Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G163600.1
Synonym RTFL17, DVL4
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBQ3
Pfam PF08137
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13245 : ROTUNDIFOLIA like 17
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G164050 - -
2 Sobic.004G096600 - -
3 Sobic.007G065100 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
4 Sobic.002G181300 expressed protein -
5 Sobic.006G276100 protein kinase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G000600 BBF1 - 2 Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domains with a F5/8 type C discoidin domain, expressed -
7 Sobic.004G181700 calmodulin binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G190000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G075100 rp3 protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G127001 - -
11 Sobic.001G072500 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
12 Sobic.010G112000 expressed protein K17906: autophagy-related protein 2
13 Sobic.002G345700 insulin-degrading enzyme, putative, expressed K01408: IDE, insulysin
14 Sobic.004G317100 DENN domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G339300 myosin-Vb, putative, expressed K10357: myosin V
16 Sobic.008G082100 - -
17 Sobic.002G169633 - -
18 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
19 Sobic.006G030400 xa21, putative, expressed -
20 Sobic.010G077400 nitrilase, putative, expressed K13566: NIT2, omega-amidase


Gene co-expression network
sample Sobic002G163600 Sobic002G163600 Sobic007G164050 Sobic007G164050 Sobic002G163600--Sobic007G164050 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic002G163600--Sobic004G096600 Sobic007G065100 Sobic007G065100 Sobic002G163600--Sobic007G065100 Sobic002G181300 Sobic002G181300 Sobic002G163600--Sobic002G181300 Sobic006G276100 Sobic006G276100 Sobic002G163600--Sobic006G276100 Sobic010G000600 Sobic010G000600 Sobic002G163600--Sobic010G000600 Sobic004G181700 Sobic004G181700 Sobic002G163600--Sobic004G181700 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic002G163600--Sobic003G190000 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G163600--Sobic005G075100 Sobic007G164050--Sobic002G163600 Sobic005G103200 Sobic005G103200 Sobic007G164050--Sobic005G103200 Sobic007G164050--Sobic006G276100 Sobic007G043100 Sobic007G043100 Sobic007G164050--Sobic007G043100 Sobic010G126200 Sobic010G126200 Sobic007G164050--Sobic010G126200 Sobic002G071350 Sobic002G071350 Sobic007G164050--Sobic002G071350 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic001G036050 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic004G096600--Sobic006G182900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G096600--Sobic010G139000 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G096600--Sobic001G456900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic010G279450 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic004G096600--Sobic004G209600 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic004G096600--Sobic007G116200 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic004G096600--Sobic003G429650 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic004G096600--Sobic006G216800 Sobic002G425700 Sobic002G425700 Sobic007G065100--Sobic002G425700 Sobic007G065100--Sobic002G181300 Sobic003G381200 Sobic003G381200 Sobic007G065100--Sobic003G381200 Sobic008G172300 Sobic008G172300 Sobic007G065100--Sobic008G172300 Sobic001G090500 Sobic001G090500 Sobic007G065100--Sobic001G090500 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic007G065100--Sobic001G498600 Sobic001G072500 Sobic001G072500 Sobic007G065100--Sobic001G072500 Sobic006G153900 Sobic006G153900 Sobic007G065100--Sobic006G153900 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic007G065100--Sobic006G119400 Sobic002G181300--Sobic007G065100 Sobic004G317100 Sobic004G317100 Sobic002G181300--Sobic004G317100 Sobic004G131040 Sobic004G131040 Sobic002G181300--Sobic004G131040 Sobic002G181300--Sobic004G181700 Sobic002G181300--Sobic002G425700 Sobic002G276100 Sobic002G276100 Sobic002G181300--Sobic002G276100 Sobic002G181300--Sobic010G000600 Sobic002G181300--Sobic001G498600 Sobic005G044400 Sobic005G044400 Sobic002G181300--Sobic005G044400 Sobic006G025600 Sobic006G025600 Sobic006G276100--Sobic006G025600 Sobic002G044700 Sobic002G044700 Sobic006G276100--Sobic002G044700 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic006G276100--Sobic006G177900 Sobic004G089200 Sobic004G089200 Sobic006G276100--Sobic004G089200 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic006G276100--Sobic001G250000 Sobic004G252500 Sobic004G252500 Sobic006G276100--Sobic004G252500 Sobic003G108900 Sobic003G108900 Sobic006G276100--Sobic003G108900 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic006G276100--Sobic002G173100 Sobic006G276100--Sobic003G190000 Sobic010G000600--Sobic004G131040 Sobic007G110200 Sobic007G110200 Sobic010G000600--Sobic007G110200 Sobic010G000600--Sobic006G153900 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic010G000600--Sobic001G300100 Sobic009G193500 Sobic009G193500 Sobic010G000600--Sobic009G193500 Sobic004G210900 Sobic004G210900 Sobic010G000600--Sobic004G210900 Sobic010G000600--Sobic003G381200 Sobic010G000600--Sobic002G276100 Sobic010G000600--Sobic002G181300 Sobic004G181700--Sobic004G317100 Sobic004G181700--Sobic002G276100 Sobic001G159400 Sobic001G159400 Sobic004G181700--Sobic001G159400 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic004G181700--Sobic004G181600 Sobic008G146900 Sobic008G146900 Sobic004G181700--Sobic008G146900 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic004G181700--Sobic001G191600 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic004G181700--Sobic009G097200 Sobic006G086500 Sobic006G086500 Sobic004G181700--Sobic006G086500 Sobic004G181700--Sobic008G172300 Sobic001G060500 Sobic001G060500 Sobic003G190000--Sobic001G060500 Sobic002G073200 Sobic002G073200 Sobic003G190000--Sobic002G073200 Sobic003G190000--Sobic002G173100 Sobic010G197000 Sobic010G197000 Sobic003G190000--Sobic010G197000 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic003G190000--Sobic003G203300 Sobic009G014100 Sobic009G014100 Sobic003G190000--Sobic009G014100 Sobic003G190000--Sobic005G075100 Sobic005G142800 Sobic005G142800 Sobic003G190000--Sobic005G142800 Sobic001G219700 Sobic001G219700 Sobic003G190000--Sobic001G219700 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic005G075100--Sobic002G115050 Sobic005G075100--Sobic004G181600 Sobic005G075100--Sobic002G173100 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic005G075100--Sobic002G345700 Sobic005G075100--Sobic003G190000 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic005G075100--Sobic010G141966 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic005G075100--Sobic006G133900 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic005G075100--Sobic006G219600 Sobic005G075100--Sobic009G097200
Octagon: transcription factors


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