Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G168400.3
Synonym Sb09g023000
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R354
Pfam -
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g16000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT61968
Barley -
Wheat TraesCS1D02G290900 , TraesCS1A02G292700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G026900 rp1, putative, expressed -
2 Sobic.001G067850 - -
3 Sobic.009G053800 expressed protein -
4 Sobic.003G216100 - -
5 Sobic.002G243900 - -
6 Sobic.002G318700 - -
7 Sobic.005G144400 - -
8 Sobic.002G203200 - -
9 Sobic.005G039500 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
10 Sobic.005G110200 - -
11 Sobic.005G110300 - -
12 Sobic.010G057700 - -
13 Sobic.002G154100 expressed protein -
14 Sobic.003G429650 - -
15 Sobic.006G029550 - -
16 Sobic.007G178700 - -
17 Sobic.004G007100 - -
18 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G260000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G140500 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G168400 Sobic009G168400 Sobic008G026900 Sobic008G026900 Sobic009G168400--Sobic008G026900 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic009G168400--Sobic001G067850 Sobic009G053800 Sobic009G053800 Sobic009G168400--Sobic009G053800 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic009G168400--Sobic003G216100 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic009G168400--Sobic002G243900 Sobic002G318700 Sobic002G318700 Sobic009G168400--Sobic002G318700 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic009G168400--Sobic005G144400 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic009G168400--Sobic002G203200 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic009G168400--Sobic005G039500 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic008G026900--Sobic008G027000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic008G026900--Sobic009G161600 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic008G026900--Sobic001G111900 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic008G026900--Sobic002G173000 Sobic001G132300 Sobic001G132300 Sobic008G026900--Sobic001G132300 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic008G026900--Sobic003G113200 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G026900--Sobic007G178700 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G026900--Sobic009G127900 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic008G026900--Sobic001G446900 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic002G175050 Sobic002G175050 Sobic009G053800--Sobic002G175050 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic009G053800--Sobic001G388250 Sobic009G053800--Sobic008G027000 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic009G053800--Sobic001G272532 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic009G053800--Sobic002G115050 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic009G053800--Sobic008G122600 Sobic009G053800--Sobic009G168400 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic009G053800--Sobic010G141800 Sobic003G136900 Sobic003G136900 Sobic009G053800--Sobic003G136900 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G318700--Sobic003G372700 Sobic002G318700--Sobic004G007100 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic002G318700--Sobic008G084700 Sobic002G318700--Sobic002G243900 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G318700--Sobic006G032500 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G318700--Sobic001G214300 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G318700--Sobic002G180666 Sobic002G318700--Sobic002G145101 Sobic002G318700--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic002G203200--Sobic010G124001 Sobic002G203200--Sobic007G037900 Sobic002G203200--Sobic001G067850 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic002G203200--Sobic006G082600 Sobic002G203200--Sobic009G140500 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic002G203200--Sobic005G130200 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic002G203200--Sobic002G165300 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic002G203200--Sobic007G211000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic002G203200--Sobic004G196700 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic005G039500--Sobic003G254000 Sobic005G039500--Sobic001G067850 Sobic005G039500--Sobic003G113200 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic005G039500--Sobic001G261573 Sobic005G039500--Sobic003G429650 Sobic009G212700 Sobic009G212700 Sobic005G039500--Sobic009G212700 Sobic005G039500--Sobic002G243900 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic005G039500--Sobic004G035000 Sobic005G039500--Sobic007G037900
Octagon: transcription factors


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