Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G397850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAF7
Pfam -
Panther DB PTHR34366 PTHR34366:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19170.1 : GCRP7 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002108
Brachypodium PNT77546 , PNT77547
Barley HORVU4Hr1G054390.2 , HORVU4Hr1G054390.1
Wheat TraesCS4A02G118800 , TraesCS4D02G187000 , TraesCS4B02G185700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G063066 - -
2 Sobic.004G089100 expressed protein -
3 Sobic.007G216001 - -
4 Sobic.006G083201 - -
5 Sobic.002G379700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G299200 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
7 Sobic.009G035900 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -
8 Sobic.002G168400 RGH2B, putative, expressed -
9 Sobic.005G010100 BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.009G015200 - -
11 Sobic.004G046400 rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G121900 expressed protein -
13 Sobic.001G264000 dehydrogenase, putative, expressed K00001: E1.1.1.1, alcohol dehydrogenase
14 Sobic.005G048400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
15 Sobic.002G068000 expressed protein -
16 Sobic.004G038700 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR5 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
17 Sobic.006G019700 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G542000 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.005G014000 WRKY64, expressed -
20 Sobic.003G059000 POEI43 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G397850 Sobic001G397850 Sobic010G063066 Sobic010G063066 Sobic001G397850--Sobic010G063066 Sobic004G089100 Sobic004G089100 Sobic001G397850--Sobic004G089100 Sobic007G216001 Sobic007G216001 Sobic001G397850--Sobic007G216001 Sobic006G083201 Sobic006G083201 Sobic001G397850--Sobic006G083201 Sobic002G379700 Sobic002G379700 Sobic001G397850--Sobic002G379700 Sobic001G299200 Sobic001G299200 Sobic001G397850--Sobic001G299200 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic001G397850--Sobic009G035900 Sobic002G168400 Sobic002G168400 Sobic001G397850--Sobic002G168400 Sobic005G010100 Sobic005G010100 Sobic001G397850--Sobic005G010100 Sobic003G059000 Sobic003G059000 Sobic010G063066--Sobic003G059000 Sobic007G087600 Sobic007G087600 Sobic010G063066--Sobic007G087600 Sobic007G021700 Sobic007G021700 Sobic010G063066--Sobic007G021700 Sobic001G308600 Sobic001G308600 Sobic010G063066--Sobic001G308600 Sobic010G106500 Sobic010G106500 Sobic010G063066--Sobic010G106500 Sobic001G318000 Sobic001G318000 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Octagon: transcription factors


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