Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G223300.2,Sobic.001G223300.3,Sobic.001G223300.4
Synonym Sb01g019650
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WZB3
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G223300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G106000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G141300 sensitivity to red light reduced protein 1, putative, expressed -
3 Sobic.002G419000 AGC_AGC_other_RS6K_like.2 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K04688: ribosomal protein S6 kinase beta
4 Sobic.003G247200 pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase, putative, expressed -
5 Sobic.007G080200 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.002G406300 nucleolar protein 5A, putative, expressed K14564: nucleolar protein 56
7 Sobic.002G400300 expressed protein -
8 Sobic.002G014200 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G259000 fimbrin-like protein 2, putative, expressed -
10 Sobic.009G122375 - -
11 Sobic.003G284700 trehalose synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
12 Sobic.002G313900 potassium transporter, putative, expressed -
13 Sobic.006G210700 potassium transporter, putative, expressed -
14 Sobic.004G200400 protein kinase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G188800 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
16 Sobic.002G193300 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
17 Sobic.004G321200 tRNA synthetase class I, putative, expressed K01870: IARS, isoleucyl-tRNA synthetase
18 Sobic.008G021000 exostosin family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G068200 starch synthase III, putative, expressed -
20 Sobic.002G019500 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G223300 Sobic001G223300 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic001G223300--Sobic002G106000 Sobic006G141300 Sobic006G141300 Sobic001G223300--Sobic006G141300 Sobic002G419000 Sobic002G419000 Sobic001G223300--Sobic002G419000 Sobic003G247200 Sobic003G247200 Sobic001G223300--Sobic003G247200 Sobic007G080200 Sobic007G080200 Sobic001G223300--Sobic007G080200 Sobic002G406300 Sobic002G406300 Sobic001G223300--Sobic002G406300 Sobic002G400300 Sobic002G400300 Sobic001G223300--Sobic002G400300 Sobic002G014200 Sobic002G014200 Sobic001G223300--Sobic002G014200 Sobic004G259000 Sobic004G259000 Sobic001G223300--Sobic004G259000 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic002G106000--Sobic007G048900 Sobic002G106200 Sobic002G106200 Sobic002G106000--Sobic002G106200 Sobic007G216800 Sobic007G216800 Sobic002G106000--Sobic007G216800 Sobic007G214800 Sobic007G214800 Sobic002G106000--Sobic007G214800 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic002G106000--Sobic007G118075 Sobic010G090700 Sobic010G090700 Sobic002G106000--Sobic010G090700 Sobic002G106000--Sobic007G080200 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic002G106000--Sobic002G158300 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic002G106000--Sobic002G019500 Sobic001G524000 Sobic001G524000 Sobic006G141300--Sobic001G524000 Sobic004G321200 Sobic004G321200 Sobic006G141300--Sobic004G321200 Sobic002G234200 Sobic002G234200 Sobic006G141300--Sobic002G234200 Sobic002G060400 Sobic002G060400 Sobic006G141300--Sobic002G060400 Sobic006G141300--Sobic002G406300 Sobic008G013200 Sobic008G013200 Sobic006G141300--Sobic008G013200 Sobic002G165700 Sobic002G165700 Sobic006G141300--Sobic002G165700 Sobic006G210700 Sobic006G210700 Sobic006G141300--Sobic006G210700 Sobic004G320700 Sobic004G320700 Sobic006G141300--Sobic004G320700 Sobic006G222500 Sobic006G222500 Sobic002G419000--Sobic006G222500 Sobic002G313900 Sobic002G313900 Sobic002G419000--Sobic002G313900 Sobic008G140400 Sobic008G140400 Sobic002G419000--Sobic008G140400 Sobic004G039300 Sobic004G039300 Sobic002G419000--Sobic004G039300 Sobic001G005600 Sobic001G005600 Sobic002G419000--Sobic001G005600 Sobic009G160600 Sobic009G160600 Sobic002G419000--Sobic009G160600 Sobic008G021000 Sobic008G021000 Sobic002G419000--Sobic008G021000 Sobic007G148400 Sobic007G148400 Sobic002G419000--Sobic007G148400 Sobic001G122000 Sobic001G122000 Sobic002G419000--Sobic001G122000 Sobic009G208100 Sobic009G208100 Sobic003G247200--Sobic009G208100 Sobic003G247200--Sobic001G223300 Sobic003G247200--Sobic004G259000 Sobic004G330000 Sobic004G330000 Sobic003G247200--Sobic004G330000 Sobic003G284700 Sobic003G284700 Sobic003G247200--Sobic003G284700 Sobic006G004500 Sobic006G004500 Sobic003G247200--Sobic006G004500 Sobic003G089000 Sobic003G089000 Sobic003G247200--Sobic003G089000 Sobic007G028100 Sobic007G028100 Sobic003G247200--Sobic007G028100 Sobic001G458100 Sobic001G458100 Sobic003G247200--Sobic001G458100 Sobic007G068200 Sobic007G068200 Sobic007G080200--Sobic007G068200 Sobic006G062600 Sobic006G062600 Sobic007G080200--Sobic006G062600 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic007G080200--Sobic001G075200 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic007G080200--Sobic002G147400 Sobic002G016800 Sobic002G016800 Sobic007G080200--Sobic002G016800 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic007G080200--Sobic001G392700 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic007G080200--Sobic009G119100 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic007G080200--Sobic009G056900 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic007G080200--Sobic001G075201 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic002G406300--Sobic008G055500 Sobic009G194000 Sobic009G194000 Sobic002G406300--Sobic009G194000 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic002G406300--Sobic006G060000 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic002G406300--Sobic003G402800 Sobic010G091400 Sobic010G091400 Sobic002G406300--Sobic010G091400 Sobic001G532400 Sobic001G532400 Sobic002G406300--Sobic001G532400 Sobic002G057400 Sobic002G057400 Sobic002G406300--Sobic002G057400 Sobic003G436000 Sobic003G436000 Sobic002G406300--Sobic003G436000 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic002G406300--Sobic001G501900 Sobic006G268000 Sobic006G268000 Sobic002G400300--Sobic006G268000 Sobic001G152600 Sobic001G152600 Sobic002G400300--Sobic001G152600 Sobic002G363000 Sobic002G363000 Sobic002G400300--Sobic002G363000 Sobic001G217300 Sobic001G217300 Sobic002G400300--Sobic001G217300 Sobic001G186850 Sobic001G186850 Sobic002G400300--Sobic001G186850 Sobic001G163300 Sobic001G163300 Sobic002G400300--Sobic001G163300 Sobic003G223900 Sobic003G223900 Sobic002G400300--Sobic003G223900 Sobic002G400300--Sobic002G106000 Sobic008G098700 Sobic008G098700 Sobic002G400300--Sobic008G098700 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G014200--Sobic006G223800 Sobic010G093400 Sobic010G093400 Sobic002G014200--Sobic010G093400 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic002G014200--Sobic008G010900 Sobic007G095700 Sobic007G095700 Sobic002G014200--Sobic007G095700 Sobic002G014200--Sobic002G419000 Sobic004G101500 Sobic004G101500 Sobic002G014200--Sobic004G101500 Sobic002G014200--Sobic006G222500 Sobic007G116766 Sobic007G116766 Sobic002G014200--Sobic007G116766 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic002G014200--Sobic002G019750 Sobic009G099200 Sobic009G099200 Sobic004G259000--Sobic009G099200 Sobic002G193300 Sobic002G193300 Sobic004G259000--Sobic002G193300 Sobic004G259000--Sobic003G284700 Sobic003G318700 Sobic003G318700 Sobic004G259000--Sobic003G318700 Sobic004G259000--Sobic006G210700 Sobic010G086600 Sobic010G086600 Sobic004G259000--Sobic010G086600 Sobic004G160700 Sobic004G160700 Sobic004G259000--Sobic004G160700 Sobic004G259000--Sobic009G208100 Sobic002G292900 Sobic002G292900 Sobic004G259000--Sobic002G292900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.