Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G519600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QQR8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G230800 Up-regulation in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@inhibiting the nuclear localization of BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 2(PubMedID : 28273925)@decreased the cell proliferation rates(PubMedID : 27329702)@gibberellin 2-beta-dioxygenase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
2 Sobic.010G202200 - -
3 Sobic.008G155500 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
4 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -
5 Sobic.009G061500 - -
6 Sobic.006G269101 - -
7 Sobic.006G143700 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G148600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G024400 expressed protein -
10 Sobic.001G024400 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G027601 - -
12 Sobic.004G052600 - -
13 Sobic.008G136601 - -
14 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G055200 dirigent, putative, expressed -
16 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
17 Sobic.008G071800 - -
18 Sobic.010G179600 - -
19 Sobic.005G176700 methyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.008G036100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G519600 Sobic001G519600 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic001G519600--Sobic009G230800 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic001G519600--Sobic010G202200 Sobic008G155500 Sobic008G155500 Sobic001G519600--Sobic008G155500 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic001G519600--Sobic001G340800 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic001G519600--Sobic009G061500 Sobic006G269101 Sobic006G269101 Sobic001G519600--Sobic006G269101 Sobic006G143700 Sobic006G143700 Sobic001G519600--Sobic006G143700 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic001G519600--Sobic008G148600 Sobic010G024400 Sobic010G024400 Sobic001G519600--Sobic010G024400 Sobic009G230800--Sobic010G202200 Sobic009G230800--Sobic006G269101 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic009G230800--Sobic004G052600 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic009G230800--Sobic008G136601 Sobic009G230800--Sobic001G340800 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic009G230800--Sobic004G328500 Sobic009G230800--Sobic008G148600 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic009G230800--Sobic005G000900 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic009G230800--Sobic005G221675 Sobic010G202200--Sobic009G230800 Sobic010G202200--Sobic006G269101 Sobic010G202200--Sobic008G148600 Sobic010G202200--Sobic008G136601 Sobic010G202200--Sobic001G340800 Sobic006G027601 Sobic006G027601 Sobic010G202200--Sobic006G027601 Sobic005G110424 Sobic005G110424 Sobic010G202200--Sobic005G110424 Sobic003G156900 Sobic003G156900 Sobic010G202200--Sobic003G156900 Sobic008G097966 Sobic008G097966 Sobic010G202200--Sobic008G097966 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic008G155500--Sobic008G088500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G155500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G155500--Sobic005G058000 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic008G155500--Sobic008G168500 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic008G155500--Sobic005G058200 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic008G155500--Sobic001G364300 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic008G155500--Sobic005G007200 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G155500--Sobic001G021200 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G155500--Sobic009G047900 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic001G340800--Sobic001G370400 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic001G340800--Sobic009G061601 Sobic001G340800--Sobic008G136601 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic001G340800--Sobic004G290600 Sobic001G340800--Sobic009G061500 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic001G340800--Sobic008G020800 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic001G340800--Sobic001G294500 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic001G340800--Sobic007G131000 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic001G340800--Sobic003G093100 Sobic009G061500--Sobic009G061601 Sobic009G061500--Sobic008G136601 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic009G061500--Sobic003G297100 Sobic009G061500--Sobic001G340800 Sobic009G061500--Sobic008G020800 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic009G061500--Sobic005G114201 Sobic009G061500--Sobic008G148600 Sobic009G061500--Sobic001G370400 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic009G061500--Sobic007G095333 Sobic006G269101--Sobic008G148600 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic006G269101--Sobic007G160501 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic006G269101--Sobic003G351100 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic006G269101--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic006G269101--Sobic005G214800 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic006G269101--Sobic002G194300 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic006G269101--Sobic009G110800 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic006G269101--Sobic008G125801 Sobic002G126400 Sobic002G126400 Sobic006G269101--Sobic002G126400 Sobic006G143700--Sobic008G148600 Sobic006G143700--Sobic006G269101 Sobic004G120600 Sobic004G120600 Sobic006G143700--Sobic004G120600 Sobic006G143700--Sobic002G126400 Sobic003G218100 Sobic003G218100 Sobic006G143700--Sobic003G218100 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic006G143700--Sobic001G094700 Sobic008G148600--Sobic006G269101 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic008G148600--Sobic001G232600 Sobic008G148600--Sobic008G136601 Sobic001G248700 Sobic001G248700 Sobic008G148600--Sobic001G248700 Sobic008G148600--Sobic001G094700 Sobic010G024400--Sobic010G202200 Sobic010G024400--Sobic009G230800 Sobic003G236000 Sobic003G236000 Sobic010G024400--Sobic003G236000 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic010G024400--Sobic004G064200 Sobic010G024400--Sobic001G519600 Sobic010G024400--Sobic006G269101 Sobic010G024400--Sobic008G148600 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic010G024400--Sobic005G225500 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic010G024400--Sobic001G024400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.