--Sobic004G242800 Sobic009G175800--Sobic002G287600 Sobic009G175800--Sobic008G072800 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G175800--Sobic004G299850 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic009G175800--Sobic002G012100 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic009G175800--Sobic001G167000 Sobic004G342200 Sobic004G342200 Sobic009G175800--Sobic004G342200 Sobic009G175800--Sobic006G268900 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic003G386400--Sobic002G275400 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic003G386400--Sobic004G125600 Sobic003G386400--Sobic008G104400 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic003G386400--Sobic003G253900 Sobic001G523932 Sobic001G523932 Sobic003G386400--Sobic001G523932 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic003G386400--Sobic004G125701 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G386400--Sobic003G429600 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic003G386400--Sobic007G099300 Sobic003G386400--Sobic001G517900 Sobic001G507700 Sobic001G507700 Sobic009G064832--Sobic001G507700 Sobic009G064832--Sobic005G048700 Sobic001G424066 Sobic001G424066 Sobic009G064832--Sobic001G424066 Sobic009G064832--Sobic008G187500 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic009G064832--Sobic009G076000 Sobic009G064832--Sobic003G347560 Sobic001G202550 Sobic001G202550 Sobic009G064832--Sobic001G202550 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic009G064832--Sobic002G374000 Sobic009G064832--Sobic006G134300 Sobic005G048700--Sobic001G212900 Sobic005G048700--Sobic006G134300 Sobic005G048700--Sobic008G177100 Sobic005G048700--Sobic006G249600 Sobic005G048700--Sobic004G127600 Sobic005G048700--Sobic002G187900 Sobic005G048700--Sobic003G347560 Sobic005G048700--Sobic003G263900 Sobic005G048700--Sobic002G374000 Sobic009G094200--Sobic008G142200 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G094200--Sobic001G001800 Sobic009G094200--Sobic004G227700 Sobic009G094200--Sobic003G263900 Sobic004G082600 Sobic004G082600 Sobic009G094200--Sobic004G082600 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic009G094200--Sobic001G190900 Sobic009G094200--Sobic007G141900 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic009G094200--Sobic001G038700 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic009G094200--Sobic009G026600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.