Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G181800.3
Synonym BPM1, ATBPM1, Sb01g015806
Functional annotation MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A1Z5S681
Pfam PF00917 PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF169
NCBI CDD KOG1987; Speckle-type POZ protein SPOP and related proteins with TRAF, MATH and BTB/POZ domains
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g29230.1 : MBTB49 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009229 , Zm00025a007105
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G201850 - -
2 Sobic.010G046500 csAtPR5, putative, expressed -
3 Sobic.010G148750 - -
4 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
5 Sobic.005G072000 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
6 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
7 Sobic.005G060900 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G085100 - -
9 Sobic.005G026800 pentatricopeptide, putative, expressed K15634: 2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase
10 Sobic.005G221550 - -
11 Sobic.004G152601 - -
12 Sobic.005G122900 - -
13 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.004G253601 - -
15 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
16 Sobic.010G064500 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G079750 - -
19 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor


Gene co-expression network
sample Sobic001G181800 Sobic001G181800 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic001G181800--Sobic003G201850 Sobic010G046500 Sobic010G046500 Sobic001G181800--Sobic010G046500 Sobic010G148750 Sobic010G148750 Sobic001G181800--Sobic010G148750 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic001G181800--Sobic001G355400 Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic001G181800--Sobic005G072000 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic001G181800--Sobic005G043400 Sobic005G060900 Sobic005G060900 Sobic001G181800--Sobic005G060900 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic001G181800--Sobic005G085100 Sobic005G026800 Sobic005G026800 Sobic001G181800--Sobic005G026800 Sobic003G201850--Sobic010G148750 Sobic003G201850--Sobic005G043400 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G201850--Sobic010G144000 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G201850--Sobic009G101600 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic003G201850--Sobic004G152601 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G201850--Sobic004G200866 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G201850--Sobic005G142200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic003G201850--SobicK010000 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G201850--Sobic008G045600 Sobic003G285400 Sobic003G285400 Sobic010G046500--Sobic003G285400 Sobic010G046500--Sobic010G148750 Sobic003G356700 Sobic003G356700 Sobic010G046500--Sobic003G356700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic010G046500--Sobic003G266700 Sobic010G046500--Sobic003G201850 Sobic010G046500--Sobic001G181800 Sobic005G094200 Sobic005G094200 Sobic010G046500--Sobic005G094200 Sobic006G218700 Sobic006G218700 Sobic010G046500--Sobic006G218700 Sobic010G046500--Sobic004G200866 Sobic010G148750--Sobic003G201850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic010G148750--Sobic008G065400 Sobic010G148750--Sobic004G152601 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic010G148750--Sobic002G431200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic010G148750--Sobic003G366850 Sobic010G148750--Sobic004G200866 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic010G148750--Sobic008G106400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic010G148750--Sobic003G429500 Sobic010G148750--Sobic009G101600 Sobic001G355400--Sobic008G106400 Sobic001G355400--Sobic008G045600 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic001G355400--Sobic005G221550 Sobic001G355400--Sobic002G431200 Sobic001G355400--Sobic005G043400 Sobic001G355400--Sobic004G152601 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic001G355400--Sobic001G271000 Sobic001G355400--Sobic009G101600 Sobic001G355400--Sobic005G085100 Sobic007G071700 Sobic007G071700 Sobic005G072000--Sobic007G071700 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic005G072000--Sobic010G184900 Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic005G072000--Sobic007G020000 Sobic005G072000--Sobic010G144000 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G072000--Sobic008G101000 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic005G072000--Sobic009G221000 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic005G072000--Sobic010G106800 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic005G072000--Sobic007G071950 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic005G072000--Sobic009G092800 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic006G132100 Sobic006G132100 Sobic005G060900--Sobic006G132100 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic005G060900--Sobic005G210300 Sobic010G020200 Sobic010G020200 Sobic005G060900--Sobic010G020200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic005G060900--Sobic005G054300 Sobic001G359400 Sobic001G359400 Sobic005G060900--Sobic001G359400 Sobic010G028950 Sobic010G028950 Sobic005G060900--Sobic010G028950 Sobic010G042900 Sobic010G042900 Sobic005G060900--Sobic010G042900 Sobic005G060900--Sobic010G144000 Sobic005G060900--Sobic010G106800 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic006G241300 Sobic006G241300 Sobic005G026800--Sobic006G241300 Sobic003G208700 Sobic003G208700 Sobic005G026800--Sobic003G208700 Sobic007G068800 Sobic007G068800 Sobic005G026800--Sobic007G068800 Sobic003G408200 Sobic003G408200 Sobic005G026800--Sobic003G408200 Sobic007G063700 Sobic007G063700 Sobic005G026800--Sobic007G063700 Sobic005G026600 Sobic005G026600 Sobic005G026800--Sobic005G026600 Sobic005G110520 Sobic005G110520 Sobic005G026800--Sobic005G110520 Sobic006G019801 Sobic006G019801 Sobic005G026800--Sobic006G019801 Sobic005G026800--Sobic003G201850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.