Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G103300.3,Sobic.001G103300.1,Sobic.001G103300.2
Synonym ECA3, ATECA3, Sb01g009225
Functional annotation calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type, putative, expressed
UniProt A0A1B6QIC1 , A0A1Z5S547 , A0A1Z5S540
Pfam PF00690 PF00702 PF00689 PF00122 PF00690 PF13246 PF00689 PF00122
Panther DB PTHR24093 PTHR24093:SF353
NCBI CDD -
KEGG Orthology K05853; P-type Ca2+ transporter type 2A
Gene Ontology GO:0000166; nucleotide binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10130 : endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g52090.1 : calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008012
Brachypodium PNT74195 , KQK13383 , KQK13384 , KQK13385
Barley HORVU4Hr1G010200.9 , HORVU4Hr1G010200.8 , HORVU4Hr1G010200.5 , HORVU4Hr1G010200.4 , HORVU4Hr1G010200.7 , HORVU4Hr1G010200.6 , HORVU4Hr1G010200.1 , HORVU4Hr1G010200.3 , HORVU4Hr1G010200.2 , HORVU4Hr1G010200.11 , HORVU4Hr1G010200.10 , HORVU4Hr1G010200.13 , HORVU4Hr1G010200.12 , HORVU4Hr1G010200.14
Wheat TraesCS4D02G060900 , TraesCS4B02G061900 , TraesCS4B02G061900 , TraesCS4D02G060900 , TraesCS4A02G253500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G103300 Sobic001G103300 Sobic001G393700 Sobic001G393700 Sobic001G103300--Sobic001G393700 Sobic005G114800 Sobic005G114800 Sobic001G103300--Sobic005G114800 Sobic005G133800 Sobic005G133800 Sobic001G103300--Sobic005G133800 Sobic001G474400 Sobic001G474400 Sobic001G103300--Sobic001G474400 Sobic006G224800 Sobic006G224800 Sobic001G103300--Sobic006G224800 Sobic002G430300 Sobic002G430300 Sobic001G103300--Sobic002G430300 Sobic002G340900 Sobic002G340900 Sobic001G103300--Sobic002G340900 Sobic006G166200 Sobic006G166200 Sobic001G103300--Sobic006G166200 Sobic002G075900 Sobic002G075900 Sobic001G103300--Sobic002G075900 Sobic001G393700--Sobic002G430300 Sobic001G145400 Sobic001G145400 Sobic001G393700--Sobic001G145400 Sobic010G099800 Sobic010G099800 Sobic001G393700--Sobic010G099800 Sobic001G393700--Sobic005G114800 Sobic001G393700--Sobic006G224800 Sobic001G393700--Sobic001G103300 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic001G393700--Sobic003G405500 Sobic003G240700 Sobic003G240700 Sobic001G393700--Sobic003G240700 Sobic009G045200 Sobic009G045200 Sobic001G393700--Sobic009G045200 Sobic003G150900 Sobic003G150900 Sobic005G114800--Sobic003G150900 Sobic009G166600 Sobic009G166600 Sobic005G114800--Sobic009G166600 Sobic005G110499 Sobic005G110499 Sobic005G114800--Sobic005G110499 Sobic005G114800--Sobic001G393700 Sobic005G114800--Sobic001G474400 Sobic005G114800--Sobic001G103300 Sobic003G394200 Sobic003G394200 Sobic005G114800--Sobic003G394200 Sobic001G445500 Sobic001G445500 Sobic005G114800--Sobic001G445500 Sobic005G114800--Sobic006G224800 Sobic005G133800--Sobic006G166200 Sobic004G053500 Sobic004G053500 Sobic005G133800--Sobic004G053500 Sobic005G133800--Sobic002G430300 Sobic005G133800--Sobic006G224800 Sobic005G133800--Sobic005G110499 Sobic005G133800--Sobic003G405500 Sobic004G256500 Sobic004G256500 Sobic005G133800--Sobic004G256500 Sobic003G062300 Sobic003G062300 Sobic005G133800--Sobic003G062300 Sobic001G058200 Sobic001G058200 Sobic005G133800--Sobic001G058200 Sobic001G474400--Sobic005G110499 Sobic003G397900 Sobic003G397900 Sobic001G474400--Sobic003G397900 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic001G474400--Sobic007G145400 Sobic001G097900 Sobic001G097900 Sobic001G474400--Sobic001G097900 Sobic005G114500 Sobic005G114500 Sobic001G474400--Sobic005G114500 Sobic005G106200 Sobic005G106200 Sobic001G474400--Sobic005G106200 Sobic010G223400 Sobic010G223400 Sobic001G474400--Sobic010G223400 Sobic001G467100 Sobic001G467100 Sobic001G474400--Sobic001G467100 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic001G474400--Sobic006G265600 Sobic006G224800--Sobic003G062300 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic006G224800--Sobic003G416700 Sobic006G224800--Sobic006G166200 Sobic003G189600 Sobic003G189600 Sobic006G224800--Sobic003G189600 Sobic006G224800--Sobic004G053500 Sobic009G249700 Sobic009G249700 Sobic006G224800--Sobic009G249700 Sobic004G051200 Sobic004G051200 Sobic006G224800--Sobic004G051200 Sobic002G295500 Sobic002G295500 Sobic006G224800--Sobic002G295500 Sobic006G224800--Sobic002G430300 Sobic004G141800 Sobic004G141800 Sobic002G430300--Sobic004G141800 Sobic002G430300--Sobic001G393700 Sobic002G430300--Sobic003G405500 Sobic003G152400 Sobic003G152400 Sobic002G430300--Sobic003G152400 Sobic002G430300--Sobic001G145400 Sobic002G430300--Sobic005G133800 Sobic001G087600 Sobic001G087600 Sobic002G430300--Sobic001G087600 Sobic002G430300--Sobic006G224800 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic002G430300--Sobic002G145800 Sobic008G124800 Sobic008G124800 Sobic002G340900--Sobic008G124800 Sobic001G437400 Sobic001G437400 Sobic002G340900--Sobic001G437400 Sobic006G021700 Sobic006G021700 Sobic002G340900--Sobic006G021700 Sobic002G340900--Sobic004G053500 Sobic001G117800 Sobic001G117800 Sobic002G340900--Sobic001G117800 Sobic009G118900 Sobic009G118900 Sobic002G340900--Sobic009G118900 Sobic003G029600 Sobic003G029600 Sobic002G340900--Sobic003G029600 Sobic004G223300 Sobic004G223300 Sobic002G340900--Sobic004G223300 Sobic002G340900--Sobic001G474400 Sobic006G166200--Sobic005G133800 Sobic006G166200--Sobic004G053500 Sobic006G166200--Sobic008G124800 Sobic006G166200--Sobic003G405500 Sobic006G166200--Sobic006G224800 Sobic006G166200--Sobic001G145400 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic006G166200--Sobic010G059500 Sobic002G235200 Sobic002G235200 Sobic006G166200--Sobic002G235200 Sobic009G201700 Sobic009G201700 Sobic006G166200--Sobic009G201700 Sobic002G075900--Sobic003G397900 Sobic001G520300 Sobic001G520300 Sobic002G075900--Sobic001G520300 Sobic002G075900--Sobic006G265600 Sobic002G075900--Sobic004G141800 Sobic008G103300 Sobic008G103300 Sobic002G075900--Sobic008G103300 Sobic002G075900--Sobic001G474400 Sobic008G129600 Sobic008G129600 Sobic002G075900--Sobic008G129600 Sobic002G075900--Sobic005G133800 Sobic003G046300 Sobic003G046300 Sobic002G075900--Sobic003G046300
Octagon: transcription factors


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