Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G393700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QNN1
Pfam -
Panther DB PTHR31515 PTHR31515:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16180 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013643 , Zm00025a047654 , Zm00025a049276 , Zm00025a002178 , Zm00025a031721
Brachypodium KQK21976 , KQK21977
Barley -
Wheat TraesCS4A02G122900 , TraesCS4A02G122900 , TraesCS4D02G183000 , TraesCS4B02G182700 , TraesCS4B02G182700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G430300 HEAT repeat family protein, putative, expressed K06100: symplekin
2 Sobic.001G145400 threonyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01868: TARS, threonyl-tRNA synthetase
3 Sobic.010G099800 growth regulator related protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G114800 protein transport protein, putative, expressed K14007: protein transport protein SEC24
5 Sobic.006G224800 expressed protein -
6 Sobic.001G103300 calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type, putative, expressed K05853: P-type Ca2+ transporter type 2A
7 Sobic.003G405500 mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative, expressed K01228: mannosyl-oligosaccharide glucosidase
8 Sobic.003G240700 peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin, putative, expressed -
9 Sobic.009G045200 double-stranded RNA binding motif containing protein, expressed -
10 Sobic.001G474400 conserved oligomeric Golgi complex component 8, putative, expressed -
11 Sobic.004G141800 expressed protein -
12 Sobic.010G278600 FG-GAP repeat-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G115500 bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase, putative, expressed K13998: dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
14 Sobic.003G227100 adaptin, putative, expressed -
15 Sobic.006G166200 Alg9-like mannosyltransferase protein, putative, expressed K03847: alpha-1,6-mannosyltransferase
16 Sobic.001G291800 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, putative, expressed K03253: translation initiation factor 3 subunit B
17 Sobic.008G124800 expressed protein -
18 Sobic.001G170100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G236800 MAG2, putative, expressed -
20 Sobic.001G369000 adapitin protein, putative, expressed K12392: AP-1 complex subunit beta-1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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