Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G113500.1
Synonym Sb10g009830, SAG12
Functional annotation vignain precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YII3
Pfam PF08246 PF00112
Panther DB PTHR12411 PTHR12411:SF348
NCBI CDD KOG1543; Cysteine proteinase Cathepsin L
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45890 : senescence-associated gene 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g13090.1 : vignain precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT65238
Barley HORVU4Hr1G006280.3 , HORVU4Hr1G006280.1 , HORVU4Hr1G006280.2 , HORVU2Hr1G023960.1 , HORVU1Hr1G060040.5 , HORVU1Hr1G060040.6 , HORVU1Hr1G060040.1 , HORVU1Hr1G060040.3 , HORVU1Hr1G060040.2
Wheat TraesCS4D02G036900 , TraesCS4D02G037100 , TraesCS4D02G037200 , TraesCS4D02G036700 , TraesCS4D02G037500 , TraesCS4D02G037300 , TraesCS4D02G037000 , TraesCS5B02G523100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G237700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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