Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G150600.1
Synonym Sb09g021450
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YYN7
Pfam PF06749
Panther DB PTHR31769 PTHR31769:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17210 : Protein of unknown function (DUF1218)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G021700 carrier, putative, expressed -
2 Sobic.007G021800 carrier, putative, expressed -
3 Sobic.004G038700 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR5 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
4 Sobic.005G010100 BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.001G075300 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
6 Sobic.008G011700 anthocyanin 5-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.010G170150 - -
8 Sobic.003G228600 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
9 Sobic.004G011100 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
10 Sobic.004G110700 DNA binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G507100 dirigent, putative, expressed -
12 Sobic.003G140600 peroxidase precursor, putative, expressed -
13 Sobic.003G182200 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1, putative, expressed -
14 Sobic.007G021900 carrier, putative, expressed -
15 Sobic.001G149400 ankyrin repeat domain-containing protein 50, putative, expressed -
16 Sobic.008G121900 expressed protein -
17 Sobic.007G028600 expressed protein -
18 Sobic.002G318200 expressed protein -
19 Sobic.001G264000 dehydrogenase, putative, expressed K00001: E1.1.1.1, alcohol dehydrogenase
20 Sobic.009G035900 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G150600 Sobic009G150600 Sobic007G021700 Sobic007G021700 Sobic009G150600--Sobic007G021700 Sobic007G021800 Sobic007G021800 Sobic009G150600--Sobic007G021800 Sobic004G038700 Sobic004G038700 Sobic009G150600--Sobic004G038700 Sobic005G010100 Sobic005G010100 Sobic009G150600--Sobic005G010100 Sobic001G075300 Sobic001G075300 Sobic009G150600--Sobic001G075300 Sobic008G011700 Sobic008G011700 Sobic009G150600--Sobic008G011700 Sobic010G170150 Sobic010G170150 Sobic009G150600--Sobic010G170150 Sobic003G228600 Sobic003G228600 Sobic009G150600--Sobic003G228600 Sobic004G011100 Sobic004G011100 Sobic009G150600--Sobic004G011100 Sobic003G059000 Sobic003G059000 Sobic007G021700--Sobic003G059000 Sobic007G021700--Sobic003G228600 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic007G021700--Sobic010G088800 Sobic003G399600 Sobic003G399600 Sobic007G021700--Sobic003G399600 Sobic001G318300 Sobic001G318300 Sobic007G021700--Sobic001G318300 Sobic007G021700--Sobic004G038700 Sobic001G542000 Sobic001G542000 Sobic007G021700--Sobic001G542000 Sobic010G241800 Sobic010G241800 Sobic007G021700--Sobic010G241800 Sobic001G231900 Sobic001G231900 Sobic007G021700--Sobic001G231900 Sobic007G021800--Sobic004G038700 Sobic005G080400 Sobic005G080400 Sobic007G021800--Sobic005G080400 Sobic003G140600 Sobic003G140600 Sobic007G021800--Sobic003G140600 Sobic007G021800--Sobic009G150600 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic007G021800--Sobic010G234500 Sobic001G238200 Sobic001G238200 Sobic007G021800--Sobic001G238200 Sobic001G209300 Sobic001G209300 Sobic007G021800--Sobic001G209300 Sobic001G238000 Sobic001G238000 Sobic007G021800--Sobic001G238000 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic007G021800--Sobic004G119800 Sobic004G038700--Sobic003G140600 Sobic004G038700--Sobic005G010100 Sobic004G038700--Sobic003G228600 Sobic003G203600 Sobic003G203600 Sobic004G038700--Sobic003G203600 Sobic004G038700--Sobic001G238000 Sobic004G038700--Sobic001G238200 Sobic004G038700--Sobic005G080400 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic004G038700--Sobic004G110700 Sobic004G038700--Sobic010G234500 Sobic005G010100--Sobic004G038700 Sobic009G035300 Sobic009G035300 Sobic005G010100--Sobic009G035300 Sobic001G264000 Sobic001G264000 Sobic005G010100--Sobic001G264000 Sobic005G010100--Sobic003G203600 Sobic007G165400 Sobic007G165400 Sobic005G010100--Sobic007G165400 Sobic005G010100--Sobic004G011100 Sobic005G010100--Sobic003G228600 Sobic005G010100--Sobic005G080400 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic005G010100--Sobic004G349125 Sobic001G075300--Sobic010G170150 Sobic001G075300--Sobic009G150600 Sobic008G076700 Sobic008G076700 Sobic001G075300--Sobic008G076700 Sobic001G428600 Sobic001G428600 Sobic001G075300--Sobic001G428600 Sobic007G108700 Sobic007G108700 Sobic001G075300--Sobic007G108700 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic001G075300--Sobic010G082100 Sobic010G083300 Sobic010G083300 Sobic001G075300--Sobic010G083300 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic001G075300--Sobic002G185400 Sobic004G212600 Sobic004G212600 Sobic001G075300--Sobic004G212600 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic008G011700--Sobic007G100700 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic008G011700--Sobic003G426500 Sobic001G067100 Sobic001G067100 Sobic008G011700--Sobic001G067100 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic008G011700--Sobic003G182200 Sobic010G066800 Sobic010G066800 Sobic008G011700--Sobic010G066800 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic008G011700--Sobic002G255000 Sobic003G349400 Sobic003G349400 Sobic008G011700--Sobic003G349400 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic008G011700--Sobic003G140700 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic008G011700--Sobic004G306900 Sobic010G170150--Sobic001G075300 Sobic010G170150--Sobic010G082100 Sobic010G170150--Sobic008G076700 Sobic010G170150--Sobic009G150600 Sobic001G349200 Sobic001G349200 Sobic010G170150--Sobic001G349200 Sobic001G348200 Sobic001G348200 Sobic010G170150--Sobic001G348200 Sobic001G396700 Sobic001G396700 Sobic010G170150--Sobic001G396700 Sobic002G373700 Sobic002G373700 Sobic010G170150--Sobic002G373700 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic010G170150--Sobic006G209000 Sobic003G228600--Sobic004G349125 Sobic005G156500 Sobic005G156500 Sobic003G228600--Sobic005G156500 Sobic003G228600--Sobic004G038700 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic003G228600--Sobic006G197100 Sobic001G416200 Sobic001G416200 Sobic003G228600--Sobic001G416200 Sobic003G228600--Sobic008G011700 Sobic003G228600--Sobic001G264000 Sobic003G228600--Sobic001G067100 Sobic006G274933 Sobic006G274933 Sobic003G228600--Sobic006G274933 Sobic005G203200 Sobic005G203200 Sobic004G011100--Sobic005G203200 Sobic003G255500 Sobic003G255500 Sobic004G011100--Sobic003G255500 Sobic001G161500 Sobic001G161500 Sobic004G011100--Sobic001G161500 Sobic004G011100--Sobic009G035300 Sobic004G011100--Sobic001G416200 Sobic001G302600 Sobic001G302600 Sobic004G011100--Sobic001G302600 Sobic004G011100--Sobic004G349125 Sobic004G011100--Sobic005G080400 Sobic004G011100--Sobic005G010100
Octagon: transcription factors


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