Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G339400.1
Synonym Sb01g032650
Functional annotation proline-rich protein, putative, expressed
UniProt C5WWM3
Pfam PF00403
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF91
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16380 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g29920.1 : proline-rich protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002844
Brachypodium PNT77619 , KQK22251
Barley -
Wheat TraesCS4D02G111100 , TraesCS4A02G210100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G339400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G151300 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
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8 Sobic.009G175200 expressed protein -
9 Sobic.001G195000 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
10 Sobic.007G210900 expressed protein -
11 Sobic.003G176200 - -
12 Sobic.009G026200 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G162500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed K05280: flavonoid 3'-monooxygenase
14 Sobic.007G113900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G117100 expressed protein -
16 Sobic.004G154600 expressed protein -
17 Sobic.004G203900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
18 Sobic.009G248900 expressed protein -
19 Sobic.004G243400 copper methylamine oxidase precursor, putative, expressed K00276: AOC3, AOC2, primary-amine oxidase
20 Sobic.009G064900 serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit Bgamma isoform, putative, expressed K11584: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'


Gene co-expression network
sample Sobic001G339400 Sobic001G339400 Sobic003G151300 Sobic003G151300 Sobic001G339400--Sobic003G151300 Sobic009G102800 Sobic009G102800 Sobic001G339400--Sobic009G102800 Sobic001G535400 Sobic001G535400 Sobic001G339400--Sobic001G535400 Sobic004G205500 Sobic004G205500 Sobic001G339400--Sobic004G205500 Sobic005G169700 Sobic005G169700 Sobic001G339400--Sobic005G169700 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic001G339400--Sobic003G174900 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic001G339400--Sobic003G420800 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic001G339400--Sobic009G175200 Sobic001G195000 Sobic001G195000 Sobic001G339400--Sobic001G195000 Sobic009G026200 Sobic009G026200 Sobic003G151300--Sobic009G026200 Sobic008G008400 Sobic008G008400 Sobic003G151300--Sobic008G008400 Sobic008G174800 Sobic008G174800 Sobic003G151300--Sobic008G174800 Sobic010G224900 Sobic010G224900 Sobic003G151300--Sobic010G224900 Sobic009G162500 Sobic009G162500 Sobic003G151300--Sobic009G162500 Sobic001G107200 Sobic001G107200 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Octagon: transcription factors


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