Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G378500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QFP1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G124832 - -
2 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G055901 - -
4 Sobic.001G395000 expressed protein -
5 Sobic.003G165401 - -
6 Sobic.010G192200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
7 Sobic.008G140500 expressed protein -
8 Sobic.003G155700 transcription initiation factor IID, 18kD subunit family protein, expressed K03127: transcription initiation factor TFIID subunit 13
9 Sobic.008G102466 - -
10 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G062701 - -
12 Sobic.009G047150 - -
13 Sobic.005G191350 - K13963: serpin B
14 Sobic.002G069300 DNA binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G041301 - -
16 Sobic.005G228250 - -
17 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
18 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G029900 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
20 Sobic.006G142925 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G378500 Sobic002G378500 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic002G378500--Sobic002G124832 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic002G378500--Sobic003G137000 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic002G378500--Sobic004G055901 Sobic001G395000 Sobic001G395000 Sobic002G378500--Sobic001G395000 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic002G378500--Sobic003G165401 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic002G378500--Sobic010G192200 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic002G378500--Sobic008G140500 Sobic003G155700 Sobic003G155700 Sobic002G378500--Sobic003G155700 Sobic008G102466 Sobic008G102466 Sobic002G378500--Sobic008G102466 Sobic002G124832--Sobic003G137000 Sobic002G124832--Sobic003G165401 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic002G124832--Sobic002G069300 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic002G124832--Sobic002G014100 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic002G124832--Sobic006G142925 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic002G124832--Sobic010G143666 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic008G140500 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic002G124832--Sobic002G202050 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic001G347400 Sobic001G347400 Sobic001G395000--Sobic001G347400 Sobic001G395000--Sobic004G055901 Sobic001G395000--Sobic002G124832 Sobic001G395000--Sobic003G137000 Sobic001G395000--Sobic008G140500 Sobic001G395000--Sobic003G165401 Sobic009G041301 Sobic009G041301 Sobic001G395000--Sobic009G041301 Sobic001G395000--Sobic002G378500 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic001G395000--Sobic004G187200 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic010G192200--Sobic004G055901 Sobic010G192200--Sobic002G057700 Sobic010G192200--Sobic003G165401 Sobic010G192200--Sobic008G140500 Sobic010G192200--Sobic003G137000 Sobic010G192200--Sobic010G133275 Sobic010G192200--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic002G124832 Sobic010G192200--Sobic002G344800 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic003G155700--Sobic010G143666 Sobic003G155700--Sobic002G014100 Sobic003G155700--Sobic003G281000 Sobic003G155700--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G155700--Sobic006G247200 Sobic003G155700--Sobic002G344800 Sobic008G102466--Sobic002G202050 Sobic008G102466--Sobic006G247200 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic008G102466--Sobic002G382200 Sobic008G102466--Sobic002G344800 Sobic008G102466--Sobic010G143666 Sobic008G102466--Sobic002G014100
Octagon: transcription factors


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