Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G347400.2,Sobic.001G347400.1
Synonym Sb01g033295
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S970 , A0A1B6QMS7
Pfam -
Panther DB PTHR33676 PTHR33676:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002762
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G347400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G417700 DUF623 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G009250 - -
3 Sobic.001G395000 expressed protein -
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8 Sobic.007G060550 - -
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10 Sobic.008G140500 expressed protein -
11 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G087400 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@anther-specific proline-rich protein APG precursor, putative, expressed -
13 Sobic.006G011800 - -
14 Sobic.002G046300 expressed protein -
15 Sobic.001G234000 expressed protein -
16 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G020150 - -
18 Sobic.003G165401 - -
19 Sobic.004G055901 - -
20 Sobic.004G200400 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G347400 Sobic001G347400 Sobic002G417700 Sobic002G417700 Sobic001G347400--Sobic002G417700 Sobic010G009250 Sobic010G009250 Sobic001G347400--Sobic010G009250 Sobic001G395000 Sobic001G395000 Sobic001G347400--Sobic001G395000 Sobic006G094000 Sobic006G094000 Sobic001G347400--Sobic006G094000 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic001G347400--Sobic004G187200 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic001G347400--Sobic009G029900 Sobic001G130100 Sobic001G130100 Sobic001G347400--Sobic001G130100 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic001G347400--Sobic007G060550 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic001G347400--Sobic007G064400 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic002G417700--Sobic007G156400 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic002G417700--Sobic007G072700 Sobic002G236300 Sobic002G236300 Sobic002G417700--Sobic002G236300 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic002G417700--Sobic004G264800 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic002G417700--Sobic004G282200 Sobic002G417700--Sobic007G064400 Sobic002G417700--Sobic001G130100 Sobic002G417700--Sobic001G347400 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic002G417700--Sobic001G371650 Sobic004G200400 Sobic004G200400 Sobic010G009250--Sobic004G200400 Sobic009G122375 Sobic009G122375 Sobic010G009250--Sobic009G122375 Sobic010G009250--Sobic004G187200 Sobic003G412200 Sobic003G412200 Sobic010G009250--Sobic003G412200 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic010G009250--Sobic005G052100 Sobic002G104300 Sobic002G104300 Sobic010G009250--Sobic002G104300 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic010G009250--Sobic001G330600 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic010G009250--Sobic004G090200 Sobic001G083900 Sobic001G083900 Sobic010G009250--Sobic001G083900 Sobic001G395000--Sobic001G347400 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic001G395000--Sobic004G055901 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic001G395000--Sobic002G124832 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic001G395000--Sobic003G137000 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic001G395000--Sobic008G140500 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic001G395000--Sobic003G165401 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic001G395000--Sobic009G041301 Sobic002G378500 Sobic002G378500 Sobic001G395000--Sobic002G378500 Sobic001G395000--Sobic004G187200 Sobic001G177400 Sobic001G177400 Sobic006G094000--Sobic001G177400 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic006G094000--Sobic003G331200 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic006G094000--Sobic004G020150 Sobic009G037600 Sobic009G037600 Sobic006G094000--Sobic009G037600 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic006G094000--Sobic008G088812 Sobic006G272100 Sobic006G272100 Sobic006G094000--Sobic006G272100 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic006G094000--Sobic008G119100 Sobic001G505900 Sobic001G505900 Sobic006G094000--Sobic001G505900 Sobic006G094000--Sobic007G060550 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic004G187200--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic004G187200 Sobic009G029900--Sobic001G530400 Sobic009G029900--Sobic001G234000 Sobic009G029900--Sobic004G090300 Sobic006G011800 Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G011800 Sobic009G029900--Sobic006G279000 Sobic009G029900--Sobic007G064400 Sobic009G029900--Sobic004G090200 Sobic009G029900--Sobic009G041301 Sobic001G130100--Sobic002G417700 Sobic001G130100--Sobic001G347400 Sobic003G014900 Sobic003G014900 Sobic001G130100--Sobic003G014900 Sobic004G109400 Sobic004G109400 Sobic001G130100--Sobic004G109400 Sobic001G228400 Sobic001G228400 Sobic001G130100--Sobic001G228400 Sobic001G130100--Sobic007G064400 Sobic001G130100--Sobic010G009250 Sobic002G326900 Sobic002G326900 Sobic001G130100--Sobic002G326900 Sobic001G130100--Sobic001G177400 Sobic007G060550--Sobic008G140500 Sobic007G060550--Sobic003G165401 Sobic007G060550--Sobic007G072700 Sobic007G060550--Sobic003G137000 Sobic007G060550--Sobic002G124832 Sobic007G060550--Sobic004G020150 Sobic007G060550--Sobic004G264800 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic007G060550--Sobic006G142925 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic007G060550--Sobic009G239400 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic002G147500
Octagon: transcription factors


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