Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G053800.2,Sobic.009G053800.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P6R0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06680.2,LOC_Os05g06680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G053800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G175050 - -
2 Sobic.001G388250 - -
3 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
4 Sobic.001G272532 - -
5 Sobic.002G115050 - -
6 Sobic.008G122600 - -
7 Sobic.009G168400 expressed protein -
8 Sobic.010G141800 expressed protein -
9 Sobic.003G136900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K12126: phytochrome-interacting factor 3
10 Sobic.003G357400 - -
11 Sobic.002G005800 protein kinase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G026900 rp1, putative, expressed -
13 Sobic.002G173000 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
14 Sobic.006G182900 expressed protein -
15 Sobic.008G184900 resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G057700 - -
17 Sobic.010G225226 - -
18 Sobic.003G429650 - -
19 Sobic.010G141966 - -
20 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G053800 Sobic009G053800 Sobic002G175050 Sobic002G175050 Sobic009G053800--Sobic002G175050 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic009G053800--Sobic001G388250 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic009G053800--Sobic008G027000 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic009G053800--Sobic001G272532 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic009G053800--Sobic002G115050 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic009G053800--Sobic008G122600 Sobic009G168400 Sobic009G168400 Sobic009G053800--Sobic009G168400 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic009G053800--Sobic010G141800 Sobic003G136900 Sobic003G136900 Sobic009G053800--Sobic003G136900 Sobic002G175050--Sobic009G053800 Sobic002G175050--Sobic002G115050 Sobic002G175050--Sobic010G141800 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G175050--Sobic010G141966 Sobic009G097250 Sobic009G097250 Sobic002G175050--Sobic009G097250 Sobic002G175050--Sobic008G027000 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic002G175050--Sobic009G097200 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic002G175050--Sobic002G097700 Sobic002G175050--Sobic008G122600 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic001G388250--Sobic009G092800 Sobic001G388250--Sobic008G027000 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic001G388250--Sobic010G089100 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic001G388250--Sobic008G055366 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic001G388250--Sobic008G055432 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic001G388250--Sobic009G104201 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic001G388250--Sobic008G101000 Sobic001G388250--Sobic008G122600 Sobic005G019500 Sobic005G019500 Sobic001G388250--Sobic005G019500 Sobic008G027000--Sobic001G272532 Sobic003G020000 Sobic003G020000 Sobic008G027000--Sobic003G020000 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic008G027000--Sobic002G173000 Sobic008G027000--Sobic009G104201 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic008G027000--Sobic010G225226 Sobic008G026900 Sobic008G026900 Sobic008G027000--Sobic008G026900 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic008G027000--Sobic005G090401 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G027000--Sobic004G007100 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic008G027000--Sobic003G056100 Sobic001G272532--Sobic010G225226 Sobic001G272532--Sobic008G027000 Sobic001G288301 Sobic001G288301 Sobic001G272532--Sobic001G288301 Sobic001G272532--Sobic003G020000 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic001G272532--Sobic005G141801 Sobic001G272532--Sobic009G104201 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G272532--Sobic006G088580 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic001G272532--Sobic010G057700 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G272532--Sobic007G178700 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic008G122600--Sobic009G161550 Sobic008G122600--Sobic010G141800 Sobic008G122600--Sobic005G090401 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic008G122600--Sobic006G182900 Sobic002G034100 Sobic002G034100 Sobic008G122600--Sobic002G034100 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic008G122600--Sobic001G287201 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic008G122600--Sobic006G105400 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic008G122600--Sobic005G110200 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic008G122600--Sobic006G048500 Sobic009G168400--Sobic008G026900 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic009G168400--Sobic001G067850 Sobic009G168400--Sobic009G053800 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic009G168400--Sobic003G216100 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic009G168400--Sobic002G243900 Sobic002G318700 Sobic002G318700 Sobic009G168400--Sobic002G318700 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic009G168400--Sobic005G144400 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic009G168400--Sobic002G203200 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic009G168400--Sobic005G039500 Sobic010G141800--Sobic010G141966 Sobic010G141800--Sobic009G161550 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic010G141800--Sobic005G182000 Sobic010G141800--Sobic002G034100 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic010G141800--Sobic009G139000 Sobic010G141800--Sobic008G122600 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic007G020600 Sobic010G141800--Sobic005G090401 Sobic010G141800--Sobic009G092800 Sobic003G136900--Sobic001G272532 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic003G136900--Sobic003G429650 Sobic003G136900--Sobic002G173000 Sobic010G255700 Sobic010G255700 Sobic003G136900--Sobic010G255700 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic003G136900--Sobic002G006600 Sobic003G136900--Sobic010G225226 Sobic001G132300 Sobic001G132300 Sobic003G136900--Sobic001G132300 Sobic003G136900--Sobic006G048500 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic003G136900--Sobic002G144966
Octagon: transcription factors


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