Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G267200.1
Synonym
Functional annotation arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QL82
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07030.1 : arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G267200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
2 Sobic.008G020200 UDP-N-acetylglucosamine transferase subunit ALG14, putative, expressed K07441: beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
3 Sobic.009G042700 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
4 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
5 Sobic.004G048000 DUF292 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G002400 expressed protein -
7 Sobic.008G025900 expressed protein -
8 Sobic.008G189400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G267233 - -
11 Sobic.003G056100 transcription initiation factor, putative, expressed K03129: transcription initiation factor TFIID subunit 4
12 Sobic.002G224450 - -
13 Sobic.005G019200 rp3 protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G187400 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
15 Sobic.004G283000 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G184700 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
17 Sobic.009G157500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
18 Sobic.006G052500 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component, mitochondrial precursor, putative, expressed K00164: OGDH, 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component
19 Sobic.007G144200 - -
20 Sobic.010G260500 pre-mRNA-splicing factor syf2, putative, expressed K12868: pre-mRNA-splicing factor SYF2


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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