Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G021000.1,Sobic.008G021000.2
Synonym Sb08g001860
Functional annotation exostosin family domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PB60
Pfam PF03016
Panther DB PTHR11062 PTHR11062:SF51
NCBI CDD KOG1021; Acetylglucosaminyltransferase EXT1/exostosin 1
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G45400 : exostosin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g03100.1 : exostosin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028996 , Zm00025a053746
Brachypodium KQJ89512
Barley HORVU4Hr1G023550.2 , HORVU4Hr1G023550.1
Wheat TraesCS4B02G129300 , TraesCS4D02G123100 , TraesCS4A02G190100
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.008G021000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G166600 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed -
2 Sobic.006G224300 APO, putative, expressed -
3 Sobic.001G005600 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G212900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G313900 potassium transporter, putative, expressed -
6 Sobic.006G203300 GPR89A, putative, expressed -
7 Sobic.001G135500 HECT-domain domain containing protein, expressed K10588: ubiquitin-protein ligase E3 B
8 Sobic.003G150900 protein transport protein-related, putative, expressed -
9 Sobic.006G224800 expressed protein -
10 Sobic.005G114800 protein transport protein, putative, expressed K14007: protein transport protein SEC24
11 Sobic.005G197100 acyltransferase, putative, expressed K13523: lysophosphatidic acid acyltransferase / lysophosphatidylinositol acyltransferase
12 Sobic.006G139100 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
13 Sobic.001G103300 calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type, putative, expressed K05853: P-type Ca2+ transporter type 2A
14 Sobic.002G245000 HECT-domain domain containing protein, expressed K10591: NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4
15 Sobic.007G042900 BSD domain-containing protein, putative, expressed K03141: TFIIH1, GTF2H1, transcription initiation factor TFIIH subunit 1
16 Sobic.001G478800 expressed protein -
17 Sobic.008G140400 diacylglycerol kinase 1, putative, expressed K00901: dgkA, diacylglycerol kinase (ATP)
18 Sobic.008G185500 zinc finger, putative, expressed -
19 Sobic.009G249700 expressed protein -
20 Sobic.004G257200 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G021000 Sobic008G021000 Sobic009G166600 Sobic009G166600 Sobic008G021000--Sobic009G166600 Sobic006G224300 Sobic006G224300 Sobic008G021000--Sobic006G224300 Sobic001G005600 Sobic001G005600 Sobic008G021000--Sobic001G005600 Sobic003G212900 Sobic003G212900 Sobic008G021000--Sobic003G212900 Sobic002G313900 Sobic002G313900 Sobic008G021000--Sobic002G313900 Sobic006G203300 Sobic006G203300 Sobic008G021000--Sobic006G203300 Sobic001G135500 Sobic001G135500 Sobic008G021000--Sobic001G135500 Sobic003G150900 Sobic003G150900 Sobic008G021000--Sobic003G150900 Sobic006G224800 Sobic006G224800 Sobic008G021000--Sobic006G224800 Sobic009G166600--Sobic002G313900 Sobic005G114800 Sobic005G114800 Sobic009G166600--Sobic005G114800 Sobic006G210700 Sobic006G210700 Sobic009G166600--Sobic006G210700 Sobic005G197100 Sobic005G197100 Sobic009G166600--Sobic005G197100 Sobic009G249700 Sobic009G249700 Sobic009G166600--Sobic009G249700 Sobic009G166600--Sobic008G021000 Sobic003G394200 Sobic003G394200 Sobic009G166600--Sobic003G394200 Sobic002G292900 Sobic002G292900 Sobic009G166600--Sobic002G292900 Sobic006G128100 Sobic006G128100 Sobic009G166600--Sobic006G128100 Sobic006G224300--Sobic008G021000 Sobic004G084500 Sobic004G084500 Sobic006G224300--Sobic004G084500 Sobic009G059400 Sobic009G059400 Sobic006G224300--Sobic009G059400 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic006G224300--Sobic004G345400 Sobic006G224300--Sobic003G394200 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic006G224300--Sobic009G040800 Sobic009G017200 Sobic009G017200 Sobic006G224300--Sobic009G017200 Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic006G224300--Sobic002G115500 Sobic006G224300--Sobic006G203300 Sobic009G160600 Sobic009G160600 Sobic001G005600--Sobic009G160600 Sobic010G129600 Sobic010G129600 Sobic001G005600--Sobic010G129600 Sobic007G042900 Sobic007G042900 Sobic001G005600--Sobic007G042900 Sobic008G140400 Sobic008G140400 Sobic001G005600--Sobic008G140400 Sobic001G005600--Sobic003G150900 Sobic004G323700 Sobic004G323700 Sobic001G005600--Sobic004G323700 Sobic004G068500 Sobic004G068500 Sobic001G005600--Sobic004G068500 Sobic001G005600--Sobic008G021000 Sobic001G161900 Sobic001G161900 Sobic001G005600--Sobic001G161900 Sobic003G212900--Sobic001G135500 Sobic010G077500 Sobic010G077500 Sobic003G212900--Sobic010G077500 Sobic002G422100 Sobic002G422100 Sobic003G212900--Sobic002G422100 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic003G212900--Sobic003G416700 Sobic001G042200 Sobic001G042200 Sobic003G212900--Sobic001G042200 Sobic004G309900 Sobic004G309900 Sobic003G212900--Sobic004G309900 Sobic003G212900--Sobic006G224800 Sobic008G058800 Sobic008G058800 Sobic003G212900--Sobic008G058800 Sobic002G295500 Sobic002G295500 Sobic003G212900--Sobic002G295500 Sobic002G313900--Sobic009G166600 Sobic009G208100 Sobic009G208100 Sobic002G313900--Sobic009G208100 Sobic006G139100 Sobic006G139100 Sobic002G313900--Sobic006G139100 Sobic002G313900--Sobic002G292900 Sobic002G313900--Sobic006G210700 Sobic002G313900--Sobic008G021000 Sobic002G313900--Sobic009G249700 Sobic001G478800 Sobic001G478800 Sobic002G313900--Sobic001G478800 Sobic002G313900--Sobic003G212900 Sobic006G203300--Sobic003G394200 Sobic003G346400 Sobic003G346400 Sobic006G203300--Sobic003G346400 Sobic010G169900 Sobic010G169900 Sobic006G203300--Sobic010G169900 Sobic004G236200 Sobic004G236200 Sobic006G203300--Sobic004G236200 Sobic001G445500 Sobic001G445500 Sobic006G203300--Sobic001G445500 Sobic004G254800 Sobic004G254800 Sobic006G203300--Sobic004G254800 Sobic001G308400 Sobic001G308400 Sobic006G203300--Sobic001G308400 Sobic001G474400 Sobic001G474400 Sobic006G203300--Sobic001G474400 Sobic003G036500 Sobic003G036500 Sobic006G203300--Sobic003G036500 Sobic001G135500--Sobic003G212900 Sobic001G135500--Sobic010G077500 Sobic002G245000 Sobic002G245000 Sobic001G135500--Sobic002G245000 Sobic007G187600 Sobic007G187600 Sobic001G135500--Sobic007G187600 Sobic002G390400 Sobic002G390400 Sobic001G135500--Sobic002G390400 Sobic001G135500--Sobic008G021000 Sobic009G045200 Sobic009G045200 Sobic001G135500--Sobic009G045200 Sobic001G135500--Sobic001G005600 Sobic001G034500 Sobic001G034500 Sobic001G135500--Sobic001G034500 Sobic003G150900--Sobic005G114800 Sobic003G150900--Sobic009G166600 Sobic003G150900--Sobic001G005600 Sobic003G150900--Sobic006G139100 Sobic003G150900--Sobic001G042200 Sobic007G146600 Sobic007G146600 Sobic003G150900--Sobic007G146600 Sobic003G150900--Sobic008G021000 Sobic003G150900--Sobic010G077500 Sobic003G150900--Sobic009G160600 Sobic003G062300 Sobic003G062300 Sobic006G224800--Sobic003G062300 Sobic006G224800--Sobic003G416700 Sobic006G166200 Sobic006G166200 Sobic006G224800--Sobic006G166200 Sobic003G189600 Sobic003G189600 Sobic006G224800--Sobic003G189600 Sobic004G053500 Sobic004G053500 Sobic006G224800--Sobic004G053500 Sobic006G224800--Sobic009G249700 Sobic004G051200 Sobic004G051200 Sobic006G224800--Sobic004G051200 Sobic006G224800--Sobic002G295500 Sobic002G430300 Sobic002G430300 Sobic006G224800--Sobic002G430300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.