Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G395000.1
Synonym Sb01g037400
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WMG2
Pfam -
Panther DB PTHR35096 PTHR35096:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06320 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002153
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G395000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G347400 expressed protein -
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4 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
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17 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G072700 - -
19 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
20 Sobic.004G264800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G395000 Sobic001G395000 Sobic001G347400 Sobic001G347400 Sobic001G395000--Sobic001G347400 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic001G395000--Sobic004G055901 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic001G395000--Sobic002G124832 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic001G395000--Sobic003G137000 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic001G395000--Sobic008G140500 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic001G395000--Sobic003G165401 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic001G395000--Sobic009G041301 Sobic002G378500 Sobic002G378500 Sobic001G395000--Sobic002G378500 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic001G395000--Sobic004G187200 Sobic002G417700 Sobic002G417700 Sobic001G347400--Sobic002G417700 Sobic010G009250 Sobic010G009250 Sobic001G347400--Sobic010G009250 Sobic001G347400--Sobic001G395000 Sobic006G094000 Sobic006G094000 Sobic001G347400--Sobic006G094000 Sobic001G347400--Sobic004G187200 Sobic009G029900 Sobic009G029900 Sobic001G347400--Sobic009G029900 Sobic001G130100 Sobic001G130100 Sobic001G347400--Sobic001G130100 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic001G347400--Sobic007G060550 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic001G347400--Sobic007G064400 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic002G124832--Sobic003G137000 Sobic002G124832--Sobic003G165401 Sobic002G124832--Sobic002G069300 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic002G124832--Sobic002G014100 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic002G124832--Sobic006G142925 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic002G124832--Sobic010G143666 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic008G140500 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic002G124832--Sobic002G202050 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic004G068000 Sobic004G068000 Sobic009G041301--Sobic004G068000 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic009G041301--Sobic001G234000 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic001G530400 Sobic009G041301--Sobic009G029900 Sobic004G105300 Sobic004G105300 Sobic009G041301--Sobic004G105300 Sobic003G302466 Sobic003G302466 Sobic009G041301--Sobic003G302466 Sobic010G198700 Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic010G198700 Sobic009G041301--Sobic004G187200 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic009G041301--Sobic004G090300 Sobic002G378500--Sobic002G124832 Sobic002G378500--Sobic003G137000 Sobic002G378500--Sobic004G055901 Sobic002G378500--Sobic001G395000 Sobic002G378500--Sobic003G165401 Sobic002G378500--Sobic010G192200 Sobic002G378500--Sobic008G140500 Sobic003G155700 Sobic003G155700 Sobic002G378500--Sobic003G155700 Sobic008G102466 Sobic008G102466 Sobic002G378500--Sobic008G102466 Sobic004G187200--Sobic001G234000 Sobic004G187200--Sobic004G090300 Sobic004G187200--Sobic009G029900 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic004G187200--Sobic004G090200 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G187200--Sobic002G147500 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic006G279000 Sobic004G187200--Sobic007G064400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G330600 Sobic004G187200--Sobic001G530400
Octagon: transcription factors


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