Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G057000.1
Synonym Sb10g004930, AGD11
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
OsCML30 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed
UniProt C5Z5A3
Pfam PF13499
Panther DB PTHR10891 PTHR10891:SF618
NCBI CDD KOG0027; Calmodulin and related proteins (EF-Hand superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G43290 : Calcium-binding EF-hand family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07560.1 : OsCML30 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042851
Brachypodium KQK19403
Barley HORVU7Hr1G027770.3 , HORVU7Hr1G027770.2 , HORVU7Hr1G027770.1 , HORVU7Hr1G027770.4 , HORVU7Hr1G027770.5 , HORVU7Hr1G027740.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G057000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.008G028500 expressed protein -
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20 Sobic.002G004200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G057000 Sobic010G057000 Sobic007G105800 Sobic007G105800 Sobic010G057000--Sobic007G105800 Sobic001G543500 Sobic001G543500 Sobic010G057000--Sobic001G543500 Sobic002G228400 Sobic002G228400 Sobic010G057000--Sobic002G228400 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic010G057000--Sobic001G520700 Sobic002G186600 Sobic002G186600 Sobic010G057000--Sobic002G186600 Sobic005G042700 Sobic005G042700 Sobic010G057000--Sobic005G042700 Sobic008G139900 Sobic008G139900 Sobic010G057000--Sobic008G139900 Sobic003G359800 Sobic003G359800 Sobic010G057000--Sobic003G359800 Sobic006G162700 Sobic006G162700 Sobic010G057000--Sobic006G162700 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic007G105800--Sobic004G211501 Sobic007G105800--Sobic001G520700 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic007G105800--Sobic001G493800 Sobic007G105800--Sobic005G042700 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G105800--Sobic007G161450 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic007G105800--Sobic006G162300 Sobic007G105800--Sobic008G139900 Sobic004G001900 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Octagon: transcription factors


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