Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K044414.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQL5
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31391
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19184 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g09420.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054883 , Zm00025a028565
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G160466 - -
2 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
3 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase
4 Sobic.003G418733 - -
5 Sobic.002G022100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G359500 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.002G103100 - -
8 Sobic.002G122200 - -
9 Sobic.002G163600 - -
10 Sobic.001G000300 - -
11 Sobic.004G185400 - -
12 Sobic.009G130000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endo-1,3@1,4-beta-D-glucanase precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G011700 expressed protein -
14 Sobic.K028000 - -
15 Sobic.004G105700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.007G198500 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.004G213900 trafficking protein particle complex subunit, putative, expressed -
18 Sobic.007G164050 - -
19 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
20 Sobic.002G071350 - -


Gene co-expression network
sample SobicK044414 SobicK044414 Sobic003G160466 Sobic003G160466 SobicK044414--Sobic003G160466 Sobic005G095660 Sobic005G095660 SobicK044414--Sobic005G095660 Sobic001G248200 Sobic001G248200 SobicK044414--Sobic001G248200 Sobic003G418733 Sobic003G418733 SobicK044414--Sobic003G418733 Sobic002G022100 Sobic002G022100 SobicK044414--Sobic002G022100 Sobic001G359500 Sobic001G359500 SobicK044414--Sobic001G359500 Sobic002G103100 Sobic002G103100 SobicK044414--Sobic002G103100 Sobic002G122200 Sobic002G122200 SobicK044414--Sobic002G122200 Sobic002G163600 Sobic002G163600 SobicK044414--Sobic002G163600 Sobic003G160466--SobicK044414 Sobic003G160466--Sobic003G418733 Sobic003G160466--Sobic002G122200 Sobic003G160466--Sobic005G095660 Sobic003G160466--Sobic002G022100 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic003G160466--Sobic001G000300 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic003G160466--Sobic006G061900 Sobic003G160466--Sobic001G248200 Sobic004G125500 Sobic004G125500 Sobic003G160466--Sobic004G125500 Sobic005G095660--Sobic002G122200 Sobic005G095660--Sobic001G248200 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic005G095660--Sobic010G057633 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic005G095660--Sobic002G249300 Sobic005G095660--Sobic001G000300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G095660--Sobic007G010700 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic005G095660--Sobic001G459600 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic005G095660--Sobic003G174400 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic005G095660--Sobic008G081800 Sobic001G248200--Sobic005G095660 Sobic006G030600 Sobic006G030600 Sobic001G248200--Sobic006G030600 Sobic001G396000 Sobic001G396000 Sobic001G248200--Sobic001G396000 Sobic010G203200 Sobic010G203200 Sobic001G248200--Sobic010G203200 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G248200--Sobic004G034600 Sobic001G248200--Sobic008G081800 Sobic004G131040 Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic007G010700 Sobic001G248300 Sobic001G248300 Sobic001G248200--Sobic001G248300 Sobic003G418733--Sobic002G103100 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic003G418733--Sobic008G089800 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic003G418733--Sobic003G164950 Sobic001G317300 Sobic001G317300 Sobic003G418733--Sobic001G317300 Sobic008G003300 Sobic008G003300 Sobic003G418733--Sobic008G003300 Sobic003G418733--Sobic002G022100 Sobic006G060601 Sobic006G060601 Sobic003G418733--Sobic006G060601 Sobic010G078500 Sobic010G078500 Sobic003G418733--Sobic010G078500 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic003G418733--Sobic007G202300 Sobic002G048900 Sobic002G048900 Sobic002G022100--Sobic002G048900 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic002G022100--Sobic007G141380 Sobic002G016100 Sobic002G016100 Sobic002G022100--Sobic002G016100 Sobic002G022100--Sobic002G103100 Sobic002G022100--Sobic003G164950 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G022100--Sobic007G198400 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic002G022100--Sobic004G230700 Sobic009G185100 Sobic009G185100 Sobic002G022100--Sobic009G185100 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic002G022100--Sobic009G260350 Sobic006G181300 Sobic006G181300 Sobic001G359500--Sobic006G181300 Sobic002G338100 Sobic002G338100 Sobic001G359500--Sobic002G338100 Sobic001G504900 Sobic001G504900 Sobic001G359500--Sobic001G504900 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic001G359500--Sobic009G207600 Sobic001G176600 Sobic001G176600 Sobic001G359500--Sobic001G176600 Sobic009G226600 Sobic009G226600 Sobic001G359500--Sobic009G226600 Sobic007G034000 Sobic007G034000 Sobic001G359500--Sobic007G034000 Sobic008G074400 Sobic008G074400 Sobic001G359500--Sobic008G074400 Sobic010G205200 Sobic010G205200 Sobic001G359500--Sobic010G205200 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic002G122200--Sobic005G095660 Sobic007G213925 Sobic007G213925 Sobic002G122200--Sobic007G213925 Sobic002G122200--Sobic003G174400 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic002G122200--Sobic005G150400 Sobic002G122200--Sobic001G248200 Sobic002G122200--Sobic010G057633 Sobic002G122200--Sobic002G249300 Sobic002G190500 Sobic002G190500 Sobic002G122200--Sobic002G190500 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G122200--Sobic001G542150 Sobic007G164050 Sobic007G164050 Sobic002G163600--Sobic007G164050 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic002G163600--Sobic004G096600 Sobic007G065100 Sobic007G065100 Sobic002G163600--Sobic007G065100 Sobic002G181300 Sobic002G181300 Sobic002G163600--Sobic002G181300 Sobic006G276100 Sobic006G276100 Sobic002G163600--Sobic006G276100 Sobic010G000600 Sobic010G000600 Sobic002G163600--Sobic010G000600 Sobic004G181700 Sobic004G181700 Sobic002G163600--Sobic004G181700 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic002G163600--Sobic003G190000 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G163600--Sobic005G075100
Octagon: transcription factors


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