Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G093900.2,Sobic.009G093900.1,Sobic.009G093900.3
Synonym Sb09g011890
Functional annotation rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R1R7 , A0A1Z5R1S1 , A0A1Z5R1R9
Pfam PF00581
Panther DB PTHR22778 PTHR22778:SF12
NCBI CDD KOG1530; Rhodanese-related sulfurtransferase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40760 : Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g25780.1 : rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043287
Brachypodium KQK08843
Barley -
Wheat TraesCS6A02G068700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G093900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431300 uncharacterized ACR, YagE family COG1723 containing protein, expressed -
2 Sobic.006G055800 mttA/Hcf106 family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G168600 low photochemical bleaching 1 protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G186600 dihydrodipicolinate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01714: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
5 Sobic.008G089500 Fe-S metabolism associated domain containing protein, expressed K03517: quinolinate synthase
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8 Sobic.004G016400 CDP-alcohol phosphatidyltransferase, putative, expressed K00993: ethanolaminephosphotransferase
9 Sobic.004G336000 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
10 Sobic.005G231100 alpha-hemolysin, putative, expressed K08998: uncharacterized protein
11 Sobic.002G218500 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed K00679: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase
12 Sobic.009G148500 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G188600 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
14 Sobic.001G025400 fumarylacetoacetase, putative, expressed K01557: acylpyruvate hydrolase
15 Sobic.007G208300 peptidase, putative, expressed K14677: aminoacylase
16 Sobic.003G151500 CRS2-associated factor 2, chloroplast precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G083400 cytoskeletal protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G167900 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G079800 outer membrane protein, OMP85 family protein, expressed K07277: SAM50, TOB55, outer membrane protein insertion porin family
20 Sobic.008G096800 nnrU, putative, expressed K15744: zeta-carotene isomerase


Gene co-expression network
sample Sobic009G093900 Sobic009G093900 Sobic002G431300 Sobic002G431300 Sobic009G093900--Sobic002G431300 Sobic006G055800 Sobic006G055800 Sobic009G093900--Sobic006G055800 Sobic009G168600 Sobic009G168600 Sobic009G093900--Sobic009G168600 Sobic006G186600 Sobic006G186600 Sobic009G093900--Sobic006G186600 Sobic008G089500 Sobic008G089500 Sobic009G093900--Sobic008G089500 Sobic006G128300 Sobic006G128300 Sobic009G093900--Sobic006G128300 Sobic004G144400 Sobic004G144400 Sobic009G093900--Sobic004G144400 Sobic004G016400 Sobic004G016400 Sobic009G093900--Sobic004G016400 Sobic004G336000 Sobic004G336000 Sobic009G093900--Sobic004G336000 Sobic004G359100 Sobic004G359100 Sobic002G431300--Sobic004G359100 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic002G431300--Sobic003G234900 Sobic004G163800 Sobic004G163800 Sobic002G431300--Sobic004G163800 Sobic002G043600 Sobic002G043600 Sobic002G431300--Sobic002G043600 Sobic002G431300--Sobic006G128300 Sobic002G431300--Sobic006G186600 Sobic006G038500 Sobic006G038500 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Octagon: transcription factors


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