Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G403800.4,Sobic.001G403800.7,Sobic.001G403800.2,Sobic.001G403800.3,Sobic.001G403800.5,Sobic.001G403800.6
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SAI5 , A0A1B6QNR6
Pfam -
Panther DB PTHR15071
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40316 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g18540.4,LOC_Os03g18540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002035
Brachypodium KQK22095
Barley HORVU4Hr1G055300.7 , HORVU4Hr1G055300.6 , HORVU4Hr1G055300.5 , HORVU4Hr1G055300.4 , HORVU4Hr1G055300.3 , HORVU4Hr1G055300.2 , HORVU4Hr1G055300.1 , HORVU4Hr1G055300.9 , HORVU4Hr1G055300.8 , HORVU4Hr1G055300.19 , HORVU4Hr1G055300.18 , HORVU4Hr1G055300.17 , HORVU4Hr1G055300.16 , HORVU4Hr1G055300.15 , HORVU4Hr1G055300.14 , HORVU4Hr1G055300.13 , HORVU4Hr1G055300.12 , HORVU4Hr1G055300.11 , HORVU4Hr1G055300.10
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G403800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.009G249301 - -
18 Sobic.001G197500 - -
19 Sobic.002G118400 - -
20 Sobic.003G051800 expressed protein K03024: RPC7, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7


Gene co-expression network
sample Sobic001G403800 Sobic001G403800 Sobic002G189300 Sobic002G189300 Sobic001G403800--Sobic002G189300 Sobic006G098400 Sobic006G098400 Sobic001G403800--Sobic006G098400 Sobic001G527200 Sobic001G527200 Sobic001G403800--Sobic001G527200 Sobic004G269900 Sobic004G269900 Sobic001G403800--Sobic004G269900 Sobic010G110050 Sobic010G110050 Sobic001G403800--Sobic010G110050 Sobic003G271300 Sobic003G271300 Sobic001G403800--Sobic003G271300 Sobic002G022600 Sobic002G022600 Sobic001G403800--Sobic002G022600 Sobic005G073500 Sobic005G073500 Sobic001G403800--Sobic005G073500 Sobic004G158000 Sobic004G158000 Sobic001G403800--Sobic004G158000 Sobic002G189300--Sobic001G403800 Sobic002G189300--Sobic004G269900 Sobic002G189300--Sobic002G022600 Sobic002G189300--Sobic006G098400 Sobic002G189300--Sobic003G271300 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic002G189300--Sobic010G074960 Sobic008G042100 Sobic008G042100 Sobic002G189300--Sobic008G042100 Sobic008G127200 Sobic008G127200 Sobic002G189300--Sobic008G127200 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic002G189300--Sobic009G194600 Sobic006G098400--Sobic002G022600 Sobic006G098400--Sobic004G269900 Sobic006G098400--Sobic002G189300 Sobic006G098400--Sobic001G403800 Sobic003G037200 Sobic003G037200 Sobic006G098400--Sobic003G037200 Sobic006G208050 Sobic006G208050 Sobic006G098400--Sobic006G208050 Sobic001G404000 Sobic001G404000 Sobic006G098400--Sobic001G404000 Sobic001G079600 Sobic001G079600 Sobic006G098400--Sobic001G079600 Sobic003G047300 Sobic003G047300 Sobic006G098400--Sobic003G047300 Sobic002G359200 Sobic002G359200 Sobic001G527200--Sobic002G359200 Sobic004G011201 Sobic004G011201 Sobic001G527200--Sobic004G011201 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic001G527200--Sobic005G002500 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic001G527200--Sobic001G308450 Sobic007G165200 Sobic007G165200 Sobic001G527200--Sobic007G165200 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic001G527200--Sobic006G065200 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic001G527200--Sobic010G106400 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic001G527200--Sobic001G537600 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic001G527200--Sobic001G068901 Sobic004G269900--Sobic002G022600 Sobic004G269900--Sobic006G098400 Sobic004G269900--Sobic002G189300 Sobic004G269900--Sobic003G037200 Sobic009G233600 Sobic009G233600 Sobic004G269900--Sobic009G233600 Sobic004G269900--Sobic001G079600 Sobic006G260600 Sobic006G260600 Sobic004G269900--Sobic006G260600 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic004G269900--Sobic002G356700 Sobic010G145200 Sobic010G145200 Sobic004G269900--Sobic010G145200 Sobic002G266250 Sobic002G266250 Sobic010G110050--Sobic002G266250 Sobic001G380100 Sobic001G380100 Sobic010G110050--Sobic001G380100 Sobic001G204400 Sobic001G204400 Sobic010G110050--Sobic001G204400 Sobic003G235601 Sobic003G235601 Sobic010G110050--Sobic003G235601 Sobic004G203600 Sobic004G203600 Sobic010G110050--Sobic004G203600 Sobic003G337900 Sobic003G337900 Sobic010G110050--Sobic003G337900 Sobic010G110050--Sobic001G403800 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic010G110050--Sobic002G280001 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic010G110050--Sobic007G031000 Sobic003G271300--Sobic002G189300 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic003G271300--Sobic001G004901 Sobic003G271300--Sobic001G403800 Sobic010G083200 Sobic010G083200 Sobic003G271300--Sobic010G083200 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic003G271300--Sobic002G189350 Sobic002G231100 Sobic002G231100 Sobic003G271300--Sobic002G231100 Sobic003G271300--Sobic001G380100 Sobic003G271300--Sobic010G110050 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic003G271300--Sobic002G375600 Sobic002G022600--Sobic004G269900 Sobic002G022600--Sobic006G098400 Sobic002G022600--Sobic002G189300 Sobic002G022600--Sobic003G047300 Sobic002G022600--Sobic001G079600 Sobic002G022600--Sobic009G233600 Sobic002G022600--Sobic010G145200 Sobic002G022600--Sobic008G127200 Sobic005G188400 Sobic005G188400 Sobic002G022600--Sobic005G188400 Sobic006G053000 Sobic006G053000 Sobic005G073500--Sobic006G053000 Sobic005G073500--Sobic003G235601 Sobic001G362800 Sobic001G362800 Sobic005G073500--Sobic001G362800 Sobic007G030900 Sobic007G030900 Sobic005G073500--Sobic007G030900 Sobic007G200200 Sobic007G200200 Sobic005G073500--Sobic007G200200 Sobic006G229600 Sobic006G229600 Sobic005G073500--Sobic006G229600 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic005G073500--Sobic001G456650 Sobic006G005000 Sobic006G005000 Sobic005G073500--Sobic006G005000 Sobic003G230300 Sobic003G230300 Sobic005G073500--Sobic003G230300 Sobic004G158000--Sobic006G005000 Sobic001G295900 Sobic001G295900 Sobic004G158000--Sobic001G295900 Sobic004G158000--Sobic002G022600 Sobic001G051500 Sobic001G051500 Sobic004G158000--Sobic001G051500 Sobic010G189800 Sobic010G189800 Sobic004G158000--Sobic010G189800 Sobic010G073300 Sobic010G073300 Sobic004G158000--Sobic010G073300 Sobic004G192700 Sobic004G192700 Sobic004G158000--Sobic004G192700 Sobic002G276700 Sobic002G276700 Sobic004G158000--Sobic002G276700 Sobic004G055800 Sobic004G055800 Sobic004G158000--Sobic004G055800
Octagon: transcription factors


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