Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G331700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMF9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G009650 - -
2 Sobic.001G163732 - -
3 Sobic.006G006200 expressed protein -
4 Sobic.004G216100 cysteine proteinase inhibitor precursor, putative, expressed -
5 Sobic.001G443600 expressed protein -
6 Sobic.001G227700 expressed protein -
7 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
8 Sobic.007G193500 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GW8/OsPL16(Ortholog in rice:Wang et al., 2012)"(PubMedID : 31659910)@OsSPL16 - SBP-box gene family member, expressed -
9 Sobic.006G069400 expressed protein -
10 Sobic.002G267300 expressed protein -
11 Sobic.010G081800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
12 Sobic.009G172000 FAR1 family protein, expressed -
13 Sobic.005G085800 expressed protein -
14 Sobic.006G084900 - -
15 Sobic.004G277501 - -
16 Sobic.008G045232 - -
17 Sobic.001G427600 ZOS3-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.004G063900 expressed protein -
20 Sobic.001G152500 OsFBX387 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G331700 Sobic001G331700 Sobic003G009650 Sobic003G009650 Sobic001G331700--Sobic003G009650 Sobic001G163732 Sobic001G163732 Sobic001G331700--Sobic001G163732 Sobic006G006200 Sobic006G006200 Sobic001G331700--Sobic006G006200 Sobic004G216100 Sobic004G216100 Sobic001G331700--Sobic004G216100 Sobic001G443600 Sobic001G443600 Sobic001G331700--Sobic001G443600 Sobic001G227700 Sobic001G227700 Sobic001G331700--Sobic001G227700 Sobic003G212800 Sobic003G212800 Sobic001G331700--Sobic003G212800 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic001G331700--Sobic007G193500 Sobic006G069400 Sobic006G069400 Sobic001G331700--Sobic006G069400 Sobic003G009650--Sobic004G216100 Sobic003G009650--Sobic001G163732 Sobic003G009650--Sobic006G006200 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic003G009650--Sobic002G267300 Sobic003G009650--Sobic001G331700 Sobic002G312100 Sobic002G312100 Sobic003G009650--Sobic002G312100 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic003G009650--Sobic002G067050 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic003G009650--Sobic005G085800 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic003G009650--Sobic008G053000 Sobic001G163732--Sobic006G006200 Sobic001G163732--Sobic001G443600 Sobic001G163732--Sobic003G009650 Sobic004G277501 Sobic004G277501 Sobic001G163732--Sobic004G277501 Sobic001G163732--Sobic004G216100 Sobic001G163732--Sobic001G331700 Sobic004G316100 Sobic004G316100 Sobic001G163732--Sobic004G316100 Sobic003G232800 Sobic003G232800 Sobic001G163732--Sobic003G232800 Sobic001G461600 Sobic001G461600 Sobic001G163732--Sobic001G461600 Sobic006G006200--Sobic001G163732 Sobic006G006200--Sobic001G443600 Sobic006G006200--Sobic003G009650 Sobic006G006200--Sobic004G277501 Sobic006G006200--Sobic004G216100 Sobic006G006200--Sobic004G316100 Sobic006G006200--Sobic003G232800 Sobic006G006200--Sobic001G331700 Sobic003G175300 Sobic003G175300 Sobic006G006200--Sobic003G175300 Sobic004G216100--Sobic003G009650 Sobic004G216100--Sobic002G267300 Sobic004G216100--Sobic001G163732 Sobic004G216100--Sobic006G006200 Sobic004G216100--Sobic002G067050 Sobic002G237600 Sobic002G237600 Sobic004G216100--Sobic002G237600 Sobic004G216100--Sobic002G312100 Sobic004G216100--Sobic007G193500 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic004G216100--Sobic002G085700 Sobic001G443600--Sobic001G163732 Sobic001G443600--Sobic006G006200 Sobic001G443600--Sobic004G277501 Sobic001G443600--Sobic004G316100 Sobic001G443600--Sobic003G232800 Sobic003G091700 Sobic003G091700 Sobic001G443600--Sobic003G091700 Sobic001G443600--Sobic001G331700 Sobic001G443600--Sobic001G227700 Sobic001G443600--Sobic003G175300 Sobic001G175100 Sobic001G175100 Sobic001G227700--Sobic001G175100 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic001G227700--Sobic004G003700 Sobic009G058100 Sobic009G058100 Sobic001G227700--Sobic009G058100 Sobic001G227700--Sobic001G443600 Sobic006G232900 Sobic006G232900 Sobic001G227700--Sobic006G232900 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic001G227700--Sobic005G168400 Sobic007G147200 Sobic007G147200 Sobic001G227700--Sobic007G147200 Sobic004G237000 Sobic004G237000 Sobic001G227700--Sobic004G237000 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic001G227700--Sobic001G143400 Sobic003G212800--Sobic006G069400 Sobic003G212800--Sobic007G193500 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic003G212800--Sobic009G133100 Sobic003G212800--Sobic005G085800 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic003G212800--Sobic002G384800 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic003G212800--Sobic004G290400 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic003G212800--Sobic001G482500 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic003G212800--Sobic008G045232 Sobic003G212800--Sobic002G267300 Sobic007G193500--Sobic008G045232 Sobic007G193500--Sobic005G085800 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic007G193500--Sobic002G289701 Sobic007G193500--Sobic008G053000 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic007G193500--Sobic005G030200 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic007G193500--Sobic001G152500 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic007G193500--Sobic001G189800 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic007G193500--Sobic007G007650 Sobic007G193500--Sobic001G482500 Sobic006G069400--Sobic003G212800 Sobic006G069400--Sobic007G193500 Sobic006G069400--Sobic009G133100 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic006G069400--Sobic001G022000 Sobic006G069400--Sobic005G030200 Sobic006G069400--Sobic008G045232 Sobic006G069400--Sobic005G085800 Sobic006G069400--Sobic002G289701 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic006G069400--Sobic009G196100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.