Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G509600.1
Synonym Sb01g047570
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt A0A1B6QQP0
Pfam PF13041 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF132
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08305 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g30590.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000560
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G066800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G509600 Sobic001G509600 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic001G509600--Sobic003G005332 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic001G509600--Sobic002G187350 Sobic005G080100 Sobic005G080100 Sobic001G509600--Sobic005G080100 Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic001G509600--Sobic005G126401 Sobic007G175600 Sobic007G175600 Sobic001G509600--Sobic007G175600 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic001G509600--Sobic006G111400 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic001G509600--Sobic008G007100 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic001G509600--Sobic002G202200 Sobic004G345200 Sobic004G345200 Sobic001G509600--Sobic004G345200 Sobic003G005332--Sobic008G007100 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic003G005332--Sobic003G259000 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic003G005332--Sobic001G027400 Sobic003G005332--Sobic005G126401 Sobic003G005332--Sobic006G111400 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G005332--Sobic010G097800 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic003G005332--Sobic008G007200 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic003G005332--Sobic003G304900 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic003G005332--Sobic004G306700 Sobic002G187350--Sobic002G202200 Sobic002G187350--Sobic003G259000 Sobic002G187350--Sobic003G005332 Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic002G187350--Sobic010G113800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic002G187350--Sobic001G391000 Sobic002G187350--Sobic008G007100 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic002G187350--Sobic008G134000 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic002G187350--Sobic009G242032 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic002G187350--Sobic005G066800 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic005G080100--Sobic003G371900 Sobic010G036601 Sobic010G036601 Sobic005G080100--Sobic010G036601 Sobic005G080100--Sobic003G304900 Sobic005G080100--Sobic006G111400 Sobic005G080100--Sobic001G027400 Sobic005G080100--Sobic008G007100 Sobic005G080100--Sobic008G007200 Sobic005G080100--Sobic005G126401 Sobic005G080100--Sobic002G187350 Sobic005G126401--Sobic008G007200 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic005G126401--Sobic004G045700 Sobic005G126401--Sobic003G005332 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic005G126401--Sobic007G124800 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic005G126401--Sobic009G144050 Sobic005G126401--Sobic001G027400 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic005G126401--Sobic009G024133 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic005G126401--Sobic006G154900 Sobic005G126401--Sobic003G304900 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic007G175600--Sobic003G234300 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic007G175600--Sobic006G103800 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic007G175600--Sobic010G201444 Sobic007G175600--Sobic006G111400 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic007G175600--Sobic002G234800 Sobic002G037700 Sobic002G037700 Sobic007G175600--Sobic002G037700 Sobic004G221100 Sobic004G221100 Sobic007G175600--Sobic004G221100 Sobic007G175600--Sobic008G007100 Sobic005G083400 Sobic005G083400 Sobic007G175600--Sobic005G083400 Sobic006G111400--Sobic008G007100 Sobic006G111400--Sobic002G234800 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic006G111400--Sobic006G169600 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic009G199900 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic006G111400--Sobic003G251900 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic003G234300 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic006G111400--Sobic004G350600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G111400--Sobic004G149000 Sobic008G007100--Sobic008G007200 Sobic008G007100--Sobic006G111400 Sobic008G007100--Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic001G027400 Sobic008G007100--Sobic003G304900 Sobic008G007100--Sobic009G199900 Sobic008G007100--Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G251900 Sobic008G007100--Sobic006G169600 Sobic002G202200--Sobic005G066800 Sobic002G202200--Sobic009G242032 Sobic002G202200--Sobic007G124800 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G027400 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic002G202200--Sobic002G367850 Sobic002G202200--Sobic008G007100 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic002G202200--Sobic001G174300 Sobic002G202200--Sobic002G187350 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic004G345200--Sobic002G035100 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic004G345200--Sobic010G118600 Sobic010G068001 Sobic010G068001 Sobic004G345200--Sobic010G068001 Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic004G345200--Sobic008G151900 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic004G345200--Sobic010G118401 Sobic003G418900 Sobic003G418900 Sobic004G345200--Sobic003G418900 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic004G345200--Sobic005G116601 Sobic004G345200--Sobic007G175600 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic004G345200--Sobic004G228000
Octagon: transcription factors


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