Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G080100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQW0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G371900 ubiquitin fusion degradation protein, putative, expressed K14016: ubiquitin fusion degradation protein 1
2 Sobic.010G036601 - -
3 Sobic.003G304900 - -
4 Sobic.006G111400 nodulation receptor kinase precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
5 Sobic.001G027400 - -
6 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
7 Sobic.008G007200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.005G126401 - -
9 Sobic.002G187350 - -
10 Sobic.003G005332 - -
11 Sobic.006G103800 AGC_PVPK_like_CDK8.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
12 Sobic.008G108000 expressed protein -
13 Sobic.002G202200 - -
14 Sobic.009G242032 - -
15 Sobic.001G509600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
17 Sobic.010G201444 - -
18 Sobic.005G230700 SCARECROW, putative, expressed -
19 Sobic.006G185700 copper chaperone for superoxide dismutase, putative, expressed K04569: copper chaperone for superoxide dismutase
20 Sobic.001G506066 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G080100 Sobic005G080100 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic005G080100--Sobic003G371900 Sobic010G036601 Sobic010G036601 Sobic005G080100--Sobic010G036601 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic005G080100--Sobic003G304900 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic005G080100--Sobic006G111400 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic005G080100--Sobic001G027400 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic005G080100--Sobic008G007100 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic005G080100--Sobic008G007200 Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic005G080100--Sobic005G126401 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic005G080100--Sobic002G187350 Sobic003G371900--Sobic003G304900 Sobic003G371900--Sobic001G027400 Sobic003G371900--Sobic005G080100 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic003G371900--Sobic005G230700 Sobic003G371900--Sobic008G007100 Sobic003G371900--Sobic006G111400 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic003G371900--Sobic003G005332 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic003G371900--Sobic001G316500 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic003G371900--Sobic001G140101 Sobic010G036601--Sobic005G080100 Sobic010G036601--Sobic003G304900 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic010G036601--Sobic002G202200 Sobic010G036601--Sobic003G371900 Sobic010G036601--Sobic001G027400 Sobic010G036601--Sobic001G316500 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic010G036601--Sobic008G108000 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic010G036601--Sobic009G242032 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic010G036601--Sobic005G066800 Sobic003G304900--Sobic001G027400 Sobic003G304900--Sobic008G007200 Sobic003G304900--Sobic001G316500 Sobic003G304900--Sobic008G007100 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic003G304900--Sobic009G252600 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G304900--Sobic010G097800 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic003G304900--Sobic002G138200 Sobic003G304900--Sobic003G371900 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic003G304900--Sobic001G060200 Sobic006G111400--Sobic008G007100 Sobic002G234800 Sobic002G234800 Sobic006G111400--Sobic002G234800 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic006G111400--Sobic006G169600 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic006G111400--Sobic009G199900 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic006G111400--Sobic003G251900 Sobic007G200300 Sobic007G200300 Sobic006G111400--Sobic007G200300 Sobic003G234300 Sobic003G234300 Sobic006G111400--Sobic003G234300 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic006G111400--Sobic004G350600 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic006G111400--Sobic004G149000 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic008G007200 Sobic008G007100--Sobic006G111400 Sobic008G007100--Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic001G027400 Sobic008G007100--Sobic003G304900 Sobic008G007100--Sobic009G199900 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G251900 Sobic008G007100--Sobic006G169600 Sobic008G007200--Sobic008G007100 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic008G007200--Sobic006G154900 Sobic008G007200--Sobic003G304900 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic008G007200--Sobic001G093732 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic008G007200--Sobic010G201444 Sobic008G007200--Sobic005G126401 Sobic008G007200--Sobic009G252600 Sobic008G007200--Sobic007G124800 Sobic008G007200--Sobic001G316500 Sobic005G126401--Sobic008G007200 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic005G126401--Sobic004G045700 Sobic005G126401--Sobic003G005332 Sobic005G126401--Sobic007G124800 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic005G126401--Sobic009G144050 Sobic005G126401--Sobic001G027400 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic005G126401--Sobic009G024133 Sobic005G126401--Sobic006G154900 Sobic005G126401--Sobic003G304900 Sobic002G187350--Sobic002G202200 Sobic002G187350--Sobic003G259000 Sobic002G187350--Sobic003G005332 Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic002G187350--Sobic010G113800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic002G187350--Sobic001G391000 Sobic002G187350--Sobic008G007100 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic002G187350--Sobic008G134000 Sobic002G187350--Sobic009G242032 Sobic002G187350--Sobic005G066800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.